完整id:C235_Intestinal_Prostate_liver_colon_small_kidney_pancreat
第一阶段CAGE峰值
此共表达簇上的丰富路径<b>摘要：典型路径基因集是从Reactome、Wikipathys和KEGG中编译而来的。对于主要的信号通路，转录调控基因（下游靶点）是从Netpath获得的。综合起来，典型途径和下游靶点总计489个人类基因集。利用同源基因数据库通过同源性推断出相应的小家鼠基因集。通过超几何概率评估共表达簇中包括的489个经典途径和基因集中的每一个的富集度。然后，采用Benjamini-Hochberg方法对所得P值进行调整，以进行多重比较<br><b>分析师：Emmanuel Dimont链接到源数据集数据
此共表达无结果
此共表达簇上的丰富基因本体术语<b>摘要：共表达簇的GOStat分析结果。使用GOStat（PMID:14962934）和默认参数对启动子映射到至少两个不同基因的每个簇进行分析<br><b>分析师：Erik Arner链接到源数据集数据
此共同表达集群上的丰富示例本体术语<b>摘要：</b>为了总结1000个样本中的启动子活性（TSS区域的表达谱），我们基于FANTOM5样本本体（FF本体）进行了富集分析。这里的问题是“在哪种类型的样本中启动子更活跃”。为了回答这个问题，我们使用Mann-Whitney秩和检验比较了与样本本体术语相关的样本和其余样本中的表达式（TPM）。为了总结在这个共表达集群中丰富的本体，我们对组成的所有启动子的平均表达谱进行了相同的分析<b> 分析师：Hideya Kawaji链接到源数据集单元格_数据<br>uberon_data（超级数据）<br><br>
此共表达簇上过度表达的TFBS（DNA）基序<b>摘要：</b>显示的值是该共表达簇中基序过度表达的p值。因此，较小的p值意味着强烈的过度代表性<b> 分析师：Michiel de Hoon链接到源数据数据<br><br>茉莉花图案<br>数据
新颖的图案
JASPAR图案
| Motifs公司 | -log10（p值） |
|---|
| MA0003.1号机组 | 3.78469e-05号 |
| MA0004.1号机组 | 0.392783 |
| MA0006.1号机组 | 0.117103 |
| MA0007.1号机组 | 0.883766 |
| MA0009.1号机组 | 1.77356 |
| MA0014.1号 | 6.58983电子-05 |
| MA0017.1号 | 2.53451 |
| MA0019.1号 | 0.0534661 |
| MA0024.1号机组 | 0.146446 |
| MA0025.1号文件 | 0.299942 |
| MA0027.1号机组 | 1.66118 |
| MA0028.1号机组 | 0.00306998 |
| MA0029.1号机组 | 2.83878 |
| MA0030.1型 | 0.898568 |
| MA0031.1号文件 | 0.373498 |
| 电话0038.1 | 0.357559 |
| MA0040.1型 | 0.160513 |
| MA0041.1号 | 1.04134 |
| MA0042.1号 | 0.605322 |
| MA0043.1号 | 0.208842 |
| MA0046.1号 | 5.98423 |
| MA0048.1号 | 0.00805118 |
| 马0050.1 | 0.0719202 |
| MA0051.1号 | 0.0387309 |
| MA0052.1号 | 0.162725 |
| MA0055.1号 | 0.00144813 |
| 马0056.1 | 0 |
| MA0057.1号 | 0.00659259 |
| MA0058.1号 | 0.851431 |
| MA0059.1号 | 0.207159 |
| 马0060.1 | 0.00161032 |
| MA0061.1号 | 0.0665977 |
| MA0063.1号 | 0 |
| MA0066.1号 | 0.358282 |
| MA0067.1号 | 0.442801 |
| MA0068.1号 | 0.00455052 |
| 马0069.1 | 1.09581 |
| MA0070.1号 | 0.192383 |
| MA0071.1号 | 2.71318 |
| MA0072.1号 | 0.554995 |
| MA0073.1号 | 0.164812 |
| MA0074.1号 | 0.15136 |
| MA0076.1号 | 0.00746275 |
| MA0077.1号 | 0.543642 |
| MA0078.1号 | 0.0711369 |
| MA0081.1号 | 0.846163 |
| MA0083.1号 | 0.213446 |
| MA0084.1号 | 0.602392 |
| MA0087.1号 | 1.05139 |
| MA0088.1号 | 0.355765 |
| 马0089.1 | 0 |
| MA0090.1号 | 1.34213 |
| MA0091.1号机组 | 0.972938 |
| MA0092.1号 | 0.0123367 |
| MA0093.1号 | 0.581594 |
| 马0095.1 | 0 |
| 马0098.1 | 0 |
