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共表达簇以下为：第240页

来自FANTOM5_SSTAR

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完整id:C240_Adipocyte_Prepaipocyte_Osteblaste_Chondrocyte_tenocyte_Synoviocyte_meshenchymal



第一阶段CAGE峰值

Hg19:：chr13:114567443..114567462-第11页@GAS6
Hg19:：chr14:23080048..23080060+第3页@ABHD4
Hg19:：chr15:68643106.68643126-第4页@ITGA11
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Hg19:：chr19:18899991..18900007-电话：chr19:18899991..18900007
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Hg19:：chr19:18900020..18900058-p@chr19:18900020..18900058
-
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+
Hg19:：chr19:1890083..18900109-p@chr19:18900083..18900109
-
Hg19:：chr19:18900774..18900802-电话：chr19:18900774..18900802
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Hg19:：chr19:18900805..18900820-电话：chr19:18900805..18900820
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Hg19:：chr19:18900836..18900848-电话：chr19:18900836..18900848
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Hg19:：chr19:18900850..18900868-电话：chr19:18900850..18900868
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Hg19:：chr19:18900893..18900901-电话：chr19:18900893..18900901
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Hg19:：chr19:18900904..18900922-电话：chr19:18900904..18900922
-
Hg19:：chr19:18901737..18901749-p7@压缩机
Hg19:：chr22:31501005..31501034-电话：chr22:31501005..31501034
-


此共表达簇上的丰富路径<b>摘要：典型路径基因集是从Reactome、Wikipathys和KEGG中编译而来的。对于主要的信号通路，转录调控基因（下游靶点）是从Netpath获得的。综合起来，典型途径和下游靶点总计489个人类基因集。利用同源基因数据库通过同源性推断出相应的小家鼠基因集。通过超几何概率评估共表达簇中包括的489个经典途径和基因集中的每一个的富集度。然后，采用Benjamini-Hochberg方法对所得P值进行调整，以进行多重比较<br><b>分析师：Emmanuel Dimont链接到源数据集数据

p.值财务总监n基因n通道姓名
0.0002903581890930110.0459491834239692200焦点粘附（KEGG）:04510
5.23707650350948e-05号0.0288361706736934285ECM-受体相互作用（KEGG）:04512
0.0002566225776512870.0459491834239692188焦点粘附（Wikipaths）：WP306
9.1109543992712e-05号0.0288361706736934三816TGFβ受体上调靶点（Netpath）：Netpath_7



此共表达簇上的丰富基因本体术语<b>摘要：共表达簇的GOStat分析结果。使用GOStat（PMID:14962934）和默认参数对启动子映射到至少两个不同基因的每个簇进行分析<br><b>分析师：Erik Arner链接到源数据集数据

GO标识GO名称FDR校正的p值
去：0005509钙离子结合0.0232138068983212
GO:0048856号解剖结构发育0.0268361558672058
去：0006929基底结合细胞迁移0.0268361558672058
去：0005518胶原蛋白结合0.0424718208543621
去：0032502发展过程0.049126762771572
转到：0022610生物粘附0.049126762771572
GO:0007155号细胞粘附0.049126762771572
去：0009653解剖结构形态发生0.049126762771572
去：0008305整合素复合物0.049126762771572
GO:0048513号器官发育0.049126762771572



此共同表达集群上的丰富示例本体术语<b>摘要：</b>为了总结1000个样本中的启动子活性（TSS区域的表达谱），我们基于FANTOM5样本本体（FF本体）进行了富集分析。这里的问题是“在哪种类型的样本中启动子更活跃”。为了回答这个问题，我们使用Mann-Whitney秩和检验比较了与样本本体术语相关的样本和其余样本中的表达式（TPM）。为了总结在这个共表达集群中丰富的本体，我们对组成的所有启动子的平均表达谱进行了相同的分析<b> 分析师：Hideya Kawaji链接到源数据集单元格_数据<br>uberon_data（超级数据）<br><br>

单元格类型
本体术语p值n个
脂肪细胞4.49e-36页15
GAG分泌细胞8.22e-30页9
碳水化合物分泌细胞8.22e-30页9
胶原蛋白分泌细胞2.61e-23页6
成软骨细胞2.61e-23页6
软骨细胞2.61e-23页6
前脂肪细胞1.21e-2212
乳房前脂肪细胞2.06e-18日三
基质细胞2.23e-18日28
网膜组织脂肪细胞2.91e-18三
纤维细胞7.71e-18号文件三
附着细胞7.71e-18号文件三
肌腱细胞7.71e-18号文件三
细胞外基质分泌细胞1.50e-1715
网膜前脂肪细胞2.02e-17年三
乳房脂肪细胞5.24e-13号2
成纤维细胞1.5平方英寸-1176
间充质细胞4.28e-11段354
结缔组织细胞9.33e-11日361
运动细胞1.46e-09年386
滑膜细胞1.66e-08年三
皮下脂肪细胞2.51e-08三
多命运干细胞4.25e-08年427
成体干细胞6.77e-08年433
干细胞2007年1月24日441
肾周前脂肪细胞4.25e-07日1
肾周脂肪细胞4.51e-07号1
支持细胞5.58e-07号8
分泌细胞8.52e-07日36
优步解剖
本体术语p值n个
网膜6.95e-34号6
腹膜6.95e-34英寸6
腹腔6.95e-34号6
内脏腹膜6.95e-34号6
空腔衬砌2.94e-29英寸12
浆膜2.94e-2912
致密规则结缔组织7.71e-18号文件三
肌腱7.71e-18号文件三
规则结缔组织7.71e-18号文件三
乳房1.03e-14号机组10
脂肪组织1.06e-13号文件14
胸部2.37e-13号11
肾周脂肪1.67e-12页2
结缔组织3.00e-11日371
复层鳞状上皮1.66电子-08三
滑膜组织层1.66e-08年三
滑膜关节1.66e-08年三
滑膜关节滑膜1.66e-08年三
皮下脂肪组织2.51e-08三
二尖瓣8.49e-07日1


