共表达簇以下为：C215型

完整id:C215_chronic_acute_piripheral_Hepatocyte_socosetoscomama_NK_imature

第一阶段CAGE峰值

Hg19:：chr10:22607676..22607682+	第21页@通信3
Hg19:：chr10:22607725..22607736+	第18页@通信3
Hg19:：chr10:34307354..34307364+	电话：chr10:34307354..34307364 +
Hg19:：chr12:10084960..10084974-	p1@CLEC2A
Hg19:：chr12:10084999..10085009-	第2页@CLEC2A
Hg19:：chr12:10095845..10095862-	p2@uc001qwo.1
Hg19:：chr12:10151709..10151754-	CLEC1B处的p1
Hg19:：chr12:10151773..10151784-	第3页@CLEC1B
Hg19:：chr12:10205100..10205121+	第3页@AB590792
Hg19:：chr12:10205127..10205138+	第5页@AB590792
Hg19:：chr12:43611998..43612001+	电话：chr12:43611998..43612001 +
Hg19:：chr12:43612012..43612028+	电话：chr12:43612012..43612028 +
Hg19:：chr13:73126300..73126304-	电话：chr13:73126300..73126304 -
Hg19:：chr15:88484080..88484087-	第20页@NTRK3
Hg19:：chr19:33960599..339608-	p@chr19:33960599..33960608 -
Hg19:：chr19:466663654..4663668+	电话：chr19:466663654.46663668 +
Hg19:：chr21:20985006..20985010+	电话：chr21:20985006..20985010 +
Hg19:：chr21:22483836..22483880+	电话：chr21:22483836..22483880 +
Hg19:：chr21:22550109..22550126+	电话：chr21:22550109…22550126 +
Hg19:：chr21:22550139..22550141+	p@chr21:22550139..22550141 +
Hg19:：chr21:22550147..22550151+	电话：chr21:22550147…22550151 +
Hg19:：chr21:22550165..22550181+	电话：chr21:22550165..22550181 +
Hg19:：chr21:47809029..47809044+	电话：chr21:47809029..47809044 +
Hg19:：chr22:498862217..49886230-	电话：chr22:498862217..498886230 -
Hg19:：chr22:49886244..49886251-	电话：chr22:49886244..49886251 -
Hg19:：chr2:164580742..164580760-	电话：chr2:164580742..164580760 -
Hg19:：chr2:219849008..219849011-	p13@前向静脉血栓栓塞
Hg19:：chr2:219849012..219849065-	FEV下的p1
Hg19:：chr2:219849078..219849085-	第10页@FEV
Hg19:：chr2:219849175..219849187-	第4页@FEV
Hg19:：chr2:219849306..219849309+	电话：chr2:219849306..219849309 +
Hg19:：chr3:126207173..126207218-	电话：chr3:126207173..126207218 -
Hg19:：chr4:117273886.第117273928页+	电话：chr4:117273886..117273928 +
Hg19:：chr4:134283870..134283873+	电话：chr4:134283870..134283873 +
Hg19:：chr4:42154250..42154256-	p12@弯管4
Hg19:：chr4:42154592..42154600-	p15@弯管4
Hg19:：chr4:90799994..90800011+	电话：chr4:90799994..90800011 +
Hg19:：chr5:120355553..120355565-	电话：chr5:120355553..120355565 -
Hg19:：chr5:155210..155224+	p@chr5:155210..155224 +
Hg19:：chr5:155367..155409+	电话：chr5:155367..155409 +
Hg19:：chr5:155432..155458+	电话：chr5:155432..155458 +
Hg19:：chr5:86090158..86090169+	电话：chr5:86090158..86090169 +
Hg19:：chr5:86090206..86090212+	电话：chr5:86090206.86090212 +
Hg19:：chr5:86213307..86213310+	电话：chr5:86213307..86213310 +
Hg19:：chr6:135668066..135668095-	电话：chr6:135668066..135668095 -
Hg19:：chr6:21065386..21065400+	p5@CDKAL1
Hg19:：chr6:23916407..23916457+	电话：chr6:23916407..23916457 +
Hg19:：chr6:67780097..67780102+	电话：chr6:67780097..67780102 +
Hg19:：chr7:10000571..10000582+	p1@ENST00000451755
Hg19:：chr7:10000610..10000618+	p2@ENST00000451755
Hg19:：chr7:10000640..10000645+	第4页@ENST00000451755
Hg19:：chr8:108334188..108334201-	p11@角度1
Hg19:：chr8:108334209..108334228-	p8@角度1
Hg19:：chr8:108336622..108336625+	电话：chr8:108336622..108336625 +
Hg19:：chr8:114449751..114449769-	第7页@CSMD3
Hg19:：chr8:114725643..114725660-	电话：chr8:114725643..114725660 -
Hg19:：chr8:114747320..114747347-	电话：chr8:114747320..114747347 -
Hg19:：chr8:114747363..114747380-	邮政编码：8:114747363.114747380 -
Hg19:：chr8:115089397..115089400+	电话：chr8:115089397..115089400 +
Hg19:：chr8:116673894..116673913-	第12页@TRPS1
Hg19:：chr8:130648181..130648190-	电话：chr8:130648181..130648190 -
Hg19:：chr8:2163693..2163732-	电话：chr8:2163693..2163732 -
Hg19:：chr8:2163883..2163896-	电话：chr8:2163883..2163896 -
Hg19:：chr8:2163929..2163941-	电话：chr8:2163929..2163941 -
Hg19:：chr8:41292975..41292985+	p2@ENST00000521725
Hg19:：chr8:41292988..41293000+	p1@ENST00000521725
Hg19:：chr8:76077242..76077244+	电话：chr8:76077242..76077244 +
Hg19:：chr9:133407203..133407218+	电话：chr9:133407203..133407218 +
Hg19:：chr9:133407256..133407273+	电话：chr9:133407256..133407273 +

