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共表达簇以下为：第140页

来自FANTOM5_SSTAR

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完整id:C140_Renal_Endothelial_Heapatic_Lymphatic_cheart_lung_spleen



第一阶段CAGE峰值

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p1@uc010fca.1页
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Hg19:：chr4:55991752..55991770-KDR条件下的p1
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Hg19:：chr6:12290586..12290600+p1@EDN1
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+
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+
Hg19:：chr9:139557360..139557376+第1页@EGFL7
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+
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-
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-
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Hg19:：chrX:128788923..128788942-p1@APLN
Hg19:：chrX:71299684..71299699+p@chrX:71299684.71299699
+


此共表达簇上的丰富路径<b>摘要：典型路径基因集是从Reactome、Wikipathys和KEGG中编译而来的。对于主要的信号通路，转录调控基因（下游靶点）是从Netpath获得的。综合起来，典型途径和下游靶点总计489个人类基因集。利用同源基因数据库通过同源性推断出相应的小家鼠基因集。通过超几何概率评估共表达簇中包括的489个经典途径和基因集中的每一个的富集度。然后，采用Benjamini-Hochberg方法对所得P值进行调整，以进行多重比较<br><b>分析师：Emmanuel Dimont链接到源数据集数据

p.值财务总监n基因n通道姓名
1.23161703778041e-050.00779613584915002三23血管生成（Wikipaths）：WP1539



此共表达簇上的丰富基因本体术语<b>摘要：共表达簇的GOStat分析结果。使用GOStat（PMID:14962934）和默认参数对启动子映射到至少两个不同基因的每个簇进行分析<br><b>分析师：Erik Arner链接到源数据集数据

