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共表达簇以下为：155元

来自FANTOM5_SSTAR

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完整id:C155_pituitary_placenta_nonsmall_cervical_smallcell_choriocarcinoma_epitheloid



第一阶段CAGE峰值

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-
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+
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Hg19:：chr6:22294730..22294743-p6@PRL
Hg19:：chr6:22294755..22294768-p9@PRL时
Hg19:：chr6:22294783..22294799-p5@PRL
Hg19:：chr6:22294803..22294830-第7页@PRL
Hg19:：chr6:31744574..31744603-第4页@大众汽车7
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Hg19:：chr6:87795324..87795331-电话：chr6:87795324..87795331
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Hg19:：chr6:87795365..87795378-电话：chr6:87795365..87795378
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Hg19:：chr6:87804815..87804830-第1页@CGA
Hg19:：chr7:116689..116690+电话：chr7:116689..116690
+
Hg19:：chr7:130010774..130010781-电话：chr7:130010774..130010781
-
Hg19:：chr7:31003593..31003614+第2页@GHRHR
Hg19:：chr7:31003621..31003641+p3@GHRHR时
Hg19:：chr7:31006831..31006834+电话：chr7:31006831..31006834
+
Hg19:：chr8:112641680.112641681+电话：chr8:112641680..112641681
+
Hg19:：chr8:126582844..126582849-电话：chr8:126582844.126582849
-
Hg19:：chr8:143411767..143411777+电话：chr8:143411767..143411777
+
Hg19:：chr9:75733141..75733143+电话：chr9:75733141..75733143
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Hg19:：chr9:92757667..92757670+电话：chr9:92757667..92757670
+
Hg19:：chrX:103145056..103145060+邮政编码：103145056..103145060
+
Hg19:：chrX:130215564..130215579+电话：130215564..130215579
+
Hg19:：chrX:130423225..130423228-p5@IGSF1
Hg19:：chrX:45029527..45029529-p@chrX:45029527..45029529
-
Hg19:：chrX:48689717..48689744-电话：48689717..48689744
-
Hg19:：chrX:54051809..54051811+电话：54051809..54051811
+


此共表达簇上的丰富路径<b>摘要：典型路径基因集是从Reactome、Wikipathys和KEGG中编译而来的。对于主要的信号通路，转录调控基因（下游靶点）是从Netpath获得的。综合起来，典型途径和下游靶点总计489个人类基因集。利用同源基因数据库通过同源性推断出相应的小家鼠基因集。通过超几何概率评估共表达簇中包括的489个经典途径和基因集中的每一个的富集度。然后，采用Benjamini-Hochberg方法对所得P值进行调整，以进行多重比较<br><b>分析师：Emmanuel Dimont链接到源数据集数据

p.值财务总监n基因n通道姓名
1.28980561285789e-148.16446952939045e-129272神经活性配体-受体相互作用（KEGG）：04080
3.39083674685837e-07号0.0001073199830380674101GnRH信号通路（KEGG）：04912
0.0004690548717164540.0494852889660859254自身免疫性甲状腺疾病（KEGG）：05320
5.64655121093405e-070.0001191422305507087932GPCR发出信号（反应组）：REACT_14797
4.68717995579227e-060.0005933969824033024195氨基酸和衍生物的代谢（反应组）：REACT_13
2.72912932716038e-060.000431884716023136733{ARRB2743}（静态模块）：不适用



此共表达簇上的丰富基因本体术语<b>摘要：共表达簇的GOStat分析结果。使用GOStat（PMID:14962934）和默认参数对启动子映射到至少两个不同基因的每个簇进行分析<br><b>分析师：Erik Arner链接到源数据集数据