| MA0100.1型 | 0.043811 |
| MA0101.1号机组 | 0.124918 |
| MA0103.1号 | 1.0226 |
| MA0105.1号 | 0.0716143 |
| MA0106.1号 | 0.430165 |
| MA0107.1号 | 0.109498 |
| MA0108.2号 | 0.744857 |
| MA0109.1号 | 0 |
| MA0111.1号 | 0.140961 |
| MA0113.1号 | 1.70263 |
| MA0114.1号 | 1.73707 |
| MA0115.1号 | 0.993103 |
| MA0116.1号 | 0.114371 |
| MA0117.1号 | 0.233123 |
| 马0119.1 | 0.181734 |
| MA0122.1号机组 | 0.250579 |
| MA0124.1号机组 | 0.349309 |
| MA0125.1号机组 | 0.287016 |
| MA0130.1号机组 | 0 |
| 马0131.1 | 0.0782661 |
| MA0132.1号机组 | 0 |
| MA0133.1号机组 | 0 |
| MA0135.1号机组 | 0.646969 |
| MA0136.1号机组 | 0.369589 |
| MA0139.1号 | 0.00918816 |
| MA0140.1号机组 | 2.15676 |
| MA0141.1号 | 2.30899 |
| MA0142.1号 | 1.12972 |
| MA0143.1号 | 0.800367 |
| MA0144.1号机组 | 0.0844908 |
| MA0145.1号 | 0.183165 |
| MA0146.1号 | 0.0466923 |
| MA0147.1号 | 0.119405 |
| MA0148.1号 | 4.12801 |
| MA0149.1号 | 0.0272934 |
| MA0062.2号 | 0.00324441 |
| MA0035.2号 | 1.22797 |
| MA0039.2号 | 0.00077015 |
| MA0138.2号机组 | 0.0716075 |
| MA0002.2号机组 | 0.708765 |
| 马0137.2 | 0.146163 |
| MA0104.2号 | 0.18006 |
| MA0047.2号 | 2.64465 |
| MA0112.2号 | 0.0402889 |
| MA0065.2号 | 0.473537 |
| MA0150.1号机组 | 0.120624 |
| MA0151.1号 | 0 |
| MA0152.1号 | 0.126738 |
| MA0153.1号机组 | 4.83538 |
| MA0154.1号机组 | 0.330225 |
| MA0155.1号 | 0.448794 |
| MA0156.1号机组 | 0.149291 |
| MA0157.1号 | 0.300508 |
| MA0158.1号 | 0 |
| MA0159.1号机组 | 0.34844 |
| MA0160.1号 | 2.0147 |
| MA0161.1号机组 | 0 |
| MA0162.1号机组 | 0.00159699 |
| MA0163.1号机组 | 0.596508 |
| MA0164.1号机组 | 1.26557 |
| MA0080.2号 | 0.231037 |
| 马0018.2 | 0.195137 |
| MA0099.2号机组 | 0.301237 |
| MA0079.2号 | 4.37304电子07 |
| MA0102.2号机组 | 0.635361 |
| 马0258.1 | 0.721161 |
| 马0259.1 | 0.0243485 |
| 马0442.1 | 0 |
ENCODE TF ChIP-seq峰富集分析<b>摘要：</b>对于每个TF和每个共表达簇，使用Fisher精确检验将带有ENCODE TF ChIP信号的启动子数量与稳健集的其他启动子进行比较。Benjamini-Hochberg校正后，保留了ChIP显著富集（q<=0.05）的聚类<br><b>分析师：Erik Arner链接到源数据集数据
（#promoters=该共表达簇中具有TF的ChIP信号的启动子数量）
| TF公司 | #发起人 | 丰富 | p值 | q值 |
|---|
| FOXA1号3169 | 15 | 2.77035493734636 | 0.00022121027126438 | 0.00249573074652486 |
| FOXA2号3170 | 8 | 3.2840618336887 | 0.00286086895684713 | 0.0155060611855393 |
| HNF4A#3172号 | 9 | 3.46984355444305 | 0.00105182062783272 | 0.00743342093315887 |
| HNF4G#3174 | 8 | 3.83378967019291 | 0.00108703270993606 | 0.00760049602952478 |
共表达簇的相对表达<b>总结：</b>将共表达簇与FANTOM5样本进行比较，以获得相对表达<br><b>分析师：不适用<br><br>链接到数据源数据