GO标识GO名称FDR校正的p值
GO:0001525号血管生成2.11374324114935e-10号
GO:0048514号血管形态发生3.33452412540309e-10号
GO:0048646号解剖结构形成3.33452412540309e-10号
GO:0001568号血管发育4.18728600634572e-10号
GO:0001944号脉管发育4.18728600634572e-10
去：0009887器官形态发生1.54920920309376e-08号
去：0007165信号转导6.78298039940112e-07号
GO:0048513号器官发育6.78298039940112e-07号
去：0007154小区通信6.78298039940112e-07号
GO:0048731号系统开发3.1700273590176e-05号
去：0009653解剖结构形态发生0.000175551122952142
去：0007275多细胞生物发育0.000259341093388208
GO:0048856号解剖结构发育0.000288362204070747
GO:0044459号质膜部分0.00108525939425613
去：0005515蛋白质结合0.00161340307696319
GO:0016020编号薄膜0.00254974465118234
去：0032502发展过程0.00254974465118234
去：0005886质膜0.00287052046562877
转到：0008015血液循环0.00287052046562877
转到：0003013循环系统过程0.00287052046562877
去：0005085鸟苷酸-核苷酸交换因子活性0.00287052046562877
去：0032501多细胞生物过程0.00287052046562877
去：0030334细胞迁移的调控0.00287052046562877
去：0005088鸟嘌呤核苷酸交换因子活性0.00300668146559652
转到：0001569血管图样0.00098741670999624
去：0051270细胞运动的调节0.00385109523932316
编号：0040012运动调节0.00420797208421217
GO:0040011号运动0.00422711851243521
去：0007178跨膜受体蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶信号通路0.00459854589949203
GO:0001570号血管生成0.00713528780788853
去：0004871信号传感器活动0.00739650586127434
GO:0060089号分子传感器活性0.00739650586127434
去：0007242细胞内信号级联0.0115242194591448
去：0030695GTPase调节器活性0.0115997662814792
去：0035295管子开发0.013033832245552
转到：0005887与质膜成一体0.013033832245552
去：0050794细胞过程的调节0.013033832245552
去：0009880胚胎图案规格0.013033832245552
电话：0048754管的分枝形态发生0.013033832245552
去：0007166细胞表面受体连接信号转导0.013033832245552
电话：0031226质膜固有的0.013033832245552
去：0005102受体结合0.0132932641457088
GO:0019199号跨膜受体蛋白激酶活性0.0139364903259838
转到：0001763分支结构的形态发生0.0148506915197131
去：0007167酶联受体蛋白信号通路0.0148506915197131
去：0051216软骨发育0.0148506915197131
GO:0048523号细胞过程的负调控0.0148506915197131
GO:0043179号节律性兴奋0.0148506915197131
去：0032352激素代谢过程的正调控0.0148506915197131
去：0032346醛固酮代谢过程的正调控0.0148506915197131
GO:0030214号透明质酸分解代谢过程0.0148506915197131
去：0032344醛固酮代谢过程的调控0.0148506915197131
去：0008212盐皮质激素代谢过程0.0148506915197131
去：0031583G蛋白信号传导，磷脂酶D激活途径0.0148506915197131
去：0032341醛固酮代谢过程0.0148506915197131
去：0031705蛙皮素受体结合0.0148506915197131
去：0032349醛固酮生物合成过程的正调控0.0148506915197131
GO:0045602号内皮细胞分化的负调控0.0148506915197131
去：0031708内皮素B受体结合0.0148506915197131
GO:0046886号激素生物合成过程的正向调节0.0148506915197131
去：0032347醛固酮生物合成过程的调控0.0148506915197131
去：0006705盐皮质激素生物合成过程0.0148506915197131
GO:0060024号节律性突触传递0.0148506915197131
去：0031707内皮素A受体结合0.0148506915197131
去：0032342醛固酮生物合成过程0.0148506915197131
去：0005089Rho鸟苷酸-核苷酸交换因子活性0.0152219150871958
去：0005178整合素结合0.0167492685695314
GO:0016337号细胞间粘附0.0167617032908913
去：0035023Rho蛋白信号转导的调控0.0167617032908913
GO:0048519号生物过程的负调控0.0167617032908913
去：0005096GTPase激活剂活性0.0167617032908913
去：0007264小GTPase介导的信号转导0.0171055130606644
去：0007611学习和/或记忆0.0176838383971589
去：0000267细胞分数0.019491218977117
去：0007243蛋白激酶级联0.020681995047378
GO:0050789号生物过程调节0.020681995047378
去：0007219Notch信号通路0.020681995047378
去：0007179转化生长因子β受体信号通路0.020681995047378
去：0006928细胞运动0.020681995047378
GO:0051674号细胞定位0.020681995047378
去：0007266Rho蛋白信号转导0.020681995047378
GO:0044425号膜部件0.020681995047378
GO:0048522号细胞过程的正调控0.020681995047378
去：0004161二甲基烯丙基转移酶活性0.020681995047378
GO:0046885号激素生物合成过程的调控0.020681995047378
GO:0045601号内皮细胞分化的调控0.020681995047378
通过：0032350激素代谢过程的调节0.020681995047378
GO:0043266号钾离子转运的调控0.020681995047378
GO:0016512号内皮素转换酶1活性0.020681995047378
GO:0043267号钾离子转运的负调控0.020681995047378
