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书
- Neil Shubin（2013-01-08）。《内在宇宙：发现岩石、行星和人类的共同历史》（第2页），兰登书屋公司，Kindle版。
- “我们身体中的每个器官、细胞和DNA片段都有超过35亿年的生命史。因此，人类故事的线索存在于岩石中的蠕虫、鱼类的DNA和池塘中的海藻丛……蠕虫、鱼和海藻只是通往更深层联系的大门，这种联系可以追溯到数十亿年前在生命和地球本身存在之前。我们心中写着星星的诞生，天体在天空中的运动，甚至是日子本身的起源。"
- 阿什克罗夫特FM.（2012）生命的火花：人体中的电纽约：诺顿，国际标准图书编号9780393078039. ||谷歌图书预览.预览了第1章和第2章，但缺少页面。
- 电在人体内不可或缺的作用的历史和当代故事，贯穿全身的连续电信号驱动器官功能及其表现形式，如视觉、运动、胚胎发育、思维仍处于生存状态弗朗西斯·阿什克罗夫特（Frances Ashcroft）是一位获奖科学家，牛津大学生理学教授，牛津大学三一学院（Trinity College Oxford）和皇家学会（Royal Society）研究员。作为国际畅销书《极端生活》的作者，她住在牛津”。
- Rosen R.（1991）生命本身：对生命的本质、起源和制造的全面探究。哥伦比亚大学出版社，纽约。国际标准图书编号0-231-07565-0|谷歌图书预览.
- 在生物学中，“生命是什么？”这个问题并不经常被问及，正是因为机器隐喻已经回答了它：“生命是一台机器。”事实上，提出其他建议被视为不科学，并被视为试图将生物学带回形而上学。。。这就是机器隐喻的遗产。我希望在本书的过程中说服读者，机器隐喻不仅仅是一点点错误；这是完全错误的，必须抛弃。
- Mayr E.（1997）进化与生命的多样性：精选论文。哈佛大学出版社贝尔纳普出版社，马萨诸塞州剑桥。
- Margulis L，Sagan D.【Niles Eldridge前言】（2000）生命是什么？加利福尼亚大学出版社。（pbk）国际标准图书编号978-0-520-22021-8.
- UC出版社描述：半个世纪前，在发现DNA之前，奥地利物理学家兼哲学家埃尔文·薛定谔（Erwin Schrödinger）重新表述了一个引人入胜的哲学问题，启发了一代科学家：生命是什么？。。。[A] 作者林恩·马古利斯（Lynn Margulis）和多里安·萨根（Dorion Sagan）以一种将严谨的科学与哲学、历史和诗歌相结合的叙事方式重新审视了这个永恒的问题。。。从细菌领域的动力学，到性与死亡的联系，再到精神与物质的理论。
- 内折精装版：“在《生命是什么》一书中，马古利斯和萨根通过对生物组织出现的层次进行新的、富有活力的解释，重新表述了薛定谔这一杰出问题的答案……它们是一个可能影响未来生物学引入的概念框架。”——E.O.威尔逊
- 注： 谷歌图书预览包含前言的在线全文和第1章的前20页（共32页）。
- Hoagland M、Dodson B、Hauck J（2001）探索生命的运作方式：生物学。Jones and Bartlett Publishers，Inc，安大略省米西索加十亿英镑0-7637-1688-X （针对年轻人。插图文本。）
- Kirschner MW、Gerhart JC、Norton J.（2005）生命的合理性：解决达尔文的困境。耶鲁大学出版社，纽黑文。国际标准图书编号13-978-0-300-11977-0；10-0-300-11977-1
- 里德RGB。(2007)生物突发事件：自然实验的进化。布拉德福德图书，剑桥。国际标准图书编号10:0-262-18257-2
- 海尼DT。(2008)生物热力学第二版。剑桥：剑桥大学出版社。国际标准图书编号9780521884464. |谷歌图书预览.
- 总有机碳：1。能源转换|2。热力学第一定律|3。热力学第二定律|4。吉布斯自由能理论|5。吉布斯自由能-应用|6。统计热力学|7。结合平衡|8。反应动力学|9。生物热力学前沿。附录。
文章
- Braakman R、Smith E.（2012）代谢的组成和进化逻辑（PDF）工作文件。圣菲研究所。
- 生命化学的特点是高度有序且远离热力学平衡[1]。电子通过生物圈的非平衡转移维持了这种动力学秩序。电子供体和受体之间的电位差产生的自由能可以从各种生物地球化学循环中获得[4]，但细胞内的电子转移是由少数通用电子载体介导的，它们驱动有限的有机反应阵列[5]。这些反应共同构成新陈代谢，控制着生物体内和生态系统之间的化学动力学。普遍且明显保守的代谢网络超越了所有已知物种多样性和进化变化[6,7]，并将生物圈区分为行星过程的主要类别。
- 西奥博尔德·DL。(2010)对普遍共同祖先理论的正式检验.自然465(7295):219-222.PMID 20463738号.
