共表达簇以下为：C228型

完整id:C228_colon_Intestinal_Prostate_hepatoblastoma_hepatocellular_testis_addom

第一阶段CAGE峰值

Hg19:：克时10:104629450..104629461+	第3页@AS3MT
Hg19:：chr10:104629528..104629542+	第6页@AS3MT
Hg19:：chr10:24726425..24726450+	电话：chr10:24726425..24726450 +
Hg19:：chr10:24726466..24726472+	电话：chr10:24726466..24726472 +
Hg19:：chr10:71850931..7185940+	电话：chr10:71850931..7185940 +
Hg19:：chr11:118082912..118082938-	电话：chr11:118082912..118082938 -
Hg19:：chr11:13994430..13994436+	电话：chr11:13994430..13994436 +
Hg19:：chr11:9878820..9878833-	电话：chr11:9878820..9878833 -
Hg19:：chr12:102437910..102437918-	电话：chr12:102437910..102437918 -
Hg19:：chr12:69726073..69726089-	p@chr12:69726073..69726089 -
Hg19:：chr12:93399748..93399757+	电话：chr12:93399748..93399757 +
Hg19:：chr12:93399816..93399825+	电话：chr12:93399816..93399825 +
Hg19:：chr12:93399852..93399859+	p@chr12:93399852..93399859 +
Hg19:：chr12:93399866..93399909+	电话：chr12:93399866..93399909 +
Hg19:：chr12:93399913..93399929+	电话：chr12:93399913..93399929 +
Hg19:：chr13:32790605..32790619+	电话：chr13:32790605..32790619 +
Hg19:：chr13:32790683..32790693+	电话：chr13:32790683..32790693 +
Hg19:：chr13:421799573..42179585-	电话：chr13:42179573..42179585 -
Hg19:：chr13:46093155..46093164+	电话：chr13:46093155..46093164 +
Hg19:：chr13:46093198..46093203+	电话：chr13:46093198..46093203 +
Hg19:：chr14:22850283..22850310-	电话：chr14:22850283..22850310 -
Hg19:：chr15:60749901.60749904-	电话：chr15:60749901.60749904 -
Hg19:：chr15:71003168..71003184-	电话：chr15:71003168..71003184 -
Hg19:：chr15:89540938..89540967-	电话：chr15:89540938.89540967 -
Hg19:：chr16:19661585..19661596+	电话：chr16:19661585..19661596 +
Hg19:：chr16:19661615..19661621+	p@chr16:19661615..19661621 +
Hg19:：chr16:78274724..78274726+	电话：chr16:78274724..78274726 +
Hg19:：chr18:24722967..24722980-	第4页@CHST9
Hg19:：chr18:24722995..24723030-	第3页@CHST9
Hg19:：chr18:6929797..6929812-	p1@uc002kng.1
Hg19:：chr18:7034928.7034943-	电话：chr18:7034928.7034943 -
Hg19:：chr18:7133714..7133725-	电话：chr18:7133714..7133725 -
Hg19:：chr19:56653064..56653103+	p1@AK124209
Hg19:：chr1:111023361..111023366+	p1@CYMP（CYMP）
Hg19:：chr1:19522637..19522659-	电话：chr1:19522637..19522659 -
Hg19:：chr1:19522690..19522704-	电话：chr1:19522690..19522704 -
Hg19:：chr21:42694732..42694744+	第3页@FAM3B
Hg19:：chr21:42694788..42694804+	电话：chr21:42694788..42694804 +
Hg19:：chr2:127873614..127873626+	电话：chr2:127873614..127873626 +
Hg19:：chr2:137966134..137966139+	电话：chr2:137966134..137966139 +
Hg19:：chr2:176484786..176484791+	电话：chr2:176484786..176484791 +
Hg19:：chr2:28340333..28340358+	电话：chr2:28340333..28340358 +
Hg19:：chr2:62189730..62189756+	电话：chr2:62189730..62189756 +
Hg19:：chr3:139373728..139373733+	电话：chr3:139373728..139373733 +
Hg19:：chr4:107237136..107237147+	p10@AIMP1
Hg19:：chr5:142213315..142213336+	电话：chr5:142213315..142213336 +
Hg19:：chr6:26500524..26500540+	电话：chr6:26500524..26500540 +
Hg19:：chr6:41492615..41492636-	p@chr6:41492615..41492636 -
Hg19:：chr6:80382928..80382946+	电话：chr6:80382928..80382946 +
Hg19:：chr6:8446968..8446983+	电话：chr6:8446968..8446983 +
Hg19:：chr7:117329764..117329777+	p1@ENST00000429014
Hg19:：chr7:97958802..97958804-	电话：chr7:97958802..97958804 -
Hg19:：chr8:55331615..55331618+	电话：chr8:55331615..55331618 +
Hg19:：chr8:99425711..99425716-	p1@ENST00000518956
Hg19:：chr9:129830560..129830568+	电话：chr9:129830560..129830568 +
Hg19:：chr9:138591341..138591346-	第3页@SOHLH1
Hg19:：chr9:35801527..35801540+	电话：chr9:35801527..35801540 +
Hg19:：chr9:71347655..71347671+	电话：chr9:71347655..71347671 +
Hg19:：chrX:21849506..21849512-	电话：21849506..21849512 -
Hg19:：chrX:24690735..24690744-	第10页@PCYT1B
Hg19:：chrX:32583949.32583951-	电话：32583949..32583951 -
Hg19:：chrX:75367265..75367270-	邮政编码：75367265..75367270 -