去：0030818cAMP生物合成过程的负调控0.020681995047378
去：0004337香叶基转移酶活性0.020681995047378
去：0030815cAMP代谢过程的负调控0.020681995047378
转到：0022610生物粘附0.020681995047378
GO:0007155号细胞粘附0.020681995047378
去：0008217血压调节0.0208876090183414
GO:0019992号二酰甘油结合0.0237273639474397
去：0006357RNA聚合酶II启动子转录调控0.0244904002179798
GO:0048609号多细胞生物的繁殖过程0.0245692223867628
去：0032504多细胞生物繁殖0.0245692223867628
去：0030054细胞结0.0249804018170239
去：0035313伤口愈合，表皮细胞扩散0.0260506721266188
GO:0051895号焦点粘连形成的负调控0.0260506721266188
去：0030800环核苷酸代谢过程的负调控0.0260506721266188
GO:0051926号钙离子转运的负调控0.0260506721266188
去：0030809核苷酸生物合成过程的负调控0.0260506721266188
GO:0042474号中耳形态发生0.0260506721266188
GO:0050431号转化生长因子β结合0.0260506721266188
GO:0017112号Rab鸟苷酸-核苷酸交换因子活性0.0260506721266188
GO:0045940号类固醇代谢过程的正调控0.0260506721266188
去：0030803环核苷酸生物合成过程的负调控0.0260506721266188
去：0008047酶激活剂活性0.0277268203388958
GO:0048518号生物过程的正向调节0.0284296971339626
去：0008283细胞增殖0.0285356183144314
GO:0016477号细胞迁移0.0285356183144314
GO:0048869号细胞发育过程0.0285356183144314
GO:0030154编号细胞分化0.0285356183144314
去：0005625可溶部分0.0285356183144314
去：0031252前缘0.0285356183144314
GO:0042127号细胞增殖的调节0.0287805204218956
去：0005083小GTPase调节器活性0.0294031444630966
去：0005509钙离子结合0.0294096443542626
GO:0002028编号钠离子转运的调节0.0294096443542626
GO:0016361号激活素受体活性，I型0.0294096443542626
去：0043271离子输运的负调控0.0294096443542626
GO:0048662号平滑肌细胞增殖的负调控0.0294096443542626
去：0007044电池-基板连接组件0.0294096443542626
GO:0051893号焦点粘附形成的调节0.0294096443542626
GO:0016511号内皮素转换酶活性0.0294096443542626
GO:0001542号卵泡排卵0.0294096443542626
GO:0030147号尿钠排泄0.0294096443542626
去：0009966信号转导的调节0.0334764827654863
去：0035239管形态发生0.0341296992268949
GO:0030728号排卵0.0341296992268949
去：0031663脂多糖介导的信号通路0.0341296992268949
去：0005161血小板衍生生长因子受体结合0.0341296992268949
去：0030817cAMP生物合成过程的调控0.0341296992268949
去：0003091肾水稳态0.0341296992268949
GO:0043204号核周体0.0341296992268949
GO:0030146号利尿0.0341296992268949
去：0050785晚期糖基化终产物受体活性0.0341296992268949
GO:0043086号催化活性的负调节0.0345027212697935
去：0006468蛋白氨基酸磷酸化0.0351613870136064
去：0005923紧密连接0.0353020665695773
去：0006694类固醇生物合成过程0.0353020665695773
GO:0045941号转录的正调控0.0362924477264727
GO:0016021编号与膜集成0.0362924477264727
去：0006026氨基多糖分解代谢过程0.0362924477264727
GO:0043197号树突棘0.0362924477264727
GO:0017002号激活素受体活性0.0362924477264727
去：0030802环核苷酸生物合成过程的调控0.0362924477264727
去：0051346水解酶活性的负调控0.0362924477264727
去：0030808核苷酸生物合成过程的调控0.0362924477264727
去：0005025转化生长因子β受体活性，I型0.0362924477264727
GO:0051482号G蛋白信号传导期间胞浆钙离子浓度升高，与IP3第二信使（磷脂酶C激活）耦合0.0362924477264727
去：0006027糖胺聚糖分解代谢过程0.0362924477264727
GO:0045980号核苷酸代谢过程的负调控0.0362924477264727
去：0030814cAMP代谢过程的调节0.0362924477264727
GO:0048185号激活素结合0.0362924477264727
去：0065007生物调节0.037269427936824
去：0031224膜固有的0.037269427936824
GO:0045935号碱基、核苷、核苷酸和核酸代谢过程的正调控0.037269427936824
GO:0044464号电池部件0.0384039828222961
去：0007610行为0.038563865296694
去：0032403蛋白质复合物结合0.0395517057274204
去：0004517一氧化氮合酶活性0.039806510300465
GO:0001953号细胞基质粘附的负调控0.039806510300465
去：0030799环核苷酸代谢过程的调控0.039806510300465
GO:0030104编号水平衡0.039806510300465
GO:0043296号顶端连接复合体0.0398555597965433
转到：0009888组织发育0.0408373114722924
GO:0016327号顶外侧质膜0.040866500537183
GO:0042995号细胞投影0.0432736643684624
去：0004714跨膜受体蛋白酪氨酸激酶活性0.0433830832959671
GO:0018987号渗透调节0.0439011016156574
去：0006793磷代谢过程0.0470645470973383
去：0006796磷酸盐代谢过程0.0470645470973383
GO:0019229号血管收缩调节0.0477164577152317
去：0003014肾系统过程0.0477164577152317
电话：0051899膜去极化0.0477164577152317
去：0005112开槽装订0.0477164577152317



