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共表达簇以下为：C246型

来自FANTOM5_SSTAR

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完整id:C246_嗜中性粒细胞_Eosinophils_Whole_CD114_CD14CD16_Basophils_migration



第一阶段CAGE峰值

Hg19:：chr10:11207438..11207455+p1@CELF2
Hg19:：chr10:12391685..12391734+p2@CAMK1D
Hg19:：chr11:61722670..61722712+p2@最佳1
Hg19:：chr11:65408273..65408341+第3页@SIPA1
Hg19:：chr12:51717949..51717976-p4@BIN2
Hg19:：chr12:53835508..53835533+p1@PRR13
第2页@PCBP2
Hg19:：chr13:46753825..46753846-电话：chr13:46753825..46753846
-
Hg19:：chr13:46756271..46756348-第1页@LCP1
Hg19:：chr13:50699661..50699695-第1页@DLEU2
Hg19:：chr14:93118543..93118570+第4页@RIN3
Hg19:：chr14:93155682..93155685+电话：chr14:93155682..93155685
+
Hg19:：chr15:69958901.69958913-电话：chr15:69958901..69958913
-
Hg19:：chr15:85259768..85259799+电话：chr15:85259768..85259799
+
Hg19:：chr16:69796212..69796275+p1@WWP2
Hg19:：chr17:61699766..61699826+p1@地图3K3
Hg19:：chr17:73840423..73840499-p1@UNC13D
Hg19:：chr18:74208364..74208381-电话：chr18:74208364..74208381
-
Hg19:：chr18:74844727..74844747-p2@MBP
Hg19:：chr19:1067043..1067054+第9页@HMHA1
Hg19:：chr19:14492247..14492264+第1页@CD97
Hg19:：chr19:2085323..2085357-p2@MOB3A
Hg19:：chr19:38916839..38916871-第1页@RASGRP4
Hg19:：chr1:161039597..161039625-p2@ARHGAP30
Hg19:：chr1:198608152..198608247+p1@PTPRC
Hg19:：chr1:26869597..26869637+第3页@RPS6KA1
Hg19:：chr21:30671189..30671207+p4@BACH1
Hg19:：chr22:17565841..17565896+p1@IL17RA
Hg19:：chr22:17565903..17565929+p2@IL17RA
Hg19:：chr22:37678505..37678563+第1页@CYTH4
Hg19:：chr22:51021397..51021434-第2页@CHKB-CPT1B
p2@CHKB
Hg19:：chr2:175499294..175499339-p4@在制品1
Hg19:：chr2:231084659..231084721-p1@SP110
Hg19:：chr2:32289003..32289089+p1@AB384105
Hg19:：chr3:121379739..121379771-p1@HCLS1
Hg19:：chr3:122512619..122512690-第1页@HSPBAP1
Hg19:：chr3:129158715..129158766-第2页@MBD4
Hg19:：chr4:88312301.88312375-p1@HSD17B11
Hg19:：chr5:100238920..100238949-第2页@ST8SIA4
Hg19:：chr5:100238956..100238994-p1@ST8SIA4
Hg19:：chr5:100239086..100239122+p1@AK055485
Hg19:：chr5:154238052..154238091+第2页@CNOT8
Hg19:：chr5:175085039..175085106+p1@HRH2
Hg19:：chr5:176853702..176853742+第2页@GRK6
Hg19:：chr5:95157986..95158004-第2页@GLRX
Hg19:：chr6:33266687..33266728-p1@RGL2
Hg19:：chr7:106505696..106505798+第1页@PIK3CG
Hg19:：chr7:26332645..26332661+p8@SNX10
Hg19:：chr7:36763985..36764000-第4页@AOAH
Hg19:：chr8:103251611..103251667+p2@ENST00000520820
Hg19:：chr8:67579326..67579368-第2页@VCPIP1
Hg19:：chr9:115095883..115095932-p1@PTBP3
Hg19:：chr9:95726554..95726616+第1页@FGD3
Hg19:：chrX:48542169..48542241+p1@前
Hg19:：chrX:71321022..71321043+邮政编码：71321022..71321043
+


