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共表达簇以下为：C239型

来自FANTOM5_SSTAR

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完整id:C239_CD4_lymphangiectasia_CD8_NK_mycosis_Renal_hairt



第一阶段CAGE峰值

Hg19:：chr11:133815219..133815230-电话：chr11:133815219..133815230
-
Hg19:：chr11:133815282..133815297-电话：chr11:133815282..133815297
-
Hg19:：chr11:67207655..67207691-第2页@CORO1B
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Hg19:：chr13:113840599..113840624-第5页@PCID2
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-
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+
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-
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-
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-
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-
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+
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-
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+
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+
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-
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-
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+
Hg19:：chr19:14143101..14143121+电话：chr19:14143101..14143121
+
Hg19:：chr19:30205532..30205579-p@chr19:30205532.30205579
-
Hg19:：chr19:41808608..41808626+第33页@HNRNPUL1
Hg19:：chr19:41808637..41808666+第25页@HNRNPUL1
Hg19:：chr22:39493207..39493223+APOBEC3H时p3
Hg19:：chr22:39493235..39493261+p2@APOBEC3H
Hg19:：chr22:39493268..39493317+p1@亚太经合组织3H
Hg19:：chr22:50908325..50908344-电话：chr22:50908325..50908344
-
Hg19:：chr22:509083348..50908373-电话：chr22:509083348..509088373
-
Hg19:：chr2:26017511..26017565-电话：chr2:26017511..26017565
-
Hg19:：chr3:150920950..150920962-第2页@GPR171
Hg19:：chr3:150920988..150921009-第1页@GPR171
Hg19:：chr3:151961403..151961428+p7@最小干细胞数1
Hg19:：chr3:48520793..48520806-第20页@SHISA5
Hg19:：chr3:48520822..48520833-第17页@SHISA5
Hg19:：chr3:48520846..48520874-第12页@SHISA5
Hg19:：chr3:48520879..48520892-第18页@SHISA5
Hg19:：chr4:90228185.90228196-电话：chr4:90228185..90228196
-
Hg19:：chr7:150691829..150691867+电话：chr7:150691829..150691867
+
Hg19:：chr8:8777580..877590+电话：chr8:8777580..877590
+
Hg19:：chr8:8777601..8777633+电话：chr8:8777601..8777633
+
Hg19:：chr9:132631644..132631655+电话：chr9:132631644..132631655
+
Hg19:：chr9:139001620..139001639+电话：chr9:139001620..139001639
+
Hg19:：chr9:139001642..139001662+电话：chr9:139001642..139001662
+
Hg19:：chr9:139869497..139869510+第12页@PTGDS
Hg19:：chr9:139869524.139869539+第7页@PTGDS
Hg19:：chr9:34647078..34647100+p4@镀锌


此共表达簇上的丰富路径<b>摘要：典型路径基因集是从Reactome、Wikipathys和KEGG中编译而来的。对于主要的信号通路，转录调控基因（下游靶点）是从Netpath获得的。综合起来，典型途径和下游靶点总计489个人类基因集。利用同源基因数据库通过同源性推断出相应的小家鼠基因集。通过超几何概率评估共表达簇中包括的489个经典途径和基因集中的每一个的富集度。然后，采用Benjamini-Hochberg方法对所得P值进行调整，以进行多重比较<br><b>分析师：Emmanuel Dimont链接到源数据集数据

此共表达无结果

此共表达簇上的丰富基因本体术语<b>摘要：共表达簇的GOStat分析结果。使用GOStat（PMID:14962934）和默认参数对启动子映射到至少两个不同基因的每个簇进行分析<br><b>分析师：Erik Arner链接到源数据集数据