此共表达簇上的丰富路径<b>摘要：典型路径基因集是从Reactome、Wikipathys和KEGG中编译而来的。对于主要的信号通路，转录调控基因（下游靶点）是从Netpath获得的。综合起来，典型途径和下游靶点总计489个人类基因集。利用同源基因数据库通过同源性推断出相应的小家鼠基因集。通过超几何概率评估共表达簇中包括的489个经典途径和基因集中的每一个的富集度。然后，采用Benjamini-Hochberg方法对所得P值进行调整，以进行多重比较<br><b>分析师：Emmanuel Dimont链接到源数据集数据

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此共表达无结果

此共表达簇上的丰富基因本体术语<b>摘要：共表达簇的GOStat分析结果。使用GOStat（PMID:14962934）和默认参数对启动子映射到至少两个不同基因的每个簇进行分析<br><b>分析师：Erik Arner链接到源数据集数据

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无GOStat结果

此共同表达集群上的丰富示例本体术语<b>摘要：</b>为了总结1000个样本中的启动子活性（TSS区域的表达谱），我们基于FANTOM5样本本体（FF本体）进行了富集分析。这里的问题是“在哪种类型的样本中启动子更活跃”。为了回答这个问题，我们使用Mann-Whitney秩和检验比较了与样本本体术语相关的样本和其余样本中的表达式（TPM）。为了总结在这个共表达集群中丰富的本体，我们对组成的所有启动子的平均表达谱进行了相同的分析<b> 分析师：Hideya Kawaji链接到源数据集疾病数据<br>

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疾病

本体术语	p值	n个
慢性白血病	5.22e-26日	8
髓系白血病	2008年7月41日	31

此共表达簇上过度表达的TFBS（DNA）基序<b>摘要：</b>显示的值是该共表达簇中基序过度表达的p值。因此，较小的p值意味着强烈的过度代表性<b> 分析师：Michiel de Hoon链接到源数据数据<br><br>茉莉花图案<br>数据