此共表达簇上的丰富路径<b>摘要：典型路径基因集是从Reactome、Wikipathys和KEGG中编译而来的。对于主要的信号通路，转录调控基因（下游靶点）是从Netpath获得的。综合起来，典型途径和下游靶点总计489个人类基因集。利用同源基因数据库通过同源性推断出相应的小家鼠基因集。通过超几何概率评估共表达簇中包括的489个经典途径和基因集中的每一个的富集度。然后，采用Benjamini-Hochberg方法对所得P值进行调整，以进行多重比较<br><b>分析师：Emmanuel Dimont链接到源数据集数据

---

此共表达无结果

此共表达簇上的丰富基因本体术语<b>摘要：共表达簇的GOStat分析结果。使用GOStat（PMID:14962934）和默认参数对启动子映射到至少两个不同基因的每个簇进行分析<br><b>分析师：Erik Arner链接到源数据集数据

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GO标识	GO名称	FDR校正的p值
去：0004105	磷酸胆碱胞苷基转移酶活性	0.020116143791594
GO:0001537号	N-乙酰氨基半乳糖4-O-磺基转移酶活性	0.020116143791594
去：0006656	磷脂酰胆碱生物合成过程	0.020116143791594
电话：0046470	磷脂酰胆碱代谢过程	0.020116143791594
GO:0043231号	细胞内膜结合细胞器	0.020116143791594
GO:0043227号	膜结合细胞器	0.020116143791594
去：0030073	胰岛素分泌	0.0271777219978296
去：0030072	肽激素分泌	0.0271777219978296
去：0002790	肽分泌	0.0271777219978296
GO:0030166号	蛋白聚糖生物合成过程	0.0271777219978296
GO:0043229号	细胞内细胞器	0.0271777219978296
转到：0043226	细胞器	0.0271777219978296
去：0005794	高尔基体	0.0310458162510283
去：0006029	蛋白多糖代谢过程	0.0310458162510283
GO:0046879号	激素分泌	0.0339619745399327
GO:0015833号	肽运输	0.0353773819092401
GO:0042446号	激素生物合成过程	0.0353773819092401
去：0005783	内质网	0.0353773819092401
GO:0046474号	甘油磷脂生物合成过程	0.0353773819092401
去：0030203	糖胺聚糖代谢过程	0.0353773819092401
转到：0006022	氨基多糖代谢过程	0.0353773819092401
去：0008146	硫转移酶活性	0.0353773819092401
GO:0044424号	细胞外	0.0357889772004106
转到：0016782	转移含硫基团的转移酶活性	0.0386429063395159
通：0003001	细胞间信令信号的产生	0.0418642014843719
去：0006790	硫代谢过程	0.0486792011353691
GO:0042445号	激素代谢过程	0.0486792011353691
GO:0008654号	磷脂生物合成过程	0.0490627688252635

