完整id:C237_acute_breast_testicular_hepatoblastoma_chronic_argyrophil_Bronchial
第一阶段CAGE峰值
此共表达簇上的丰富路径<b>摘要：典型路径基因集是从Reactome、Wikipathys和KEGG中编译而来的。对于主要的信号通路，转录调控基因（下游靶点）是从Netpath获得的。综合起来，典型途径和下游靶点总计489个人类基因集。利用同源基因数据库通过同源性推断出相应的小家鼠基因集。通过超几何概率评估共表达簇中包括的489个经典途径和基因集中的每一个的富集度。然后，采用Benjamini-Hochberg方法对所得P值进行调整，以进行多重比较<br><b>分析师：Emmanuel Dimont链接到源数据集数据
此共表达无结果
此共表达簇上的丰富基因本体术语<b>摘要：共表达簇的GOStat分析结果。使用GOStat（PMID:14962934）和默认参数对启动子映射到至少两个不同基因的每个簇进行分析<br><b>分析师：Erik Arner链接到源数据集数据
此共同表达集群上的丰富示例本体术语<b>摘要：</b>为了总结1000个样本中的启动子活性（TSS区域的表达谱），我们基于FANTOM5样本本体（FF本体）进行了富集分析。这里的问题是“在哪种类型的样本中启动子更活跃”。为了回答这个问题，我们使用Mann-Whitney秩和检验比较了与样本本体术语相关的样本和其余样本中的表达式（TPM）。为了总结在这个共表达集群中丰富的本体，我们对组成的所有启动子的平均表达谱进行了相同的分析<b> 分析师：Hideya Kawaji链接到源数据集单元格_数据<br><br>疾病数据<br>
此共表达簇上过度表达的TFBS（DNA）基序<b>摘要：</b>显示的值是该共表达簇中基序过度表达的p值。因此，较小的p值意味着强烈的过度代表性<b> 分析师：Michiel de Hoon链接到源数据数据<br><br>茉莉花图案<br>数据
新颖的图案
JASPAR图案
| Motifs公司 | -log10（p值） |
|---|
| MA0003.1号机组 | 8.14184e-06日 |
| MA0004.1号机组 | 0.419347 |
| MA0006.1号机组 | 0.24686 |
| MA0007.1号机组 | 0.0752445 |
| MA0009.1号机组 | 0.621427 |
| MA0014.1号 | 0.000661716 |
| MA0017.1号 | 0.186708 |
| MA0019.1号 | 0.210287 |
| MA0024.1号机组 | 0.911787 |
| MA0025.1号文件 | 0.834774 |
| MA0027.1号机组 | 1.67575 |
| MA0028.1号机组 | 0.0214147 |
| MA0029.1号机组 | 0.494881 |
| MA0030.1型 | 0.478645 |
| MA0031.1号文件 | 0.123603 |
| 电话0038.1 | 0.0434269 |
| MA0040.1型 | 0.168336 |
| MA0041.1号 | 1.09423 |
| MA0042.1号 | 2.20415 |
| MA0043.1号 | 0.621911 |
| MA0046.1号 | 0.210453 |
| MA0048.1号 | 0.00392665 |
| 马0050.1 | 0.0173802 |
| MA0051.1号 | 0.163028 |
| MA0052.1号 | 0.980702 |
| MA0055.1号 | 0.00217488 |
| 马0056.1 | 0 |
| MA0057.1号 | 0.488537 |
| MA0058.1号 | 0.00705038 |
| MA0059.1号 | 0.106593 |
| 马0060.1 | 0.00202577 |
| MA0061.1号 | 0.00469439 |
| MA0063.1号 | 0 |
| MA0066.1号 | 1.04748 |
| MA0067.1号 | 0.454522 |
| MA0068.1号 | 0.427181 |
| 马0069.1 | 0.598958 |
| MA0070.1号 | 1.10196 |
| MA0071.1号 | 1.30007 |
| MA0072.1号 | 1.09087 |
| MA0073.1号 | 19.853 |
| MA0074.1号 | 0.0419937 |
| MA0076.1号 | 0.123514 |
| MA0077.1号 | 0.563808 |
| MA0078.1号 | 1.95487 |
| MA0081.1号 | 0.106747 |
| MA0083.1号 | 0.222368 |
| MA0084.1号 | 0.615132 |
| MA0087.1号 | 0.196553 |
| MA0088.1号 | 0.0057715 |
| 马0089.1 | 0 |
| MA0090.1号 | 1.81511 |
| MA0091.1号机组 | 0.0885368 |
| MA0092.1号 | 0.173301 |
| MA0093.1号 | 0.253397 |
| 马0095.1 | 0 |
| 马0098.1 | 0 |
| MA0100.1型 | 0.17969 |
| MA0101.1号机组 | 0.260582 |
