完整id:C201_colon_small_adenocarcinoma_duodenum_temoral_signet_gall
第一阶段CAGE峰值
此共表达簇上的丰富路径<b>摘要：典型路径基因集是从Reactome、Wikipathys和KEGG中编译而来的。对于主要的信号通路，转录调控基因（下游靶点）是从Netpath获得的。综合起来，典型途径和下游靶点总计489个人类基因集。利用同源基因数据库通过同源性推断出相应的小家鼠基因集。通过超几何概率评估共表达簇中包括的489个经典途径和基因集中的每一个的富集度。然后，采用Benjamini-Hochberg方法对所得P值进行调整，以进行多重比较<br><b>分析师：Emmanuel Dimont链接到源数据集数据
此共表达无结果
此共表达簇上的丰富基因本体术语<b>摘要：共表达簇的GOStat分析结果。使用GOStat（PMID:14962934）和默认参数对启动子映射到至少两个不同基因的每个簇进行分析<br><b>分析师：Erik Arner链接到源数据集数据
无GOStat结果
此共同表达集群上的丰富示例本体术语<b>摘要：</b>为了总结1000个样本中的启动子活性（TSS区域的表达谱），我们基于FANTOM5样本本体（FF本体）进行了富集分析。这里的问题是“在哪种类型的样本中启动子更活跃”。为了回答这个问题，我们使用Mann-Whitney秩和检验比较了与样本本体术语相关的样本和其余样本中的表达式（TPM）。为了总结在这个共表达集群中丰富的本体，我们对组成的所有启动子的平均表达谱进行了相同的分析<b> 分析师：Hideya Kawaji链接到源数据集uberon_data（超级数据）<br><br>
此共表达簇上过度表达的TFBS（DNA）基序<b>摘要：</b>显示的值是该共表达簇中基序过度表达的p值。因此，较小的p值意味着强烈的过度代表性<b> 分析师：Michiel de Hoon链接到源数据数据<br><br>茉莉花图案<br>数据
新颖的图案
JASPAR图案
| Motifs公司 | -log10（p值） |
|---|
| MA0003.1号机组 | 0.00367505 |
| MA0004.1号机组 | 0.197709 |
| MA0006.1号机组 | 0.0126906 |
| MA0007.1号机组 | 2.10717 |
| MA0009.1号机组 | 0.13802 |
| MA0014.1号 | 0.00060874 |
| MA0017.1号 | 1.93282 |
| MA0019.1号 | 0.254644 |
| MA0024.1号机组 | 0.0887084 |
| MA0025.1号文件 | 0.215357 |
| MA0027.1号机组 | 1.53252 |
| MA0028.1号机组 | 0.0986456 |
| MA0029.1号机组 | 0.320629 |
| MA0030.1型 | 0.63611 |
| MA0031.1号文件 | 1.82996 |
| 电话0038.1 | 0.195484 |
| MA0040.1型 | 0.327552 |
| MA0041.1号 | 0.0370302 |
| MA0042.1号 | 0.080816 |
| MA0043.1号 | 0.138185 |
| MA0046.1号 | 1.92476 |
| MA0048.1号 | 0.120186 |
| 马0050.1 | 0.179479 |
| MA0051.1号 | 0.190349 |
| MA0052.1号 | 0.679881 |
| MA0055.1号 | 0.0218415 |
| 马0056.1 | 0 |
| MA0057.1号 | 0.15104 |
| MA0058.1号 | 0.287314 |
| MA0059.1号 | 0.44398 |
| 马0060.1 | 0.0225816 |
| MA0061.1号 | 0.00434521 |
| MA0063.1号 | 0 |
| MA0066.1号 | 0.0166366 |
| MA0067.1号 | 0.343508 |
| MA0068.1号 | 1.45918 |
| 马0069.1 | 0.130432 |
| MA0070.1号 | 0.124807 |
| MA0071.1号 | 0.0114223 |
| MA0072.1号 | 0.122581 |
| MA0073.1号 | 349.148 |
| MA0074.1号 | 3.1641 |
| MA0076.1号 | 0.0979747 |
| MA0077.1号 | 0.118809 |
| MA0078.1号 | 0.328556 |
| MA0081.1号 | 0.164165 |
| MA0083.1号 | 0.141964 |
| MA0084.1号 | 0.492676 |
| MA0087.1号 | 0.385036 |
| MA0088.1号 | 0.820969 |
| 马0089.1 | 0 |
| MA0090.1号 | 0.113239 |