GO标识GO名称FDR校正的p值
GO:0022410号昼夜睡眠/觉醒周期过程0.0164252914164606
GO:0045187号睡眠昼夜节律的调节0.0164252914164606
GO:0042749号昼夜睡眠/觉醒周期的调节0.0164252914164606
去：0050802昼夜睡眠/觉醒周期，睡眠0.0164252914164606
去：0004667前列腺素-D合酶活性0.0197039680044342
GO:0042745号昼夜睡眠/觉醒周期0.0197039680044342
GO:0048512号昼夜行为0.0197039680044342
去：0008108UDP-葡萄糖：己糖-1-磷酸尿苷酰转移酶活性0.0197039680044342
GO:0042752号昼夜节律的调节0.0197039680044342
转到：0007622有节奏的行为0.0197039680044342
GO:0030431号睡觉0.0298448315359082
GO:0001948号糖蛋白结合0.032824000262067
GO:0046457号前列腺素生物合成过程0.0468610756854441
GO:0001516号前列腺素生物合成过程0.0468610756854441
转到：0022610生物粘附0.0475287231674542
GO:0007155号细胞粘附0.0475287231674542



此共同表达集群上的丰富示例本体术语<b>摘要：</b>为了总结1000个样本中的启动子活性（TSS区域的表达谱），我们基于FANTOM5样本本体（FF本体）进行了富集分析。这里的问题是“在哪种类型的样本中启动子更活跃”。为了回答这个问题，我们使用Mann-Whitney秩和检验比较了与样本本体术语相关的样本和其余样本中的表达式（TPM）。为了总结在这个共表达集群中丰富的本体，我们对组成的所有启动子的平均表达谱进行了相同的分析<b> 分析师：Hideya Kawaji链接到源数据集单元格_数据<br>uberon_data（超级数据）<br><br>

单元格类型
本体术语p值n个
成熟α-βT细胞8.12e-45日18
α-βT细胞8.12e-45日18
未成熟T细胞8.12e-45日18
成熟T细胞8.12e-45日18
未成熟α-βT细胞8.12e-45日18
T细胞8.11e-42年25
T前细胞8.11e-42页25
淋巴系限制性祖细胞4.10e-34段52
淋巴细胞2.61e-33页53
淋巴样祖细胞2.61e-33页53
有核细胞8.66电子3255
CD8-阳性，α-βT细胞2.40至2811
白细胞8.95e-18页136
非鳞状白细胞1.60e-17115
CD4阳性，α-βT细胞9.58e-16页6
造血系限制性祖细胞5.18e-13条120
造血干细胞1.73e-12条168
血管母细胞间充质细胞1.73e-12条168
造血细胞2.32e-11号机组177
造血低能祖细胞9.49电子11161
造血多能干祖细胞9点49分-11秒161
原始T细胞2009年6月46日三
自然杀伤细胞8月18日至09日三
亲NK细胞8月18日至09日三
单核细胞3.17e-08年三
单核细胞3.17e-08年三
嗜碱性粒细胞2008年4月49日三
优步解剖
本体术语p值n个
血1.41e-1815
血淋巴液1.41e-1815
生物物质1.41e-1815
造血器官3.72e-12条7
免疫器官3.72e-12条7
胸腺2.21e-10页4
溶血性软脑膜系统腺体2.21e-10页4
胸腺区2.21e-10页4
咽腺2.21e-10页4
胸腺原基2.21e-10页4
咽上皮6.54e-07号6


此共表达簇上过度表达的TFBS（DNA）基序<b>摘要：</b>显示的值是该共表达簇中基序过度表达的p值。因此，较小的p值意味着强烈的过度代表性<b> 分析师：Michiel de Hoon链接到源数据数据<br><br>茉莉花图案<br>数据