此共表达簇上的丰富路径<b>摘要：典型路径基因集是从Reactome、Wikipathys和KEGG中编译而来的。对于主要的信号通路，转录调控基因（下游靶点）是从Netpath获得的。综合起来，典型途径和下游靶点总计489个人类基因集。利用同源基因数据库通过同源性推断出相应的小家鼠基因集。通过超几何概率评估共表达簇中包括的489个经典途径和基因集中的每一个的富集度。然后，采用Benjamini-Hochberg方法对所得P值进行调整，以进行多重比较<br><b>分析师：Emmanuel Dimont链接到源数据集数据

p.值财务总监n基因n通道姓名
0.0003226291725905250.0340373777083004三95FcγR介导的吞噬作用（KEGG）：04666
0.0001363586559315220.0215787573011634三71上皮细胞细菌侵袭（KEGG）:05100
0.0001252428076610580.0215787573011634三69IL-5信号通路（Wikipaths）：WP127
3.00804519216102e-060.001904092606637935161B细胞受体信号通路（Wikipaths）：WP23
9.08047147404293电子060.00287396922153459三29MAPK级联（Wikipaths）：WP422
0.0002569256141766280.0325267827547611217{HCLS1,17}（静态模块）：不适用



此共表达簇上的丰富基因本体术语<b>摘要：共表达簇的GOStat分析结果。使用GOStat（PMID:14962934）和默认参数对启动子映射到至少两个不同基因的每个簇进行分析<br><b>分析师：Erik Arner链接到源数据集数据

GO标识GO名称FDR校正的p值
去：0007154小区通信0.000219800609395661
去：0009966信号转导的调节0.000585506406463515
去：0007165信号转导0.00112135234340188
去：0030695GTPase调节器活性0.00139879786256928
去：0005515蛋白质结合0.00821279443007198
去：0030048肌动蛋白丝状运动0.0113800714176354
去：0030036肌动蛋白细胞骨架的组织与生物发生0.0113800714176354
去：0065007生物调节0.0113800714176354
去：0030029肌动蛋白丝状过程0.0113800714176354
去：0007242细胞内信号级联0.0113800714176354
去：0005737细胞质0.0113800714176354
去：0006464蛋白质改性工艺0.0239540251157988
GO:0043687号翻译后蛋白质修饰0.0244979746616004
GO:0043412号生物聚合物改性0.0282238563994342
去：0007010细胞骨架组织与生物发生0.0315329711302865
GO:0001726号荷叶边0.0315329711302865
GO:0001891号吞噬杯0.0315329711302865
GO:0050528号酰氧基水解酶活性0.0315329711302865
去：0002378免疫球蛋白生物合成过程0.0315329711302865
GO:0019975号白细胞介素17结合0.0315329711302865
去：0030368白细胞介素17受体活性0.0315329711302865
去：0006468蛋白氨基酸磷酸化0.0418521866255157
去：0005083小GTPase调节器活性0.0434877302590047
GO:0051056号小GTPase介导的信号转导调控0.0434877302590047
去：0008154肌动蛋白聚合和/或解聚0.0456442428978856
去：0006793磷代谢过程0.0456442428978856
去：0006796磷酸盐代谢过程0.0456442428978856
GO:0043209号髓鞘0.0456442428978856
去：0006710雄激素分解代谢过程0.0456442428978856



此共同表达集群上的丰富示例本体术语<b>摘要：</b>为了总结1000个样本中的启动子活性（TSS区域的表达谱），我们基于FANTOM5样本本体（FF本体）进行了富集分析。这里的问题是“在哪种类型的样本中启动子更活跃”。为了回答这个问题，我们使用Mann-Whitney秩和检验比较了与样本本体术语相关的样本和其余样本中的表达式（TPM）。为了总结在这个共表达集群中丰富的本体，我们对组成的所有启动子的平均表达谱进行了相同的分析<b> 分析师：Hideya Kawaji链接到源数据集单元格_数据<br>uberon_data（超级数据）<br>疾病数据<br>