此共同表达集群上的丰富示例本体术语<b>摘要：</b>为了总结1000个样本中的启动子活性（TSS区域的表达谱），我们基于FANTOM5样本本体（FF本体）进行了富集分析。这里的问题是“在哪种类型的样本中启动子更活跃”。为了回答这个问题，我们使用Mann-Whitney秩和检验比较了与样本本体术语相关的样本和其余样本中的表达式（TPM）。为了总结在这个共表达集群中丰富的本体，我们对组成的所有启动子的平均表达谱进行了相同的分析<b> 分析师：Hideya Kawaji链接到源数据集单元格_数据<br>uberon_data（超级数据）<br><br>

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单元格类型

本体术语	p值	n个
肠上皮细胞	3.35e-66毫米	4
大肠上皮细胞	3.61e-34页	2
前列腺上皮细胞	3.27e-23日	三
内上皮细胞	3.52e-15页	42
消化道上皮细胞	2.58e-14	20
内胚层细胞	2.67e-11页	58

优步解剖

本体术语	p值	n个
肠粘膜	3.35e-66页	4
肠壁	3.35e-66页	4
胃肠系统粘膜	3.35e-66页	4
胃肠系统上皮	3.35e-66页	4
肠上皮	3.35e-66页	4
粘膜上皮	7.68e-34页	8
单层柱状上皮	3.09e-30日	9
解剖壁	5.14e-23条	12
直肠	7.35e-18日	4
肠	2016年9月5日	17
后肠	4.91e-15页	19
下消化道	1.40至14	5
粘膜	2.58e-14	20
肠上皮	4.68e-12条	54
胃肠系统	2.77e-11页	25
结肠	1.04e-08年	9
内质子氦	2008年7月20日	82
大肠	2007年3月22日	11
前列腺	2007年4月47日	11
男性副性腺	2007年4月47日	11
胚胎泄殖腔上皮	2007年4月47日	11
后肠上皮	2007年4月47日	11
泌尿生殖窦上皮	2007年4月47日	11
前列腺芽	2.47电子-07	11
前列腺场	2007年4月47日	11
性腺	2007年9月22日	12
男性生殖腺	2007年9月22日	12

此共表达簇上过度表达的TFBS（DNA）基序<b>摘要：</b>显示的值是该共表达簇中基序过度表达的p值。因此，较小的p值意味着强烈的过度代表性<b> 分析师：Michiel de Hoon链接到源数据数据<br><br>茉莉花图案<br>数据

