完整id:C180_skeletal_heart_Heaptocyte_acute_occipital_hippocampus_middle
第一阶段CAGE峰值
此共表达簇上的丰富路径<b>摘要:典型路径基因集是从Reactome、Wikipathys和KEGG中编译而来的。对于主要的信号通路,转录调控基因(下游靶点)是从Netpath获得的。综合起来,典型途径和下游靶点总计489个人类基因集。利用同源基因数据库通过同源性推断出相应的小家鼠基因集。通过超几何概率评估共表达簇中包括的489个经典途径和基因集中的每一个的富集度。然后,采用Benjamini-Hochberg方法对所得P值进行调整,以进行多重比较<br><b>分析师:Emmanuel Dimont链接到源数据集数据
此共表达无结果
此共表达簇上的丰富基因本体术语<b>摘要:共表达簇的GOStat分析结果。使用GOStat(PMID:14962934)和默认参数对启动子映射到至少两个不同基因的每个簇进行分析<br><b>分析师:Erik Arner链接到源数据集数据
此共同表达集群上的丰富示例本体术语<b>摘要:</b>为了总结1000个样本中的启动子活性(TSS区域的表达谱),我们基于FANTOM5样本本体(FF本体)进行了富集分析。这里的问题是“在哪种类型的样本中启动子更活跃”。为了回答这个问题,我们使用Mann-Whitney秩和检验比较了与样本本体术语相关的样本和其余样本中的表达式(TPM)。为了总结在这个共表达集群中丰富的本体,我们对组成的所有启动子的平均表达谱进行了相同的分析<b> 分析师:Hideya Kawaji链接到源数据集uberon_data(超级数据)<br>疾病数据<br>
此共表达簇上过度表达的TFBS(DNA)基序<b>摘要:</b>显示的值是该共表达簇中基序过度表达的p值。因此,较小的p值意味着强烈的过度代表性<b> 分析师:Michiel de Hoon链接到源数据数据<br><br>茉莉花图案<br>数据
新颖的图案
JASPAR图案
Motifs公司 | -log10(p值) |
MA0003.1号机组 | 0 |
MA0004.1号机组 | 0.00260673 |
MA0006.1号机组 | 0.000112973 |
MA0007.1号机组 | 0.00196851 |
MA0009.1号机组 | 0.106476 |
MA0014.1号 | 0 |
MA0017.1号 | 0.000292928 |
MA0019.1号 | 0.0145471 |
MA0024.1号机组 | 0.0644828 |
MA0025.1号文件 | 0.175475 |
MA0027.1号机组 | 1.46439 |
MA0028.1号机组 | 0.000169921 |
MA0029.1号机组 | 0.0713631 |
MA0030.1型 | 0.0672343 |
MA0031.1号文件 | 0.0465722 |
电话0038.1 | 0.0471975 |
MA0040.1型 | 0.255982 |
MA0041.1号 | 0.0202287 |
MA0042.1号 | 0.0459162 |
MA0043.1号 | 0.106619 |
MA0046.1号 | 0.333015 |
MA0048.1号 | 1.88169e-09 |
马0050.1 | 0.00216419 |
MA0051.1号 | 0.00890693 |
MA0052.1号 | 0.0749729 |
MA0055.1号 | 1.65593e-11号 |
马0056.1 | 0 |
MA0057.1号 | 2.38167e-08号 |
MA0058.1号 | 0.000502429 |
MA0059.1号 | 0.00048935 |
马0060.1 | 2007年6月21日-05日 |
MA0061.1号 | 2014年2月29日-07日 |
MA0063.1号 | 0 |
MA0066.1号 | 0.00935718 |
MA0067.1号 | 0.294478 |
MA0068.1号 | 8.34177e-06号 |
马0069.1 | 0.0998855 |
MA0070.1号 | 0.650463 |
MA0071.1号 | 0.00603941 |
MA0072.1号 | 0.093111 |
MA0073.1号 | 0 |
MA0074.1号 | 0.00883558 |
MA0076.1号 | 0.000688379 |
MA0077.1号 | 0.0898728 |
MA0078.1号 | 0.0223541 |
MA0081.1号 | 0.000490982 |
MA0083.1号 | 0.109916 |
MA0084.1号 | 0.43698 |
MA0087.1号 | 0.0920771 |
