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共表达簇以下为：C244型

来自FANTOM5_SSTAR

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完整id:C244_CD14_Monocytederived_Hepatocyte_heart_Neutrophils_acute_Macrophage



第一阶段CAGE峰值

Hg19:：chr10:81025241..81025245+电话：chr10:81025241..81025245
+
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Hg19:：chr3:122399875..122399886+第7页@第14页
Hg19:：chr3:122444648..122444658+电话：chr3:122444648..122444658
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Hg19:：chr3:15483499..15483511+电话：chr3:15483499..15483511
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+
Hg19:：chr5:55160483..55160494+电话：chr5:55160483..55160494
+
Hg19:：chr6:74410846..74410849+电话：chr6:74410846..74410849
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Hg19:：chr6:74492716..74492719+电话：chr6:74492716..74492719
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Hg19:：chr6:74512050..74512056+电话：chr6:74512050..74512056
+
Hg19:：chr7:130575788..130575792-电话：chr7:130575788..130575792
-
Hg19:：chr7:47513678..47513702+电话：chr7:47513678..47513702
+
Hg19:：chr7:47514268..47514279+电话：chr7:47514268..47514279
+
Hg19:：chr8:20094845..20094867+电话：chr8:20094845..20094867
+
Hg19:：chr8:24250424..24250429+p@chr8:24250424..24250429
+
Hg19:：chr8:62606823..62606835-电话：chr8:62606823..62606835
-
Hg19:：chr9:90343853..90343856+电话：chr9:90343853..90343856
+
Hg19:：chrX:118129290..118129323+p@chrX:1118129290..118129323
+


此共表达簇上的丰富路径<b>摘要：典型路径基因集是从Reactome、Wikipathys和KEGG中编译而来的。对于主要的信号通路，转录调控基因（下游靶点）是从Netpath获得的。综合起来，典型途径和下游靶点总计489个人类基因集。利用同源基因数据库通过同源性推断出相应的小家鼠基因集。通过超几何概率评估共表达簇中包括的489个经典途径和基因集中的每一个的富集度。然后，采用Benjamini-Hochberg方法对所得P值进行调整，以进行多重比较<br><b>分析师：Emmanuel Dimont链接到源数据集数据

此共表达无结果

此共表达簇上的丰富基因本体术语<b>摘要：共表达簇的GOStat分析结果。使用GOStat（PMID:14962934）和默认参数对启动子映射到至少两个不同基因的每个簇进行分析<br><b>分析师：Erik Arner链接到源数据集数据

GO标识GO名称FDR校正的p值
转到：0042602黄素还原酶活性0.0151883084852404
去：0004074胆绿素还原酶活性0.0151883084852404
GO:0001892号胚胎胎盘发育0.0189828707762266
GO:0019863号IgE结合0.0189828707762266
GO:0045408号白细胞介素-6生物合成过程的调控0.0220784317266505
GO:0042226号白细胞介素-6生物合成过程0.0220784317266505
去：0032635白细胞介素-6的产生0.0220784317266505
GO:0001890号胎盘发育0.0220784317266505
GO:0045444号脂肪细胞分化0.0220784317266505
GO:0016628号氧化还原酶活性，作用于CH-CH组供体，NAD或NADP作为受体0.0220784317266505
GO:0019865号免疫球蛋白结合0.0220784317266505
去：0005737细胞质0.0252768643803778
去：0006953急性期反应0.0368338048269068
GO:0016646号氧化还原酶活性，作用于供体的CH-NH基团，NAD或NADP作为受体0.0368338048269068
去：0003950NAD+ADP-核糖基转移酶活性0.0384159270903756
编号：0001701子宫内胚胎发育0.0463558843129863
GO:0016645号氧化还原酶活性，作用于CH-NH供体组0.0463558843129863



此共同表达集群上的丰富示例本体术语<b>摘要：</b>为了总结1000个样本中的启动子活性（TSS区域的表达谱），我们基于FANTOM5样本本体（FF本体）进行了富集分析。这里的问题是“在哪种类型的样本中启动子更活跃”。为了回答这个问题，我们使用Mann-Whitney秩和检验比较了与样本本体术语相关的样本和其余样本中的表达式（TPM）。为了总结在这个共表达集群中丰富的本体，我们对组成的所有启动子的平均表达谱进行了相同的分析<b> 分析师：Hideya Kawaji链接到源数据集单元格_数据<br>uberon_data（超级数据）<br><br>

单元格类型
本体术语p值n个
经典单核细胞2.30至13542
CD14-阳性，CD16-阴性经典单核细胞2.30至13542
防御单元9.49e-118号48
吞噬细胞9.49e-118号48
单倍体细胞4.45e-93页59
单核细胞4.45e-93页59
单成纤维细胞4.45e-93页59
前单核细胞4.45e-93页59
巨噬细胞树突状细胞祖细胞6.81e-90页61
髓系限制性祖细胞9.19e-83页66
粒单核祖细胞1.84e-81页67
髓系白细胞1.71e-75页72
物质积累细胞1.99e-6287
非鳞状白细胞5.98电子55115
造血系限制性祖细胞2.76电子49120
髓细胞1.15e-48页108
普通髓系祖细胞1.15e-48页108
白细胞1.25e-45136
造血干细胞7.17e-36页168
血管母细胞间充质细胞7.17e-36页168
造血低能祖细胞2.54e-35161
造血多能干祖细胞2.54e-35161
造血细胞9.33e-34页177
间充质细胞6.99e-14年354
结缔组织细胞1.71e-13页361
运动细胞4.04e-12页386
多命运干细胞1.94e-10号机组427
成体干细胞3.31e-10433
干细胞6.61e-10441
优步解剖
本体术语p值n个
骨髓2.81e-7176
骨元素1.03e-65页82
骨架元素1.97e-5990
造血系统8.96e-58页98
血岛8.96e-58页98
免疫系统2.37e-57页93
骨骼系统5.61e-53页100
溶血性软脑膜系统6.09电子52108
肌肉骨骼系统1.61e-29167
侧板中胚层5.33e-25页203
中胚层5.59e-14页315
中胚层衍生结构5.59e-14页315
假定中胚层5.59e-14页315
结缔组织5.82e-13条371