此共同表达集群上的丰富示例本体术语<b>摘要：</b>为了总结1000个样本中的启动子活性（TSS区域的表达谱），我们基于FANTOM5样本本体（FF本体）进行了富集分析。这里的问题是“在哪种类型的样本中启动子更活跃”。为了回答这个问题，我们使用Mann-Whitney秩和检验比较了与样本本体术语相关的样本和其余样本中的表达式（TPM）。为了总结在这个共表达集群中丰富的本体，我们对组成的所有启动子的平均表达谱进行了相同的分析<b> 分析师：Hideya Kawaji链接到源数据集单元格_数据<br>uberon_data（超级数据）<br><br>

单元格类型
本体术语p值n个
血管树内皮细胞3.22e-33页24
内皮细胞2.02e-32页36
血管内皮细胞1.78电子-2518
胚胎血管内皮祖细胞1.78e-25页18
中上皮细胞1.51e-2345
衬里电池9月3日至16日58
屏障电池9.33e-16日58
动脉内皮细胞1.47e-139
静脉内皮细胞1.54e-09年6
主动脉内皮细胞1.58e-096
淋巴管母细胞2.87e-096
淋巴管内皮细胞2.87e-096
血管淋巴管母细胞2.87e-096
优步解剖
本体术语p值n个
成体生物5.19e-57页114
解剖导管6.94e-32页240
管2.67电子29192
解剖簇2.63e-27页373
血管内皮1.78e-25页18
内皮1.78e-25页18
心血管系统内皮1.78e-25页18
单纯鳞状上皮1.43e-1922
神经管3.68电子1956
神经棒3.68e-19页56
未来脊髓3.68e-19页56
神经龙骨3.68e-19页56
侧板中胚层内脏层2.76e-1883
容器3.39e-17号68
神经系统区域部分3.72e-1753
大脑区域部分3.72e-1753
细胞层4.04e-17309
上皮1.62e-16306
鳞状上皮2.08e-16日25
神经嵴对发育有贡献的结构3.96e-16页132
循环系统4.46e-16页112
神经板4.02e-15日82
假定神经板4.02e-15日82
脉管系统2014年3月7日78
血管系统2014年3月7日78
心血管系统3.91e-14页109
神经外胚层7.70e-14页86
前脑区域部分8.26e-14页41
前脑8.26e-14页41
前神经管8.26e-14页41
未来前脑8.26e-14页41
内皮管1.47e-13号机组9
动脉系统内皮1.47e-13号机组9
动脉内皮1.47e-13号机组9
上皮管1.48e-13号机组117
上皮管两端开口3.04e-13年59
血管3.04e-13年59
血管系统3.04e-13年59
血管索3.04e-13年59
中枢神经系统2013年9月9日81
脑1.81e-1268
未来大脑1.81e-1268
脑灰质4.00e-12日34
灰质4.00e-12日34
端脑6.07e-12日34
复合器官3.50e-11页68
多细胞生物9月6日-11日656
端脑区域部分1.02e-1032
大脑半球1.06e-1032
解剖系统1.60至10624
解剖群1.93e-10号机组625
多组织结构2.07e-10年342
神经系统2.28e-10页89
外髓氦4.04e-10104
初级循环器官1.45e-09年27
器官系统细分4.78e-09年223
大脑皮层区域部分2009年5月32日22
新皮质7月17日至09日20
弦前神经板2008年3月23日61
胚胎结构2.97e-08年564
淋巴系统3.34e-0810
胚层2008年4月25日560
胚层/神经嵴4.25e-08年560
胚胎组织4.25e-08年560
假定结构4.25e-08年560
胚层/神经嵴衍生结构4.25e-08年560
表皮母细胞（普通）2008年4月25日560
胚胎5.86e-08592
发育解剖结构2009年7月至2008年7月581
静脉2008年7月36日9
静脉血管2008年7月36日9
静脉系统2008年7月36日9
器官部分2007年1月26日218
大脑皮层1.73e-07年7月25
大脑皮层1.73e-07年7月25
心3.77e-07日24
原始心导管3.77e-07日24
原发性心脏场3.77e-07日24
前外侧板中胚层3.77e-07日24
心脏导管3.77e-07日24
心脏原基3.77e-07日24
心脏中胚层3.77e-07日24
心原板3.77e-07日24
心脏原基3.77e-07日24


此共表达簇上过度表达的TFBS（DNA）基序<b>摘要：</b>显示的值是该共表达簇中基序过度表达的p值。因此，较小的p值意味着强烈的过度代表性<b> 分析师：Michiel de Hoon链接到源数据数据<br><br>茉莉花图案<br>数据