MA0088.1号 | 1.02593e-10 |
马0089.1 | 0 |
MA0090.1号 | 0.000902456 |
MA0091.1号机组 | 0.00270748 |
MA0092.1号 | 0.00151369 |
MA0093.1号 | 0.00112333 |
马0095.1 | 0 |
马0098.1 | 0 |
MA0100.1型 | 0.0107507 |
MA0101.1号机组 | 0.000133124 |
MA0103.1号 | 0.00404296 |
MA0105.1号 | 3.54892e-10页 |
MA0106.1号 | 0.0140309 |
MA0107.1号 | 1.45596e-05号 |
MA0108.2号 | 0.0457009 |
MA0109.1号 | 0 |
MA0111.1号 | 0.00114851 |
MA0113.1号 | 0.0162992 |
MA0114.1号 | 0.000139462 |
MA0115.1号 | 0.242118 |
MA0116.1号 | 1.64375e-05 |
MA0117.1号 | 0.124249 |
马0119.1 | 0.000348463 |
MA0122.1号机组 | 0.137275 |
MA0124.1号机组 | 0.21537 |
MA0125.1号机组 | 0.165293 |
MA0130.1号机组 | 0 |
马0131.1 | 0.0257778 |
MA0132.1号机组 | 0 |
MA0133.1号机组 | 0 |
MA0135.1号机组 | 0.383334 |
MA0136.1号机组 | 0.0100269 |
MA0139.1号 | 1974年3月4日-05日 |
MA0140.1号机组 | 0.00585093 |
MA0141.1号 | 0.0037082 |
MA0142.1号 | 0.0380114 |
MA0143.1号 | 0.0163249 |
MA0144.1号机组 | 7.12455电子06 |
MA0145.1号 | 1.52722e-11号机组 |
MA0146.1号 | 1.03566e-08号 |
MA0147.1号 | 1.85409e-05 |
MA0148.1号 | 0.00369235 |
MA0149.1号 | 0.0052018 |
MA0062.2号 | 3.99669e-07号 |
MA0035.2号 | 0.00580167 |
MA0039.2号 | 0 |
MA0138.2号机组 | 0.0225756 |
MA0002.2号机组 | 1.58492e-05号 |
马0137.2 | 0.00173079 |
MA0104.2号 | 1.90353电子-06 |
MA0047.2号 | 0.0125001 |
MA0112.2号 | 1.82439e-10号机组 |
MA0065.2号 | 5.32925e-08号 |
MA0150.1号机组 | 0.000809456 |
MA0151.1号 | 0 |
MA0152.1号 | 0.00632458 |
MA0153.1号机组 | 0.155952 |
MA0154.1号机组 | 6.85301电子08 |
MA0155.1号 | 1.05319e-08号 |
MA0156.1号机组 | 0.000209934 |
MA0157.1号 | 0.0314791 |
MA0158.1号 | 0 |
MA0159.1号机组 | 0.000209219 |
MA0160.1号 | 0.00450714 |
MA0161.1号机组 | 0 |
MA0162.1号机组 | 3.34454电子-09 |
MA0163.1号机组 | 0 |
MA0164.1号机组 | 0.0181753 |
MA0080.2号 | 0.000122564 |
马0018.2 | 0.0142132 |
MA0099.2号机组 | 0.00635111 |
MA0079.2号 | 0 |
MA0102.2号机组 | 0.467262 |
马0258.1 | 4.88472e-06 |
马0259.1 | 2.45634e-05号 |
马0442.1 | 0 |
ENCODE TF ChIP-seq峰富集分析<b>摘要:</b>对于每个TF和每个共表达簇,使用Fisher精确检验将带有ENCODE TF ChIP信号的启动子数量与稳健集的其他启动子进行比较。Benjamini-Hochberg校正后,保留了ChIP显著富集(q<=0.05)的聚类<br><b>分析师:Erik Arner链接到源数据集数据
没有此群集的分析结果
共表达簇的相对表达<b>总结:</b>将共表达簇与FANTOM5样本进行比较,以获得相对表达<br><b>分析师:不适用<br><br>链接到数据源数据