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共表达簇以下为：197元

来自FANTOM5_SSTAR

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完整id:C197_tongue_esophagus_tonsil_salivary_cervix_nasal_Gingival



第一阶段CAGE峰值

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第2页@SPRR2A
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第2页@SPRR2D
第3页@SPRR2A
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第4页@SPRR2D
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第3页@SPRR2D
SPRR2A处的p4
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第5页@SPRR2D
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-
Hg19:：chr6:2751146..2751162-第1页@MYLK4
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+
Hg19:：chr7:46064019..46064047-电话：chr7:46064019..46064047
-
Hg19:：chr7:80412875..80412912-电话：chr7:80412875..80412912
-
Hg19:：chr8:143866581..143866589-电话：chr8:143866581..143866589
-
Hg19:：chr8:143866652..143866665-电话：chr8:143866652..143866665
-
Hg19:：chr9:136184568..136184572+p1@LCN1P2


此共表达簇上的丰富路径<b>摘要：典型路径基因集是从Reactome、Wikipathys和KEGG中编译而来的。对于主要的信号通路，转录调控基因（下游靶点）是从Netpath获得的。综合起来，典型途径和下游靶点总计489个人类基因集。利用同源基因数据库通过同源性推断出相应的小家鼠基因集。通过超几何概率评估共表达簇中包括的489个经典途径和基因集中的每一个的富集度。然后，采用Benjamini-Hochberg方法对所得P值进行调整，以进行多重比较<br><b>分析师：Emmanuel Dimont链接到源数据集数据

此共表达无结果

此共表达簇上的丰富基因本体术语<b>摘要：共表达簇的GOStat分析结果。使用GOStat（PMID:14962934）和默认参数对启动子映射到至少两个不同基因的每个簇进行分析<br><b>分析师：Erik Arner链接到源数据集数据

GO标识GO名称FDR校正的p值
去：0030216角质形成细胞分化1.41377271188228e-22
GO:0001533号角质信封2.09843797592739e-21
去：0008544表皮发育3.54818497190057e-18
去：0007398外胚层发育6.47311958840782e-18号
去：0007566胚胎植入9.0240676857688e-17
GO:0031424号角化作用1.15717915921942e-16
去：0009913表皮细胞分化9.09423997553288e-16号
GO:0048730号表皮形态发生2.14163868075365e-15号
转到：0009888组织发育9.8258948593668e-15号
GO:0042698号月经周期9.8258948593668e-15号
GO:0048729号组织成形1.51753803813706e-14号
去：0005856细胞骨架7.05958323542508e-13号
GO:0048609号多细胞生物的繁殖过程7.05958323542508e-13号
去：0032504多细胞生物繁殖7.05958323542508e-13号
去：0007565女性怀孕5.19500409919953e-12号
GO:0022414号再生过程1.30575350682352e-09
去：0051704多生物过程2.46426429272213e-09
GO:0048513号器官发育8.42293050941528e-09
电话：0043232细胞内非膜结合细胞器1.28987918594192e-08
转到：0043228非膜结合细胞器1.28987918594192e-08
去：0009653解剖结构形态发生5.70036548952603e-08
GO:0048856号解剖结构发育2.00814308172839e-07
GO:0048731号系统开发2.28875902185992e-07号
GO:0048869号细胞发育过程7.19033913179365e-07号
GO:0030154编号细胞分化7.19033913179365e-07号
去：0032501多细胞生物过程3.43078017666563e-06号
去：0007275多细胞生物发育7.34854023939061e-06号
去：0005882中间灯丝9.40971067965266e-06号
GO:0045111号中间丝细胞骨架9.40971067965266e-06号
去：0032502发展过程3.742863156267922电子05
GO:0044430号细胞骨架部分4.87757962062124e-05
去：0030017肌节5.39273216063763e-05
去：0030016肌原纤维邮编：7.06316225131419e-05
GO:0044449号收缩纤维部分9.97559417589415e-05
GO:0043292号收缩纤维0.000116884456891877
去：0005737细胞质0.000116884456891877
去：0032982肌球蛋白丝0.00041900365286357
去：0005863横纹肌粗丝0.00041900365286357
去：0005859肌球蛋白复合物0.00101597587724844
GO:0016460号肌球蛋白II复合物0.00104641705511306
GO:0018149号肽交联0.00104641705511306
去：0006941横纹肌收缩0.00208158898038636
GO:0044424号细胞外0.00283298113520072
电话：0050829革兰氏阴性菌的防御反应0.00746985107196519
去：0004052花生四烯酸12-脂氧合酶活性0.00746985107196519
GO:0043229号细胞内细胞器0.00845113269078566
转到：0043226细胞器0.00845113269078566
GO:0030674号蛋白质结合，桥接0.0108954268859156
GO:0016459号肌球蛋白复合物0.0146609841768646
去：0007620交配0.0167871400047718
去：0005622细胞内的0.0239417025024281
去：0005509钙离子结合0.0244490687094494
去：0003012肌肉系统过程0.0304615149269455
去：0006936肌肉收缩0.0304615149269455
去：0030280表皮结构成分0.0304615149269455
去：0004867丝氨酸型内肽酶抑制剂活性0.0307654972726924
去：0007618配合0.0346355881358288
GO:0016165号脂氧合酶0.0346355881358288
去：0051238金属离子隔离0.0368712827874512
GO:0045104号中间丝细胞骨架的组织与生物发生0.0383904072748272
去：0030018Z圆盘0.0383904072748272
GO:0045103号中间丝状工艺0.0398109792250047
GO:0000146号微丝运动活性0.0398109792250047
去：0031674I乐队0.0443788883667347