GO标识GO名称FDR校正的p值
去：0005179激素活性4.70217539406628e-06号
去：0005625可溶部分4.70217539406628e-06号
去：0007165信号转导0.000669354161378072
去：0007154小区通信0.00102865316074998
去：0008584雄性性腺发育0.00116701178172978
去：0000267细胞分数0.00116701178172978
GO:0046546号男性初级性特征的发育0.00170211124438285
去：0005102受体结合0.00170211124438285
去：0032501多细胞生物过程0.00195375485702507
GO:0046661号男性性别分化0.00199734198145008
去：0008406生殖腺发育0.00406384487868871
电话：0048608生殖结构发育0.00406384487868871
去：0007275多细胞生物发育0.00406384487868871
去：0032502发展过程0.00406384487868871
GO:0022414号再生过程0.00406384487868871
GO:0045137号初级性特征的发育0.00406384487868871
GO:0048609号多细胞生物的繁殖过程0.00406384487868871
去：0032504多细胞生物繁殖0.00406384487868871
去：0007166细胞表面受体连接信号转导0.00410264335334982
去：0030070胰岛素加工0.00410264335334982
转到：0004978促肾上腺皮质激素受体活性0.00410264335334982
GO:0016913号卵泡刺激激素活性0.00410264335334982
去：0004183羧肽酶E活性0.00410264335334982
电话：0048187抑制素β-B结合0.00410264335334982
去：0007186G蛋白偶联受体蛋白信号通路0.00477227000525781
去：0007565女性怀孕0.00477227000525781
去：0007548性别分化0.00477227000525781
去：0003006生殖发育过程0.00530528956091789
GO:0048186号抑制素β-A结合0.00656287675267367
去：0005148催乳素受体结合0.00656287675267367
去：0007187G蛋白信号，与环核苷酸第二信使偶联0.00820190560634466
GO:0048513号器官发育0.00820190560634466
GO:0048856号解剖结构发育0.00820190560634466
GO:0019935号环核苷酸介导的信号转导0.00820190560634466
去：0004968促性腺激素释放激素受体活性0.00820190560634466
转到：0060011支持细胞增殖0.00820190560634466
GO:0050954号机械刺激的感觉0.00893161013195159
去：0007605声音的感觉0.00893161013195159
GO:0048184号卵泡抑素结合0.0100925731730377
去：0007267细胞信号转导0.0142560561162987
GO:0048185号激活素结合0.0143944457968459
GO:0016486号肽类激素加工0.0160091274579621
去：0007516血细胞发育0.0160091274579621
电话：0042386血细胞分化0.017479382187223
去：0051592钙离子反应0.017479382187223
去：0004977黑素皮质素受体活性0.019232857529668
GO:0048731号系统开发0.02114152694078
去：0004999血管活性肠多肽受体活性0.026601334373413
GO:0019932号第二信使介导信号0.0276871209729411
GO:0001541号卵泡发育0.0353229218256498
去：0007530性别决定0.0389003673633559
去：0007595哺乳0.0389003673633559
去：0051704多生物过程0.0389003673633559
GO:0016500号蛋白-激素受体活性0.0392153810759798
GO:0043627号雌激素刺激反应0.0392153810759798
去：0007190腺苷酸环化酶激活0.0402575045364685
转到：0022601月经周期期0.0404270122573776
GO:0022602号月经周期过程0.0404270122573776
GO:0046983号蛋白质二聚活性0.0404270122573776
GO:0045762号腺苷酸环化酶活性的正调控0.0404270122573776
去：0031281环化酶活性的正调控0.0404270122573776
GO:0051349号裂解酶活性的正调控0.0404270122573776
GO:0042562号激素结合0.0404270122573776
GO:0008585号雌性性腺发育0.0413174251168308
GO:0046545号女性主要性特征的发展0.0430154782450233
GO:0046660号女性性别分化0.0430154782450233
GO:0042698号月经周期0.0481783978042076
去：0007292雌配子世代0.0495967772577401
转到：0010038金属离子响应0.0495967772577401



此共同表达集群上的丰富示例本体术语<b>摘要：</b>为了总结1000个样本中的启动子活性（TSS区域的表达谱），我们基于FANTOM5样本本体（FF本体）进行了富集分析。这里的问题是“在哪种类型的样本中启动子更活跃”。为了回答这个问题，我们使用Mann-Whitney秩和检验比较了与样本本体术语相关的样本和其余样本中的表达式（TPM）。为了总结在这个共表达集群中丰富的本体，我们对组成的所有启动子的平均表达谱进行了相同的分析<b> 分析师：Hideya Kawaji链接到源数据集uberon_data（超级数据）<br><br>

优步解剖
本体术语p值n个
垂体3.29e-195年2
间脑腺1.55e-98型4
神经内分泌腺1.55e-98型4
间脑4.76e-57页7
未来间脑4.76e-57页7
内分泌腺2014年2月12日35
前脑区域部分1.07e-1041
前脑1.07e-1041
前神经管1.07e-1041
未来前脑1.07e-1041
内分泌系统4.55e-1045
神经系统区域部分1.34e-08年53
大脑区域部分1.34e-08年53
神经管2008年3月28日56
神经棒2008年3月28日56
未来脊髓2008年3月28日56
神经龙骨2008年3月28日56
腺5.66e-08年59
弦前神经板2007年1月20日61
脑6.59e-0768
未来大脑6.59e-0768


此共表达簇上过度表达的TFBS（DNA）基序<b>摘要：</b>显示的值是该共表达簇中基序过度表达的p值。因此，较小的p值意味着强烈的过度代表性<b> 分析师：Michiel de Hoon链接到源数据数据<br><br>茉莉花图案<br>数据

