完整id:C229_Mesenhymal_CD4_Melanocyte_cute_skeletal_left_cart
第一阶段CAGE峰值
此共表达簇上的丰富路径<b>摘要：典型路径基因集是从Reactome、Wikipathys和KEGG中编译而来的。对于主要的信号通路，转录调控基因（下游靶点）是从Netpath获得的。综合起来，典型途径和下游靶点总计489个人类基因集。利用同源基因数据库通过同源性推断出相应的小家鼠基因集。通过超几何概率评估共表达簇中包括的489个经典途径和基因集中的每一个的富集度。然后，采用Benjamini-Hochberg方法对所得P值进行调整，以进行多重比较<br><b>分析师：Emmanuel Dimont链接到源数据集数据
此共表达无结果
此共表达簇上的丰富基因本体术语<b>摘要：共表达簇的GOStat分析结果。使用GOStat（PMID:14962934）和默认参数对启动子映射到至少两个不同基因的每个簇进行分析<br><b>分析师：Erik Arner链接到源数据集数据
无GOStat结果
此共同表达集群上的丰富示例本体术语<b>摘要：</b>为了总结1000个样本中的启动子活性（TSS区域的表达谱），我们基于FANTOM5样本本体（FF本体）进行了富集分析。这里的问题是“在哪种类型的样本中启动子更活跃”。为了回答这个问题，我们使用Mann-Whitney秩和检验比较了与样本本体术语相关的样本和其余样本中的表达式（TPM）。为了总结在这个共表达集群中丰富的本体，我们对组成的所有启动子的平均表达谱进行了相同的分析<b> 分析师：Hideya Kawaji链接到源数据集疾病数据<br>
此共表达簇上过度表达的TFBS（DNA）基序<b>摘要：</b>显示的值是该共表达簇中基序过度表达的p值。因此，较小的p值意味着强烈的过度代表性<b> 分析师：Michiel de Hoon链接到源数据数据<br><br>茉莉花图案<br>数据
新颖的图案
JASPAR图案
| Motifs公司 | -log10（p值） |
|---|
| MA0003.1号机组 | 1.9374e-07号 |
| MA0004.1号机组 | 0.187985 |
| MA0006.1号机组 | 0.204381 |
| MA0007.1号机组 | 0.329382 |
| MA0009.1号机组 | 1.09942 |
| MA0014.1号 | 3.0773e-07号 |
| MA0017.1号 | 0.95842 |
| MA0019.1号 | 1.58105 |
| MA0024.1号机组 | 0.139391 |
| MA0025.1号文件 | 0.290149 |
| MA0027.1号机组 | 1.6471 |
| MA0028.1号机组 | 0.0529791 |
| MA0029.1号机组 | 0.149877 |
| MA0030.1型 | 0.143615 |
| MA0031.1号文件 | 0.110677 |
| 电话0038.1 | 0.60992 |
| MA0040.1型 | 0.465611 |
| MA0041.1号 | 0.408002 |
| MA0042.1号 | 0.171568 |
| MA0043.1号 | 0.200452 |
| MA0046.1号 | 0.193494 |
| MA0048.1号 | 0.149132 |
| 马0050.1 | 0.341919 |
| MA0051.1号 | 0.599051 |
| MA0052.1号 | 0.470992 |
| MA0055.1号 | 0.0046267 |
| 马0056.1 | 0 |
| MA0057.1号 | 0.0121538 |
| MA0058.1号 | 0.191858 |
| MA0059.1号 | 0.342282 |
| 马0060.1 | 0.0907347 |
| MA0061.1号 | 0.10636 |
| MA0063.1号 | 0 |
| MA0066.1号 | 0.145656 |
| MA0067.1号 | 0.431554 |
| MA0068.1号 | 0.000924356 |
| 马0069.1 | 0.558619 |
| MA0070.1号 | 0.184309 |
| MA0071.1号 | 0.512993 |
| MA0072.1号 | 1.02527 |
| MA0073.1号 | 2.51606e-08 |
| MA0074.1号 | 0.141145 |
| MA0076.1号 | 0.0350181 |
| MA0077.1号 | 0.524407 |
| MA0078.1号 | 0.507832 |
| MA0081.1号 | 0.0290834 |
| MA0083.1号 | 0.204972 |
| MA0084.1号 | 0.59013 |
| MA0087.1号 | 0.532044 |
| MA0088.1号 | 0.0737429 |
| 马0089.1 | 0 |
| MA0090.1号 | 0.242094 |
| MA0091.1号机组 | 0.619223 |
| MA0092.1号 | 0.29697 |
| MA0093.1号 | 0.210231 |
| 马0095.1 | 0 |
| 马0098.1 | 0 |
| MA0100.1型 | 0.646115 |