单元格类型
本体术语p值n个
造血干细胞9.67电子-79168
血管母细胞间充质细胞9.67e-79页168
造血低能祖细胞1.50e-74页161
造血多能干祖细胞1.50e-74页161
造血细胞7.68e-74页177
白细胞7.30e-72日136
造血系限制性祖细胞1.36e-60120
非鳞状白细胞6.87e-59页115
髓细胞3.44e-52页108
普通髓系祖细胞3.44e-52108
髓系白细胞8.13e-47日72
粒单核祖细胞9.86电子-4267
髓系限制性祖细胞2.03e-40页66
巨噬细胞树突状细胞祖细胞2.47e-38页61
单倍体细胞1.09e-37号文件59
单核细胞1.09e-37号文件59
单成纤维细胞1.09e-37号文件59
前单核细胞1.09e-37号文件59
防御单元2.21e-34页48
吞噬细胞2.21e-34页48
经典单核细胞4.41至3142
CD14-阳性，CD16-阴性经典单核细胞4.41至3142
有核细胞7.20e-19日55
淋巴细胞1.32e-18号机组53
淋巴样祖细胞1.32e-18号机组53
淋巴系限制性祖细胞1.90至1852
间充质细胞2.22e-11日354
结缔组织细胞2.21e-10页361
T细胞4.19e-10节25
T前细胞4.19e-10节25
成熟α-βT细胞1.26e-0918
α-βT细胞1.26e-0918
未成熟T细胞1.26e-0918
成熟T细胞1.26e-0918
未成熟α-βT细胞1.26e-0918
物质积累细胞2.98e-09年87
B系淋巴细胞2008年4月47日24
祖B细胞第3.47页至第08页24
中间单核细胞2008年5月5日9
CD14-阳性，CD16-阳性单核细胞5.15e-08年9
粒细胞1.46e-07年8
B电池3.68e-07日14
CD8-阳性，α-βT细胞2007年9月9日11
优步解剖
本体术语p值n个
造血系统5.75e-48页98
血岛5.75e-48页98
溶血性软脑膜系统2.11e-43页108
骨髓1.47e-35页76
免疫系统2.58电子-3493
骨元素9.46e-31页82
骨架元素1.06e-2590
成体生物3.89e-24日114
骨骼系统1.17e-20100
侧板中胚层6.62e-13203
血8.68e-10日15
血淋巴液8.68e-10日15
生物物质8.68e-10日15
结缔组织3.44至09371
疾病
本体术语p值n个
血液肿瘤1.18e-0851
免疫系统癌症1.18e-0851
白血病3.46e-08年39
髓系白血病6.86e-07日31


此共表达簇上过度表达的TFBS（DNA）基序<b>摘要：</b>显示的值是该共表达簇中基序过度表达的p值。因此，较小的p值意味着强烈的过度代表性<b> 分析师：Michiel de Hoon链接到源数据数据<br><br>茉莉花图案<br>数据