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新颖的图案

JASPAR图案

Motifs公司	-log10（p值）
MA0003.1号机组	0.000443641
MA0004.1号机组	0.292819
MA0006.1号机组	0.027879
MA0007.1号机组	0.044566
MA0009.1号机组	0.517127
MA0014.1号	2.95732e-05号
MA0017.1号	0.359388
MA0019.1号	1.39116
MA0024.1号机组	0.117627
MA0025.1号文件	0.259105
MA0027.1号机组	1.6012
MA0028.1号机组	0.172226
MA0029.1号机组	0.400166
MA0030.1型	0.772017
MA0031.1号文件	0.306
电话0038.1	0.511884
MA0040.1型	0.407817
MA0041.1号	0.553037
MA0042.1号	1.01404
MA0043.1号	0.174193
MA0046.1号	1.54245
MA0048.1号	0.0140581
马0050.1	0.131075
MA0051.1号	2.58305
MA0052.1号	2.59086
MA0055.1号	0.00956919
马0056.1	0
MA0057.1号	0.00190511
MA0058.1号	0.264486
MA0059.1号	0.261771
马0060.1	0.0255608
MA0061.1号	0.113625
MA0063.1号	0
MA0066.1号	0.0273846
MA0067.1号	0.395513
MA0068.1号	0.148798
马0069.1	0.165471
MA0070.1号	0.933424
MA0071.1号	0.221073
MA0072.1号	0.922928
MA0073.1号	7.65965e-05号
MA0074.1号	0.0262445
MA0076.1号	0.299048
MA0077.1号	0.463589
MA0078.1号	0.194571
MA0081.1号	0.139784
MA0083.1号	1.60449
MA0084.1号	1.35694
MA0087.1号	0.470858
MA0088.1号	0.000924625
马0089.1	0
MA0090.1号	0.530463
MA0091.1号机组	0.297728
MA0092.1号	0.109133
MA0093.1号	0.264179
马0095.1	0
马0098.1	0
MA0100.1型	0.296489
MA0101.1号机组	0.15613
MA0103.1号	0.0636
MA0105.1号	7.81066e-05
MA0106.1号	0.613607
MA0107.1号	0.121051
MA0108.2号	0.627577
MA0109.1号	0
MA0111.1号	0.0320901
MA0113.1号	0.160472
MA0114.1号	0.0574343
MA0115.1号	0.336593
MA0116.1号	0.0096387
MA0117.1号	0.196603
马0119.1	3.01402
MA0122.1号机组	0.212824
MA0124.1号机组	0.305891
MA0125.1号机组	0.690351
MA0130.1号机组	0
马0131.1	0.806233
MA0132.1号机组	0
MA0133.1号机组	0
MA0135.1号机组	0.561121
MA0136.1号机组	0.528777
MA0139.1号	0.0242189
MA0140.1号机组	1.00904
MA0141.1号	0.0596471
MA0142.1号	0.269716
MA0143.1号	1.45011
MA0144.1号机组	1.46528
MA0145.1号	0.000205966
MA0146.1号	0.000534134
MA0147.1号	0.0689055
MA0148.1号	0.860451
MA0149.1号	5.12865
MA0062.2号	0.256593
MA0035.2号	0.680551
MA0039.2号	2.982e-09年
MA0138.2号机组	0.195748
MA0002.2号机组	2.79566
马0137.2	3.15679
MA0104.2号	0.0251613
MA0047.2号	0.582934
MA0112.2号	0.0409959
MA0065.2号	0.0193641
MA0150.1号机组	1.03578
MA0151.1号	0
MA0152.1号	1.42545
MA0153.1号机组	1.91916
MA0154.1号机组	0.172834
MA0155.1号	0.00216724
MA0156.1号机组	0.493351
MA0157.1号	1.3302
MA0158.1号	0
MA0159.1号机组	0.133693
MA0160.1号	0.617337
MA0161.1号机组	0
MA0162.1号机组	7.64521e-07年
MA0163.1号机组	1.5854e-07号
MA0164.1号机组	0.17148
MA0080.2号	0.26439
马0018.2	0.0373716
MA0099.2号机组	0.226802
MA0079.2号	1.98724e-12号
MA0102.2号机组	0.582837
马0258.1	0.0155231
马0259.1	0.0120686
马0442.1	0

ENCODE TF ChIP-seq峰富集分析<b>摘要：</b>对于每个TF和每个共表达簇，使用Fisher精确检验将带有ENCODE TF ChIP信号的启动子数量与稳健集的其他启动子进行比较。Benjamini-Hochberg校正后，保留了ChIP显著富集（q<=0.05）的聚类<br><b>分析师：Erik Arner链接到源数据集数据

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（#promoters=该共表达簇中具有TF的ChIP信号的启动子数量）

TF公司	#发起人	丰富	p值	q值
苏Z12#23512	5	3.63157832688862	0.0123545526060442	0.0447305387097916

共表达簇的相对表达<b>总结：</b>将共表达簇与FANTOM5样本进行比较，以获得相对表达<br><b>分析师：不适用<br><br>链接到数据源数据

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