此共表达簇上过度表达的TFBS（DNA）基序<b>摘要：</b>显示的值是该共表达簇中基序过度表达的p值。因此，较小的p值意味着强烈的过度代表性<b> 分析师：Michiel de Hoon链接到源数据数据<br><br>茉莉花图案<br>数据

新颖的图案



JASPAR图案

Motifs公司-log10（p值）
MA0003.1号机组1.93026e-09
MA0004.1号机组1.09542
MA0006.1号机组0.284086
MA0007.1号机组0.218714
MA0009.1号机组1.89774
MA0014.1号1992年9月9日-06日
MA0017.1号0.100529
MA0019.1号0.49919
MA0024.1号机组0.166016
MA0025.1号文件0.326531
MA0027.1号机组1.69857
MA0028.1号机组0.0803158
MA0029.1号机组0.177433
MA0030.1型0.170622
MA0031.1号文件0.134441
电话0038.10.0493765
MA0040.1型0.180954
MA0041.1号0.112944
MA0042.1号1.03598
MA0043.1号0.231848
MA0046.1号0.224416
MA0048.1号0.00191219
马0050.11.03988
MA0051.1号0.406356
MA0052.1号0.183297
MA0055.1号6.84479e-05号
马0056.10
MA0057.1号0.0127133
MA0058.1号0.259805
MA0059.1号0.124055
马0060.10.000350333
MA0061.1号0.00658749
MA0063.1号0
MA0066.1号0.18562
MA0067.1号0.473069
MA0068.1号0.672849
马0069.10.221881
MA0070.1号0.61459
MA0071.1号0.623423
MA0072.1号0.211675
MA0073.1号4.38676
MA0074.1号0.180446
MA0076.1号0.0521825
MA0077.1号0.206727
MA0078.1号1.49866
MA0081.1号0.0442917
MA0083.1号0.236667
MA0084.1号0.635217
MA0087.1号0.603971
MA0088.1号0.00146476
马0089.10
MA0090.1号0.318978
MA0091.1号机组1.10714
MA0092.1号0.0764316
MA0093.1号0.970565
马0095.10
马0098.10
MA0100.1型0.439549
MA0101.1号机组0.00403286
MA0103.1号0.262976
MA0105.1号0.0190813
MA0106.1号0.0633877
MA0107.1号0.0728099
MA0108.2号0.132819
MA0109.1号0
MA0111.1号0.175655
MA0113.1号0.244544
MA0114.1号0.140124
MA0115.1号0.410377
MA0116.1号0.00832495
MA0117.1号0.257218
马0119.10.0374928
MA0122.1号机组0.275391
MA0124.1号机组0.377376
MA0125.1号机组0.841458
MA0130.1号机组0
马0131.10.0923922
MA0132.1号机组0
MA0133.1号机组0
MA0135.1号机组0.252217
MA0136.1号机组0.0516336
MA0139.1号0.00486906
MA0140.1号机组0.147406
MA0141.1号0.122253
MA0142.1号0.756679
MA0143.1号0.244737
MA0144.1号机组0.509186
MA0145.1号0.000216889
MA0146.1号0.000266726
MA0147.1号0.160617
MA0148.1号0.117777
MA0149.1号0.139176
MA0062.2号0.0182116
MA0035.2号0.146798
MA0039.2号2012年7月17日-06日
MA0138.2号机组0.085046
MA0002.2号机组0.212375
马0137.21.08271
MA0104.2号0.144377
MA0047.2号3.52821
MA0112.2号0.0228832
MA0065.2号0.0315229
MA0150.1号机组0.792279
MA0151.1号0
MA0152.1号0.352609
MA0153.1号机组0.813475
MA0154.1号机组0.00758814
MA0155.1号0.00374263
MA0156.1号机组0.0876463
MA0157.1号0.696111
MA0158.1号0
MA0159.1号机组0.0802588
MA0160.1号0.306739
MA0161.1号机组0
MA0162.1号机组1.5748e-05号
MA0163.1号机组0.00039778
MA0164.1号机组0.0743389
MA0080.2号0.157839
马0018.20.228368
MA0099.2号机组0.634771
MA0079.2号0
MA0102.2号机组0.668584
马0258.10.190476
马0259.10.175745
马0442.10



ENCODE TF ChIP-seq峰富集分析<b>摘要：</b>对于每个TF和每个共表达簇，使用Fisher精确检验将带有ENCODE TF ChIP信号的启动子数量与稳健集的其他启动子进行比较。Benjamini-Hochberg校正后，保留了ChIP显著富集（q<=0.05）的聚类<br><b>分析师：Erik Arner链接到源数据集数据

（#promoters=该共表达簇中具有TF的ChIP信号的启动子数量）

TF公司#发起人丰富p值q值
FOSL1#806153.610325428761180.01239412647262730.0448722631356719
STAT2#677344.746456086286590.01009488904461830.03780479478381



共表达簇的相对表达<b>总结：</b>将共表达簇与FANTOM5样本进行比较，以获得相对表达<br><b>分析师：不适用<br><br>链接到数据源数据

检索自“http://f5-webapp4.gsc.riken.jp/resource_browser/index.php？title=Coexpression_cluster:C244&oldid=3067362"