| MA0103.1号 | 0.05035 |
| MA0105.1号 | 0.00542693 |
| MA0106.1号 | 0.0564023 |
| MA0107.1号 | 0.123818 |
| MA0108.2号 | 1.83828 |
| MA0109.1号 | 0 |
| MA0111.1号 | 0.309835 |
| MA0113.1号 | 0.48475 |
| MA0114.1号 | 0.210103 |
| MA0115.1号 | 0.392652 |
| MA0116.1号 | 1.00165 |
| MA0117.1号 | 0.242391 |
| 马0119.1 | 0.199194 |
| MA0122.1号机组 | 0.260132 |
| MA0124.1号机组 | 0.94614 |
| MA0125.1号机组 | 0.805219 |
| MA0130.1号机组 | 0 |
| 马0131.1 | 0.284188 |
| MA0132.1号机组 | 0 |
| MA0133.1号机组 | 0 |
| MA0135.1号机组 | 0.66845 |
| MA0136.1号机组 | 0.694143 |
| MA0139.1号 | 0.979874 |
| MA0140.1号机组 | 0.566465 |
| MA0141.1号 | 0.104955 |
| MA0142.1号 | 0.107962 |
| MA0143.1号 | 0.223349 |
| MA0144.1号机组 | 0.178459 |
| MA0145.1号 | 0.0624862 |
| MA0146.1号 | 0.00010684 |
| MA0147.1号 | 0.134537 |
| MA0148.1号 | 0.103741 |
| MA0149.1号 | 2.17444 |
| MA0062.2号 | 0.0134134 |
| MA0035.2号 | 0.564674 |
| MA0039.2号 | 7.74332e-11号文件 |
| MA0138.2号机组 | 0.560638 |
| MA0002.2号机组 | 0.279901 |
| 马0137.2 | 0.072043 |
| MA0104.2号 | 0.0603348 |
| MA0047.2号 | 0.0523797 |
| MA0112.2号 | 0.0508868 |
| MA0065.2号 | 0.161706 |
| MA0150.1号机组 | 0.132442 |
| MA0151.1号 | 0 |
| MA0152.1号 | 0.583243 |
| MA0153.1号机组 | 0.284938 |
| MA0154.1号机组 | 0.0813983 |
| MA0155.1号 | 0.0232069 |
| MA0156.1号机组 | 0.488321 |
| MA0157.1号 | 0.31617 |
| MA0158.1号 | 0 |
| MA0159.1号机组 | 0.025226 |
| MA0160.1号 | 0.51385 |
| MA0161.1号机组 | 0 |
| MA0162.1号机组 | 6月19日255e-06 |
| MA0163.1号机组 | 0.029356 |
| MA0164.1号机组 | 0.872807 |
| MA0080.2号 | 0.626481 |
| 马0018.2 | 0.0568715 |
| MA0099.2号机组 | 0.0340801 |
| MA0079.2号 | 0 |
| MA0102.2号机组 | 0.64826 |
| 马0258.1 | 0.782021 |
| 马0259.1 | 1.38259 |
| 马0442.1 | 0 |
ENCODE TF ChIP-seq峰富集分析<b>摘要：</b>对于每个TF和每个共表达簇，使用Fisher精确检验将带有ENCODE TF ChIP信号的启动子数量与稳健集的其他启动子进行比较。Benjamini-Hochberg校正后，保留了ChIP显著富集（q<=0.05）的聚类<br><b>分析师：Erik Arner链接到源数据集数据
（#promoters=该共表达簇中具有TF的ChIP信号的启动子数量）
| TF公司 | #发起人 | 丰富 | p值 | q值 |
|---|
| BRF2#55290 | 2 | 37.0543303929431 | 0.00137524824601158 | 0.00896060587467734 |
| GATA2#2624 | 13 | 2.85662262993452 | 0.000463223425920977 | 0.00426543743429386 |
| KAT2A#2648 | 2 | 21.2444827586207 | 0.00408766387180345 | 0.0195186323659144 |
| SIRT6号51548 | 5 | 13.2446899991401 | 3.988468326839e-05 | 0.000742913578717207 |
| XRCC4号7518 | 1 | 74.1086607858861 | 0.0134066702320325 | 0.0473705674390432 |
共表达簇的相对表达<b>总结：</b>将共表达簇与FANTOM5样本进行比较，以获得相对表达<br><b>分析师：不适用<br><br>链接到数据源数据