此共表达簇上过度表达的TFBS（DNA）基序<b>摘要：</b>显示的值是该共表达簇中基序过度表达的p值。因此，较小的p值意味着强烈的过度代表性<b> 分析师：Michiel de Hoon链接到源数据数据<br><br>茉莉花图案<br>数据

新颖的图案



JASPAR图案

Motifs公司-log10（p值）
MA0003.1号机组6.72665
MA0004.1号机组0.0206186
MA0006.1号机组1.5208
MA0007.1号机组0.958891
MA0009.1号机组0.222068
MA0014.1号1.70951
MA0017.1号2.7124
MA0019.1号0.473319
MA0024.1号机组0.157836
MA0025.1号文件0.315513
MA0027.1号机组1.68322
MA0028.1号机组0.160181
MA0029.1号机组0.504821
MA0030.1型0.946735
MA0031.1号文件0.796801
电话0038.10.390349
MA0040.1型0.17242
MA0041.1号0.0242142
MA0042.1号0.0821999
MA0043.1号0.222275
MA0046.1号0.214982
MA0048.1号0.564781
马0050.10.0183996
MA0051.1号0.0440688
MA0052.1号0.17471
MA0055.1号0.229886
马0056.10
MA0057.1号1.24088
MA0058.1号0.00757512
MA0059.1号0.112128
马0060.10.00227143
MA0061.1号0.904322
MA0063.1号0
MA0066.1号4.51523
MA0067.1号1.16495
MA0068.1号0.994852
马0069.10.212494
MA0070.1号0.205336
MA0071.1号0.589458
MA0072.1号0.202487
MA0073.1号21.6942
MA0074.1号0.16816
MA0076.1号0.129579
MA0077.1号0.197639
MA0078.1号3.96785
MA0081.1号0.41442
MA0083.1号0.227008
MA0084.1号0.621693
MA0087.1号0.200944
MA0088.1号4.25485
马0089.10
MA0090.1号0.767429
MA0091.1号机组0.0926003
MA0092.1号0.889337
MA0093.1号0.0194276
马0095.10
马0098.10
MA0100.1型15.3414
MA0101.1号机组0.272814
MA0103.1号0.395962
MA0105.1号1.06172
MA0106.1号0.0586346
MA0107.1号0.373767
MA0108.2号0.125525
MA0109.1号0
MA0111.1号0.321779
MA0113.1号0.230055
MA0114.1号3.07982
MA0115.1号0.398428
MA0116.1号5.17343
MA0117.1号0.247205
马0119.10.585824
MA0122.1号机组0.26509
MA0124.1号机组0.365763
MA0125.1号机组0.302328
MA0130.1号机组0
马0131.10.08643
MA0132.1号机组0
MA0133.1号机组0
MA0135.1号机组0.242288
MA0136.1号机组0.0474597
MA0139.1号2.14731
MA0140.1号机组0.136469
MA0141.1号2.02396
MA0142.1号0.111215
MA0143.1号0.0645373
MA0144.1号机组0.103225
MA0145.1号0.235354
MA0146.1号1.38216
MA0147.1号0.0270302
MA0148.1号0.108219
MA0149.1号0.0315445
MA0062.2号0.000103797
MA0035.2号0.0337499
MA0039.2号8.79037
MA0138.2号机组1.44779
MA0002.2号机组0.806291
马0137.20.00432827
MA0104.2号0.126247
MA0047.2号0.443145
MA0112.2号0.614055
MA0065.2号7.76331
MA0150.1号机组0.0101119
MA0151.1号0
MA0152.1号0.0356056
MA0153.1号机组0.29008
MA0154.1号机组3.15625
MA0155.1号2.62602
MA0156.1号机组0.00447233
MA0157.1号0.666202
MA0158.1号0
MA0159.1号机组0.586167
MA0160.1号2.13931
MA0161.1号机组0
MA0162.1号机组1.61654
MA0163.1号机组13.3846
MA0164.1号机组0.0690971
MA0080.2号0.0619771
马0018.20.0591151
MA0099.2号机组0.0356983
MA0079.2号16.226
MA0102.2号机组0.6549
马0258.11.63912
马0259.10.42884
马0442.10



ENCODE TF ChIP-seq峰富集分析<b>摘要：</b>对于每个TF和每个共表达簇，使用Fisher精确检验将带有ENCODE TF ChIP信号的启动子数量与稳健集的其他启动子进行比较。Benjamini-Hochberg校正后，保留了ChIP显著富集（q<=0.05）的聚类<br><b>分析师：Erik Arner链接到源数据集数据

（#promoters=该共表达簇中具有TF的ChIP信号的启动子数量）

TF公司#发起人丰富p值q值
南奥#7992363.078397734843440.01305121351582760.0463025914932916
苏Z12#235121210.55069071811851.20506169961436e-091.10109745272112e-07号



共表达簇的相对表达<b>总结：</b>将共表达簇与FANTOM5样本进行比较，以获得相对表达<br><b>分析师：不适用<br><br>链接到数据源数据

检索自“http://f5-webapp4.gsc.riken.jp/resource_browser/index.php？title=Coexpression_cluster:C240&oldid=3067358"