新颖的图案



JASPAR图案

Motifs公司-log10（p值）
MA0003.1号机组0.0404189
MA0004.1号机组0.0206186
MA0006.1号机组0.425117
MA0007.1号机组0.0789137
MA0009.1号机组0.222068
MA0014.1号0.0285067
MA0017.1号0.351449
MA0019.1号0.216967
MA0024.1号机组0.157836
MA0025.1号文件0.315513
MA0027.1号机组1.68322
MA0028.1号机组0.0713574
MA0029.1号机组0.16898
MA0030.1型0.16233
MA0031.1号文件0.1271
电话0038.10.0453214
MA0040.1型0.98812
MA0041.1号0.10363
MA0042.1号0.402991
MA0043.1号0.222275
MA0046.1号1.15685
MA0048.1号0.428062
马0050.11.78652
MA0051.1号1.0541
MA0052.1号0.17471
MA0055.1号0.0835973
马0056.10
MA0057.1号0.51881
MA0058.1号0.0397438
MA0059.1号0.00745523
马0060.10.000270366
MA0061.1号0.695896
MA0063.1号0
MA0066.1号0.173138
MA0067.1号0.460571
MA0068.1号0.321704
马0069.10.212494
MA0070.1号0.592644
MA0071.1号0.589458
MA0072.1号0.202487
MA0073.1号6.93842
MA0074.1号0.381591
MA0076.1号0.267221
MA0077.1号0.197639
MA0078.1号0.271002
MA0081.1号0.41442
MA0083.1号0.643872
MA0084.1号0.621693
MA0087.1号0.200944
MA0088.1号0.179385
马0089.10
MA0090.1号0.767429
MA0091.1号机组3.47637
MA0092.1号0.355672
MA0093.1号0.00322942
马0095.10
马0098.10
MA0100.1型0.185831
MA0101.1号机组0.663892
MA0103.1号1.12543
MA0105.1号0.149865
MA0106.1号3.51804
MA0107.1号1.01315
MA0108.2号0.125525
MA0109.1号0
MA0111.1号1.96016
MA0113.1号0.0644728
MA0114.1号1.25314
MA0115.1号0.398428
MA0116.1号0.566741
MA0117.1号0.690984
马0119.11.90382
MA0122.1号机组0.26509
MA0124.1号机组0.365763
MA0125.1号机组0.302328
MA0130.1号机组0
马0131.10.291964
MA0132.1号机组0
MA0133.1号机组0
MA0135.1号机组0.242288
MA0136.1号机组1.54842
MA0139.1号0.0126515
MA0140.1号机组0.582599
MA0141.1号0.409287
MA0142.1号0.111215
MA0143.1号0.0645373
MA0144.1号机组0.654133
MA0145.1号0.68656
MA0146.1号0.0362348
MA0147.1号0.00736283
MA0148.1号0.0255324
MA0149.1号1.27206
MA0062.2号0.486452
MA0035.2号0.0337499
MA0039.2号0.606232
MA0138.2号机组0.0793656
MA0002.2号机组0.605809
马0137.20.169735
MA0104.2号0.00223039
MA0047.2号0.200722
MA0112.2号0.20225
MA0065.2号0.448805
MA0150.1号机组0.283418
MA0151.1号0
MA0152.1号0.0356056
MA0153.1号机组0.29008
MA0154.1号机组0.404382
MA0155.1号0.837437
MA0156.1号机组1.3553
MA0157.1号0.0983533
MA0158.1号0
MA0159.1号机组1.06763
MA0160.1号0.842542
MA0161.1号机组0
MA0162.1号机组0.0189675
MA0163.1号机组2.02331
MA0164.1号机组0.243379
MA0080.2号2.76701
马0018.20.0591151
MA0099.2号机组0.942513
MA0079.2号0.0168689
MA0102.2号机组0.6549
马0258.10.423604
马0259.10.156825
马0442.10



ENCODE TF ChIP-seq峰富集分析<b>摘要：</b>对于每个TF和每个共表达簇，使用Fisher精确检验将带有ENCODE TF ChIP信号的启动子数量与稳健集的其他启动子进行比较。Benjamini-Hochberg校正后，保留了ChIP显著富集（q<=0.05）的聚类<br><b>分析师：Erik Arner链接到源数据集数据

（#promoters=该共表达簇中具有TF的ChIP信号的启动子数量）

TF公司#发起人丰富p值q值
BATF#1053872.991308992037290.008586504343841030.0327131626296434
BCL11A#53335104.977097386597732.78366640123425e-05号0.000588389668647042
EBF1号1879162.500060869212350.0003962662416706530.00387433533175822
EGR1#1958号191.662726364936710.01292238757581010.046457873873667
MEF2A#4205103.288286124498960.00079864233137431190.00616887851833463
TCF12号6938122.238834716249770.006045714118167830.0270897690401291



共表达簇的相对表达<b>总结：</b>将共表达簇与FANTOM5样本进行比较，以获得相对表达<br><b>分析师：不适用<br><br>链接到数据源数据

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