---

新颖的图案

JASPAR图案

Motifs公司	-log10（p值）
MA0003.1号机组	2.01395e-09版
MA0004.1号机组	0.187985
MA0006.1号机组	0.01288
MA0007.1号机组	0.0622008
MA0009.1号机组	0.580521
MA0014.1号	1.26609e-05号
MA0017.1号	0.95842
MA0019.1号	0.185705
MA0024.1号机组	0.139391
MA0025.1号文件	0.290149
MA0027.1号机组	1.6471
MA0028.1号机组	0.0161707
MA0029.1号机组	5.22435
MA0030.1型	0.4418
MA0031.1号文件	1.18963
电话0038.1	1.3666
MA0040.1型	0.153121
MA0041.1号	0.0836142
MA0042.1号	0.570278
MA0043.1号	0.200452
MA0046.1号	4.91912
MA0048.1号	0.00221814
马0050.1	0.0654993
MA0051.1号	0.141769
MA0052.1号	0.470992
MA0055.1号	0.00898435
马0056.1	0
MA0057.1号	0.196801
MA0058.1号	0.345438
MA0059.1号	0.0869946
马0060.1	0.0184268
MA0061.1号	0.0100955
MA0063.1号	0
MA0066.1号	0.036752
MA0067.1号	0.431554
MA0068.1号	0.0035579
马0069.1	0.191124
MA0070.1号	0.184309
MA0071.1号	0.512993
MA0072.1号	0.535604
MA0073.1号	6.8693电子-05
MA0074.1号	1.34346
MA0076.1号	0.00650833
MA0077.1号	0.176993
MA0078.1号	0.0664432
MA0081.1号	0.342679
MA0083.1号	0.204972
MA0084.1号	0.59013
MA0087.1号	0.180133
MA0088.1号	0.00689518
马0089.1	0
MA0090.1号	0.943138
MA0091.1号机组	0.924293
MA0092.1号	0.506239
MA0093.1号	0.210231
马0095.1	0
马0098.1	0
MA0100.1型	1.00592
MA0101.1号机组	0.112324
MA0103.1号	0.319263
MA0105.1号	0.00101018
MA0106.1号	0.182034
MA0107.1号	0.0444677
MA0108.2号	0.353256
MA0109.1号	0
MA0111.1号	0.26631
MA0113.1号	0.43762
MA0114.1号	1.96954
MA0115.1号	0.96956
MA0116.1号	0.00433934
MA0117.1号	0.224307
马0119.1	0.0742602
MA0122.1号机组	0.241483
MA0124.1号机组	0.338933
MA0125.1号机组	0.277393
MA0130.1号机组	0
马0131.1	0.0732939
MA0132.1号机组	0
MA0133.1号机组	0
MA0135.1号机组	0.219593
MA0136.1号机组	0.0385053
MA0139.1号	0.0200299
MA0140.1号机组	3.16255
MA0141.1号	0.338045
MA0142.1号	0.317961
MA0143.1号	0.437943
MA0144.1号机组	0.0112872
MA0145.1号	0.0113224
MA0146.1号	0.000398195
MA0147.1号	0.0493222
MA0148.1号	2.83921
MA0149.1号	0.0247918
MA0062.2号	0.00885881
MA0035.2号	4.39685
MA0039.2号	0.000212024
MA0138.2号机组	0.066895
MA0002.2号机组	0.222403
马0137.2	0.412022
MA0104.2号	0.0181429
MA0047.2号	3.16016
MA0112.2号	0.0317112
MA0065.2号	1.79567
MA0150.1号机组	0.40763
MA0151.1号	0
MA0152.1号	1.20696
MA0153.1号机组	3.78682
MA0154.1号机组	0.0154681
MA0155.1号	0.00284875
MA0156.1号机组	0.00298728
MA0157.1号	1.00572
MA0158.1号	0
MA0159.1号机组	0.106727
MA0160.1号	0.241572
MA0161.1号机组	0
MA0162.1号机组	6.68437e-06号
MA0163.1号机组	0.00273499
MA0164.1号机组	2.24841
MA0080.2号	0.00210053
马0018.2	0.0487634
MA0099.2号机组	0.117814
MA0079.2号	4.66309电子08
MA0102.2号机组	0.622942
马0258.1	0.124014
马0259.1	0.00545353
马0442.1	0

ENCODE TF ChIP-seq峰富集分析<b>摘要：</b>对于每个TF和每个共表达簇，使用Fisher精确检验将带有ENCODE TF ChIP信号的启动子数量与稳健集的其他启动子进行比较。Benjamini-Hochberg校正后，保留了ChIP显著富集（q<=0.05）的聚类<br><b>分析师：Erik Arner链接到源数据集数据

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（#promoters=该共表达簇中具有TF的ChIP信号的启动子数量）

TF公司	#发起人	丰富	p值	q值
BHLHE40#8553	7	5.06617249723939	0.000457551318155481	0.00421729786575239
EP300#2033号	20	2.18514249233006	0.00040750704601312	0.00388565948859347
FOXA1号3169	19	3.39591895545683	1.31164976046539电子06	5.20271133054482e-05
FOXA2号3170	18	7.15077979916088	2.92438537022645e-11号	3.40870405894063e-09号
HDAC2号3066	14	3.02933360181883	0.000153593924919596	0.00195791479612812
HNF4A#3172号	13	4.85031894707094	2.06524670596649e-06号	7.53641861371189e-05号
HNF4G#3174	10	4.63764879458819	5.2800106284844442e-05	0.000896357330995261
MAFF编号23764	5	4.54156100725364	0.0049283748035772	0.0230328248136573
TCF7L2号6934	18	3.12682545381407	8.66135227406049e-06	0.00023501765917137

共表达簇的相对表达<b>总结：</b>将共表达簇与FANTOM5样本进行比较，以获得相对表达<br><b>分析师：不适用<br><br>链接到数据源数据

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