新颖的图案



JASPAR图案

Motifs公司-log10（p值）
MA0003.1号机组4.40458
MA0004.1号机组1.12451
MA0006.1号机组0.711509
MA0007.1号机组0.433958
MA0009.1号机组0.236621
MA0014.1号3.41919
MA0017.1号0.62193
MA0019.1号0.512722
MA0024.1号机组0.50805
MA0025.1号文件0.332246
MA0027.1号机组1.70646
MA0028.1号机组2.20328
MA0029.1号机组0.181853
MA0030.1型0.998443
MA0031.1号文件0.428362
电话0038.10.426428
MA0040.1型0.185414
MA0041.1号2.124
MA0042.1号2.39906
MA0043.1号0.236833
MA0046.1号0.229332
MA0048.1号1.50961
马0050.10.236451
MA0051.1号1.12988
MA0052.1号0.550571
MA0055.1号1.21376
马0056.10
MA0057.1号1.18916
MA0058.1号1.3728
MA0059.1号0.463899
马0060.11.27527
MA0061.1号0.0532868
MA0063.1号0
MA0066.1号0.192218
MA0067.1号0.479528
MA0068.1号1.13471
马0069.10.643319
MA0070.1号0.625977
MA0071.1号0.357341
MA0072.1号0.216466
MA0073.1号8.88524
MA0074.1号1.58736
MA0076.1号1.10363
MA0077.1号0.211468
MA0078.1号0.0875216
MA0081.1号1.36575
MA0083.1号0.241697
MA0084.1号0.642191
MA0087.1号0.214876
MA0088.1号0.544796
马0089.10
MA0090.1号0.0628294
MA0091.1号机组0.258639
MA0092.1号0.396383
MA0093.1号1.32367
马0095.10
马0098.10
MA0100.1型0.452318
MA0101.1号机组0.503042
MA0103.1号0.148295
MA0105.1号0.385157
MA0106.1号0.065918
MA0107.1号0.0780368
MA0108.2号0.13665
MA0109.1号0
MA0111.1号0.898762
MA0113.1号0.252164
MA0114.1号0.827858
MA0115.1号0.41656
MA0116.1号0.643334
MA0117.1号0.262426
马0119.10.65163
MA0122.1号机组0.280745
MA0124.1号机组0.38339
MA0125.1号机组0.318799
MA0130.1号机组0
马0131.11.60341
MA0132.1号机组0
MA0133.1号机组0
MA0135.1号机组0.257383
MA0136.1号机组2.1802
MA0139.1号0.249231
MA0140.1号机组0.352775
MA0141.1号0.0461584
MA0142.1号0.121662
MA0143.1号0.0722469
MA0144.1号机组0.225073
MA0145.1号0.402364
MA0146.1号3.40008
MA0147.1号0.660855
MA0148.1号0.0298305
MA0149.1号0.0364861
MA0062.2号3.66572
MA0035.2号0.351568
MA0039.2号4.04445
MA0138.2号机组0.0880528
MA0002.2号机组0.915965
马0137.20.196936
MA0104.2号0.767436
MA0047.2号0.221346
MA0112.2号0.594057
MA0065.2号1.45423
MA0150.1号机组0.0123642
MA0151.1号0
MA0152.1号0.04095
MA0153.1号机组0.306295
MA0154.1号机组2.20435
MA0155.1号2.10385
MA0156.1号机组2.74571
MA0157.1号0.350409
MA0158.1号0
MA0159.1号机组0.295707
MA0160.1号0.135178
MA0161.1号机组0
MA0162.1号机组2.12783
MA0163.1号机组4.43749
MA0164.1号机组0.0771206
MA0080.2号4.5299
马0018.20.0664342
MA0099.2号机组0.0410516
MA0079.2号12.3567
MA0102.2号机组2.73044
马0258.10.327986
马0259.10.0942416
马0442.10



ENCODE TF ChIP-seq峰富集分析<b>摘要：</b>对于每个TF和每个共表达簇，使用Fisher精确检验将带有ENCODE TF ChIP信号的启动子数量与稳健集的其他启动子进行比较。Benjamini-Hochberg校正后，保留了ChIP显著富集（q<=0.05）的聚类<br><b>分析师：Erik Arner链接到源数据集数据

（#promoters=该共表达簇中具有TF的ChIP信号的启动子数量）

TF公司#发起人丰富p值q值
E2F1#1869211.908429139119740.001386579613364560.0090243028753151
EBF1号1879203.298691424655197.07426279704601e-07号3.16957928897764e-05号
EGR1#1958号252.309342173523211.24908008657656e-050.000308398759248156
ELF1#1997453.548414965672952.42527982603946e-20号6.28520594917456e-18号
ETS1编号2113152.702433589500650.0002603822885367630.00279113885173878
GABPB1编号2553222.879426748074221.5732290254349e-065.99221247948196e-05
GATA1#2623123.013401809733430.000472657304680220.00433853544063082
HEY1#23462292.16968926389014.86121192221296e-060.000150474247760521
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最大4149161.911868298965070.006374622351216720.0277538429105687
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共表达簇的相对表达<b>总结：</b>将共表达簇与FANTOM5样本进行比较，以获得相对表达<br><b>分析师：不适用<br><br>链接到数据源数据

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