新颖的图案



JASPAR图案

Motifs公司-log10（p值）
MA0003.1号机组1.22249e-07号
MA0004.1号机组0.258678
MA0006.1号机组0.127228
MA0007.1号机组0.122597
MA0009.1号机组0.974804
MA0014.1号1.05304e-08号
MA0017.1号0.619526
MA0019.1号0.0421399
MA0024.1号机组0.0451994
MA0025.1号文件0.4335
MA0027.1号机组1.39806
MA0028.1号机组0.00237158
MA0029.1号机组0.740911
MA0030.1型0.402604
MA0031.1号文件0.127261
电话0038.10.181784
MA0040.1型0.431833
MA0041.1号0.466281
MA0042.1号0.230679
MA0043.1号0.0800788
MA0046.1号0.26244
MA0048.1号0.834657
马0050.10.232473
MA0051.1号0.0796943
MA0052.1号0.438484
MA0055.1号6.1232
马0056.10
MA0057.1号0.0813124
MA0058.1号0.171046
MA0059.1号0.560635
马0060.10.011294
MA0061.1号0.0364308
MA0063.1号0
MA0066.1号0.182363
MA0067.1号0.249504
MA0068.1号0.176467
马0069.10.258385
MA0070.1号0.0702856
MA0071.1号0.873712
MA0072.1号0.888954
MA0073.1号0.0449156
MA0074.1号0.0791662
MA0076.1号0.00198607
MA0077.1号0.867625
MA0078.1号0.168469
MA0081.1号0.0957584
MA0083.1号0.282188
MA0084.1号0.384661
MA0087.1号0.882168
MA0088.1号0.000977818
马0089.10
MA0090.1号0.940439
MA0091.1号机组4.30232
MA0092.1号0.308568
MA0093.1号0.132707
马0095.10
马0098.10
MA0100.1型0.0314397
MA0101.1号机组0.326014
MA0103.1号0.883413
MA0105.1号0.00184735
MA0106.1号0.00779354
MA0107.1号0.118639
MA0108.2号1.69308
MA0109.1号0
MA0111.1号0.0855886
MA0113.1号0.130629
MA0114.1号0.168451
MA0115.1号1.73094
MA0116.1号0.0767083
MA0117.1号0.0951982
马0119.10.139585
MA0122.1号机组0.10652
MA0124.1号机组0.176386
MA0125.1号机组0.131237
MA0130.1号机组0
马0131.10.0157595
MA0132.1号机组0
MA0133.1号机组0
MA0135.1号机组2.79263
MA0136.1号机组0.548378
MA0139.1号0.159018
MA0140.1号机组0.0561548
MA0141.1号0.165287
MA0142.1号0.257034
MA0143.1号0.269374
MA0144.1号机组0.647201
MA0145.1号0.00221987
MA0146.1号1.05505e-06号
MA0147.1号0.0817954
MA0148.1号1.91706
MA0149.1号0.0154146
MA0062.2号1939e-05年3月3日
MA0035.2号0.129625
MA0039.2号1.06444e-07号
MA0138.2号机组0.169805
MA0002.2号机组0.195358
马0137.20.265784
MA0104.2号0.0704467
MA0047.2号1.97851
MA0112.2号0.00496636
MA0065.2号0.0751904
MA0150.1号机组0.344369
MA0151.1号0
MA0152.1号0.0599421
MA0153.1号机组0.122947
MA0154.1号机组0.046133
MA0155.1号0.815797
MA0156.1号机组0.0258084
MA0157.1号0.0198457
MA0158.1号0
MA0159.1号机组0.294742
MA0160.1号0.765441
MA0161.1号机组0
MA0162.1号机组3.3284e-05
MA0163.1号机组0.000879552
MA0164.1号机组0.757991
MA0080.2号0.00627249
马0018.20.663246
MA0099.2号机组0.00310208
MA0079.2号1.01254e-14
MA0102.2号机组0.413769
马0258.10.00381001
马0259.10.152412
马0442.10



ENCODE TF ChIP-seq峰富集分析<b>摘要：</b>对于每个TF和每个共表达簇，使用Fisher精确检验将带有ENCODE TF ChIP信号的启动子数量与稳健集的其他启动子进行比较。Benjamini-Hochberg校正后，保留了ChIP显著富集（q<=0.05）的聚类<br><b>分析师：Erik Arner链接到源数据集数据

没有此群集的分析结果

共表达簇的相对表达<b>总结：</b>将共表达簇与FANTOM5样本进行比较，以获得相对表达<br><b>分析师：不适用<br><br>链接到数据源数据

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