| MA0101.1号机组 | 0.112324 |
| MA0103.1号 | 0.0948626 |
| MA0105.1号 | 0.0330662 |
| MA0106.1号 | 0.182034 |
| MA0107.1号 | 0.0967296 |
| MA0108.2号 | 0.109215 |
| MA0109.1号 | 0 |
| MA0111.1号 | 0.0463494 |
| MA0113.1号 | 0.197766 |
| MA0114.1号 | 0.600931 |
| MA0115.1号 | 0.370769 |
| MA0116.1号 | 1.41001 |
| MA0117.1号 | 0.637527 |
| 马0119.1 | 0.0742602 |
| MA0122.1号机组 | 0.677693 |
| MA0124.1号机组 | 0.338933 |
| MA0125.1号机组 | 1.39148 |
| MA0130.1号机组 | 0 |
| 马0131.1 | 0.543404 |
| MA0132.1号机组 | 0 |
| MA0133.1号机组 | 0 |
| MA0135.1号机组 | 1.17465 |
| MA0136.1号机组 | 0.349036 |
| MA0139.1号 | 0.00740446 |
| MA0140.1号机组 | 0.0268183 |
| MA0141.1号 | 0.338045 |
| MA0142.1号 | 0.0959792 |
| MA0143.1号 | 0.197939 |
| MA0144.1号机组 | 0.0112872 |
| MA0145.1号 | 0.000738893 |
| MA0146.1号 | 7.65368e-05号 |
| MA0147.1号 | 0.193449 |
| MA0148.1号 | 0.220479 |
| MA0149.1号 | 0.0247918 |
| MA0062.2号 | 0.0234785 |
| MA0035.2号 | 0.271242 |
| MA0039.2号 | 2.86463e-07号 |
| MA0138.2号机组 | 0.066895 |
| MA0002.2号机组 | 0.478845 |
| 马0137.2 | 0.00288294 |
| MA0104.2号 | 0.0441645 |
| MA0047.2号 | 0.170795 |
| MA0112.2号 | 0.0539276 |
| MA0065.2号 | 0.0724484 |
| MA0150.1号机组 | 1.60954 |
| MA0151.1号 | 0 |
| MA0152.1号 | 0.832978 |
| MA0153.1号机组 | 0.733339 |
| MA0154.1号机组 | 0.205443 |
| MA0155.1号 | 0.0252403 |
| MA0156.1号机组 | 0.0585425 |
| MA0157.1号 | 0.0841652 |
| MA0158.1号 | 0 |
| MA0159.1号机组 | 0.106727 |
| MA0160.1号 | 0.456767 |
| MA0161.1号机组 | 0 |
| MA0162.1号机组 | 6.68437e-06号 |
| MA0163.1号机组 | 0.00273499 |
| MA0164.1号机组 | 0.210088 |
| MA0080.2号 | 0.108594 |
| 马0018.2 | 0.410474 |
| MA0099.2号机组 | 0.282757 |
| MA0079.2号 | 0 |
| MA0102.2号机组 | 0.622942 |
| 马0258.1 | 0.124014 |
| 马0259.1 | 0.212038 |
| 马0442.1 | 0 |
ENCODE TF ChIP-seq峰富集分析<b>摘要：</b>对于每个TF和每个共表达簇，使用Fisher精确检验将带有ENCODE TF ChIP信号的启动子数量与稳健集的其他启动子进行比较。Benjamini-Hochberg校正后，保留了ChIP显著富集（q<=0.05）的聚类<br><b>分析师：Erik Arner链接到源数据集数据
（#promoters=该共表达簇中具有TF的ChIP信号的启动子数量）
| TF公司 | #发起人 | 丰富 | p值 | q值 |
|---|
| BCL3#602 | 7 | 3.90047934880916 | 0.00207323716250547 | 0.0120172503060777 |
| GTF2B#2959 | 6 | 3.09133838074105 | 0.0129409764714944 | 0.0465182983997521 |
| POLR2A#5430 | 42 | 1.45472634541031 | 0.000619799458460022 | 0.00513739965413542 |
| RDBP编号7936 | 4 | 9.91215509613064 | 0.000738087004057832 | 0.00581510777133342 |
共表达簇的相对表达<b>总结：</b>将共表达簇与FANTOM5样本进行比较，以获得相对表达<br><b>分析师：不适用<br><br>链接到数据源数据