新颖的图案



JASPAR图案

Motifs公司-log10（p值）
MA0003.1号机组6.4003
MA0004.1号机组0.172938
MA0006.1号机组0.117267
MA0007.1号机组0.371436
MA0009.1号机组0.832098
MA0014.1号6.24326
MA0017.1号0.299258
MA0019.1号0.0812311
MA0024.1号机组0.0325915
MA0025.1号文件0.114657
MA0027.1号机组1.3442
MA0028.1号机组0.330025
MA0029.1号机组0.0370918
MA0030.1型0.0343776
MA0031.1号文件0.0214681
电话0038.10.394336
MA0040.1型0.0385281
MA0041.1号0.00517715
MA0042.1号0.00303573
MA0043.1号0.0616603
MA0046.1号0.0580212
MA0048.1号1.71295
马0050.10.00308354
MA0051.1号0.0155214
MA0052.1号0.0394966
MA0055.1号0.177013
马0056.10
MA0057.1号4.94042
MA0058.1号0.267364
MA0059.1号0.383882
马0060.10.0824493
MA0061.1号1.33643
MA0063.1号0
MA0066.1号0.125353
MA0067.1号0.616091
MA0068.1号2.03964
马0069.10.207539
MA0070.1号0.0533368
MA0071.1号0.671149
MA0072.1号0.0519821
MA0073.1号5.98735
MA0074.1号0.815971
MA0076.1号0.0324962
MA0077.1号0.415916
MA0078.1号0.437629
MA0081.1号1.95449
MA0083.1号0.0640654
MA0084.1号0.343749
MA0087.1号0.0512539
MA0088.1号3.32209
马0089.10
MA0090.1号0.690922
MA0091.1号机组0.0440436
MA0092.1号0.648732
MA0093.1号0.192328
马0095.10
马0098.10
MA0100.1型0.901833
MA0101.1号机组2.7761
MA0103.1号0.242067
MA0105.1号4.88291
MA0106.1号1.03246
MA0107.1号3.03075
MA0108.2号0.437466
MA0109.1号0
MA0111.1号0.987043
MA0113.1号1.11394
MA0114.1号0.199108
MA0115.1号0.169944
MA0116.1号7.90959
MA0117.1号0.550586
马0119.12.73072
MA0122.1号机组0.0845942
MA0124.1号机组0.14739
MA0125.1号机组0.106507
MA0130.1号机组0
马0131.10.281138
MA0132.1号机组0
MA0133.1号机组0
MA0135.1号机组0.0720573
MA0136.1号机组1.16131
MA0139.1号3.50925
MA0140.1号机组1.8382
MA0141.1号0.377361
MA0142.1号0.0165166
MA0143.1号0.0904166
MA0144.1号机组0.659037
MA0145.1号3.64043
MA0146.1号12.9111
MA0147.1号0.0676417
MA0148.1号0.0217316
MA0149.1号0.156099
MA0062.2号1.44309
MA0035.2号1.17556
MA0039.2号9.61879
MA0138.2号机组0.4406
MA0002.2号机组0.270873
马0137.20.246704
MA0104.2号0.0505874
MA0047.2号0.00387052
MA0112.2号2.27706
MA0065.2号2.23266
MA0150.1号机组0.139025
MA0151.1号0
MA0152.1号0.179981
MA0153.1号机组0.0991135
MA0154.1号机组3.41096
MA0155.1号5.56465
MA0156.1号机组4.24371
MA0157.1号0.0619309
MA0158.1号0
MA0159.1号机组4.23857
MA0160.1号0.140487
MA0161.1号机组0
MA0162.1号机组2.48234
MA0163.1号机组10.1525
MA0164.1号机组0.0998519
MA0080.2号2.40025
马0018.20.026092
MA0099.2号机组0.180528
MA0079.2号16.1004
MA0102.2号机组0.371785
马0258.10.58359
马0259.10.272638
马0442.10



ENCODE TF ChIP-seq峰富集分析<b>摘要：</b>对于每个TF和每个共表达簇，使用Fisher精确检验将带有ENCODE TF ChIP信号的启动子数量与稳健集的其他启动子进行比较。Benjamini-Hochberg校正后，保留了ChIP显著富集（q<=0.05）的聚类<br><b>分析师：Erik Arner链接到源数据集数据

（#promoters=该共表达簇中具有TF的ChIP信号的启动子数量）

TF公司#发起人丰富p值q值
FOS编号2353312.213782655362911.58301408387071e-050.000370276389485719
GATA2#2624393.944859822290524.17751574144885e-14号6.83848850346672e-12
POLR2A#5430901.533895126112911.36592983118522e-08号1.0039151698744e-06



共表达簇的相对表达<b>总结：</b>将共表达簇与FANTOM5样本进行比较，以获得相对表达<br><b>分析师：不适用<br><br>链接到数据源数据

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