| MA0091.1号机组 | 0.0315475 |
| MA0092.1号 | 0.276885 |
| MA0093.1号 | 0.157701 |
| 马0095.1 | 0 |
| 马0098.1 | 0 |
| MA0100.1型 | 0.0840352 |
| MA0101.1号机组 | 0.0034773 |
| MA0103.1号 | 0.70849 |
| MA0105.1号 | 0.0263627 |
| MA0106.1号 | 0.101403 |
| MA0107.1号 | 0.000650792 |
| MA0108.2号 | 1.30552 |
| MA0109.1号 | 0 |
| MA0111.1号 | 1.46697 |
| MA0113.1号 | 0.0268335 |
| MA0114.1号 | 2.30276 |
| MA0115.1号 | 0.287686 |
| MA0116.1号 | 0.299559 |
| MA0117.1号 | 0.158276 |
| 马0119.1 | 2.39233 |
| MA0122.1号机组 | 0.514553 |
| MA0124.1号机组 | 0.717922 |
| MA0125.1号机组 | 0.204137 |
| MA0130.1号机组 | 0 |
| 马0131.1 | 0.0398892 |
| MA0132.1号机组 | 0 |
| MA0133.1号机组 | 0 |
| MA0135.1号机组 | 0.154278 |
| MA0136.1号机组 | 0.395148 |
| MA0139.1号 | 0.0371923 |
| MA0140.1号机组 | 0.299927 |
| MA0141.1号 | 0.438126 |
| MA0142.1号 | 0.450844 |
| MA0143.1号 | 0.507149 |
| MA0144.1号机组 | 0.466419 |
| MA0145.1号 | 0.130093 |
| MA0146.1号 | 0.00900826 |
| MA0147.1号 | 0.123713 |
| MA0148.1号 | 0.646533 |
| MA0149.1号 | 0.138172 |
| MA0062.2号 | 0.0439502 |
| MA0035.2号 | 0.147478 |
| MA0039.2号 | 1.09955 |
| MA0138.2号机组 | 0.599132 |
| MA0002.2号机组 | 0.381793 |
| 马0137.2 | 1.15482 |
| MA0104.2号 | 0.0460633 |
| MA0047.2号 | 0.718845 |
| MA0112.2号 | 0.763064 |
| MA0065.2号 | 1.59911 |
| MA0150.1号机组 | 0.0131861 |
| MA0151.1号 | 0 |
| MA0152.1号 | 0.528856 |
| MA0153.1号机组 | 1.69141 |
| MA0154.1号机组 | 0.563564 |
| MA0155.1号 | 3.80048 |
| MA0156.1号机组 | 0.483236 |
| MA0157.1号 | 1.09639 |
| MA0158.1号 | 0 |
| MA0159.1号机组 | 0.613807 |
| MA0160.1号 | 0.126816 |
| MA0161.1号机组 | 0 |
| MA0162.1号机组 | 0.000132684 |
| MA0163.1号机组 | 0.00160381 |
| MA0164.1号机组 | 0.0294806 |
| MA0080.2号 | 0.573786 |
| 马0018.2 | 0.102331 |
| MA0099.2号机组 | 0.0579118 |
| MA0079.2号 | 0.000220294 |
| MA0102.2号机组 | 0.524013 |
| 马0258.1 | 0.739158 |
| 马0259.1 | 0.138914 |
| 马0442.1 | 0 |
ENCODE TF ChIP-seq峰富集分析<b>摘要：</b>对于每个TF和每个共表达簇，使用Fisher精确检验将带有ENCODE TF ChIP信号的启动子数量与稳健集的其他启动子进行比较。Benjamini-Hochberg校正后，保留了ChIP显著富集（q<=0.05）的聚类<br><b>分析师：Erik Arner链接到源数据集数据
（#promoters=该共表达簇中具有TF的ChIP信号的启动子数量）
| TF公司 | #发起人 | 丰富 | p值 | q值 |
|---|
| 苏Z12#23512 | 12 | 7.42456013497228 | 7.74623847680728e-08号 | 4.65482969090492e-06 |
共表达簇的相对表达<b>总结：</b>将共表达簇与FANTOM5样本进行比较，以获得相对表达<br><b>分析师：不适用<br><br>链接到数据源数据