此共同表达集群上的丰富示例本体术语<b>摘要：</b>为了总结1000个样本中的启动子活性（TSS区域的表达谱），我们基于FANTOM5样本本体（FF本体）进行了富集分析。这里的问题是“在哪种类型的样本中启动子更活跃”。为了回答这个问题，我们使用Mann-Whitney秩和检验比较了与样本本体术语相关的样本和其余样本中的表达式（TPM）。为了总结在这个共表达集群中丰富的本体，我们对组成的所有启动子的平均表达谱进行了相同的分析<b> 分析师：Hideya Kawaji链接到源数据集uberon_data（超级数据）<br><br>

优步解剖
本体术语p值n个
舌头2.81e-34页三
味觉系统2.81e-34页三
未来的舌头2.81e-34页三
扁桃体4.61e-26条1
粘膜相关淋巴组织4.61e-26条1
淋巴组织4.61e-26条1
扁桃体环4.61e-26条1
阴茎5.93e-261
内含器官5.93e-261
侧板间质5.93e-261
未分化生殖器结节5.93e-261
躯体肌肉5.93e-261
脊索咽3.80电子-2310
前肠咽区3.80e-23日10
咽4.06e-2111
喉咙2014年8月28日2
开放式气管系统1.55e-13型2
上呼吸道1.51e-12号机组19
口头开场6.26e-11号文件22
成体生物1.19e-10114
食管1.54e-09年三
食管区1.54e-09年三
呼吸道段6.62e-0947
口1.90e-08年29
造口台1.90e-08年29
呼吸道8.46至0854
前肠2007年3月22日87
孔口6.39至0736
身体前部7月17日-07日62
颅颈区7月17日-07日62


此共表达簇上过度表达的TFBS（DNA）基序<b>摘要：</b>显示的值是该共表达簇中基序过度表达的p值。因此，较小的p值意味着强烈的过度代表性<b> 分析师：Michiel de Hoon链接到源数据数据<br><br>茉莉花图案<br>数据

新颖的图案



JASPAR图案

Motifs公司-log10（p值）
MA0003.1号机组2009年1月26日-08日
MA0004.1号机组0.0812785
MA0006.1号机组0.00029387
MA0007.1号机组0.153821
MA0009.1号机组0.408371
MA0014.1号8.38974电子08
MA0017.1号0.493659
MA0019.1号0.095014
MA0024.1号机组0.0827819
MA0025.1号文件0.594059
MA0027.1号机组1.51696
MA0028.1号机组0.0137016
MA0029.1号机组0.0907289
MA0030.1型0.0859679
MA0031.1号文件0.0617301
电话0038.10.0685866
MA0040.1型0.0932118
MA0041.1号0.206235
MA0042.1号0.0716627
MA0043.1号0.130603
MA0046.1号0.124984
MA0048.1号0.0623092
马0050.10.0722745
MA0051.1号0.0140693
MA0052.1号2.18329
MA0055.1号1.87324
马0056.10
MA0057.1号0.0312659
MA0058.1号0.00773719
MA0059.1号0.00758284
马0060.10.00717649
MA0061.1号0.265119
MA0063.1号0
MA0066.1号0.0147002
MA0067.1号0.332077
MA0068.1号0.193849
马0069.10.389435
MA0070.1号0.117626
MA0071.1号0.738843
MA0072.1号0.115469
MA0073.1号0.127374
MA0074.1号0.575613
MA0076.1号0.0346576
MA0077.1号0.111817
MA0078.1号0.129979
MA0081.1号0.256248
MA0083.1号0.418149
MA0084.1号0.479797
MA0087.1号0.114304
MA0088.1号0.137191
马0089.10
MA0090.1号0.100195
MA0091.1号机组2.62479
MA0092.1号0.133278
MA0093.1号0.0317968
马0095.10
马0098.10
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ENCODE TF ChIP-seq峰富集分析<b>摘要：</b>对于每个TF和每个共表达簇，使用Fisher精确检验将带有ENCODE TF ChIP信号的启动子数量与稳健集的其他启动子进行比较。Benjamini-Hochberg校正后，保留了ChIP显著富集（q<=0.05）的聚类<br><b>分析师：Erik Arner链接到源数据集数据

没有此群集的分析结果

共表达簇的相对表达<b>总结：</b>将共表达簇与FANTOM5样本进行比较，以获得相对表达<br><b>分析师：不适用<br><br>链接到数据源数据

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