- 普遍共同祖先（UCA）是现代进化理论的核心支柱。正如达尔文首先提出的那样，UCA的理论假设，所有现存的陆地生物都有一个共同的遗传遗产，每个生物都是来自遥远过去的一个物种的系谱后代。。。我通过将模型选择理论应用于分子系统发育来测试UCA，重点放在一组被认为是同源的普遍保守蛋白质上。在涉及主要分类群独立祖先的广泛生物模型中，无论是否存在水平基因转移和共生融合事件，模型选择测试都支持UCA。这些结果提供了有力的统计证据，证实了所有已知生命的单系性。
- Nicholson WL（2009）。古代微型飞行器：宇宙撞击引起的微生物行星际运输。 微生物趋势17 (6): 243-50.PMID 19464895年.研究博客。[英]
- 摘要：微生物学、地球物理学和行星科学的最新发展提出了太阳系中的行星可能不是生物孤立的。因此，目前正在重新评估石精子症（微生物乘客在岩石内的行星际运输）的可能性，这对地球上和太阳系内生命的起源和进化有影响。在这里，我总结了我们目前对撞击物理、陨石的空间运输以及微生物在行星际转移中生存的潜力的理解。
- A.J.Hulbert。；Reinald Pamplona和Rochelle Buffenstein等人（2007年），“生死：动物的代谢率、膜组成和寿命",生理学评论 87 (4): 1175-1213,内政部:10.1152/physrev.00047.2006 [e（电子）]
- 摘要：动物物种之间的最大寿命差异超过了实验操作所获得的寿命差异的数量级。物种特征最大寿命的差异最初被认为是由于新陈代谢的质量比速率的变化。这被称为寿命率老化理论，是目前最普遍接受的老化解释氧化应力老化理论的基础。然而，老化的寿命率理论虽然有帮助，但并不完全足以解释最大寿命。最近，人们发现细胞膜的脂肪酸组成在物种之间有系统地变化，这是它们代谢率变化的基础。当结合以下事实时：1）脂质过氧化产物是强大的反应性分子物种，2）脂肪酸对过氧化反应的敏感性存在显著差异，膜脂肪酸组成为动物物种之间最大寿命的变化提供了一种机制解释。一个世纪前，当代谢率和寿命之间的联系首次被提出时，人们还不知道细胞膜的组成在物种之间存在差异。当考虑到每种情况下的特定膜脂肪酸组成时，生命周期理论的许多例外似乎是可以解释的。在这里，我们回顾了哺乳动物和鸟类的代谢率与最大寿命之间的联系，以及膜脂肪酸组成在决定最大寿命方面的联系作用。此外，还审查了有关放热动物和延长寿命的治疗方法（例如限制热量摄入）的更有限信息。
- Epstein IR、Pojman JA、Steinbock O（2006）导言：非平衡化学体系中的自组织。 混乱16:037101PMID 17014235
- 摘要：非平衡化学系统中的自组织领域包括对远离平衡的化学反应系统中动力学现象的研究。对该地区的系统探索始于对贝卢索夫·扎博廷斯基振荡反应的时间行为的调查，该反应于20世纪50年代在前苏联偶然发现。该场很快在可激发介质和传播前沿中发展成化学波。随着20世纪80年代振荡反应的系统设计和90年代图灵模式的发现，这些研究的范围急剧扩大。本期《焦点》中的文章概述了该领域的发展和现状。
- Hazen R（2006）大问题：什么是生活？ 新科学家第2578期，第46-51页。
- 摘录：科学家关心定义，因此他们召开会议讨论这一问题。最近一次名为“生命是什么？”的会议吸引了数百名科学家，他们与各种哲学家和神学家一起讨论这个问题。意见分歧很大，但最具争议的辩论发生在科学界。一位非常资深的脂分子专家认为，生命起源于第一个半透膜。一位同样权威的新陈代谢权威反驳说，生命始于第一个自我维持的新陈陈代谢周期。几位分子生物学家声称，恰恰相反，第一个活着的实体一定是一个携带和复制生物信息的类似RNA的遗传系统。一位矿物学家甚至明确提出了少数人的观点，即生命开始时不是作为一种有机实体，而是作为一种自我复制的矿物。
- 马伦佐D等。(2006)Entropy-driven基因组组织。 生物物理学J90:3712-21PMID 16500976
- 摘要：在细胞拥挤的环境中，活跃于细菌和人类基因组上的DNA和RNA聚合酶被建模为沿字符串间隔的珠。大聚合复合物的聚集通过增加许多小拥挤分子的熵来增加系统的熵；尽管循环干预DNA的熵成本很高，但仍会发生这种情况。定量成本/效益分析的结果与活性聚合酶在原核生物和真核生物中聚集成复制和转录“工厂”的观察结果一致。我们的结论是，热力学第二定律通过聚合酶之间的非特异性熵作用，将基因组的自组织转化为包含数千（有时是数百万）个碱基对的环。
- Morowitz H、Smith E（2006）能量流与生命的组织
- 摘录：通过代谢途径组织能量流使我们认识到传统思维中缺乏的许多形式的连续性。我们有充分的理由相信，第一次出现的新陈代谢在许多方面与现代普遍的核心合成代谢相似。新陈代谢本身成为从驱动地球化学到细胞生理学和营养生态学基础的桥梁。如果我们的故事是正确的，在益生元化学中产生合成代谢的热力学力量确保了其在随后的生命史中的稳定性。能量流不仅在机械上，而且在概念上作为驱动地球化学秩序的一种不可避免的形式，将生命嵌入到地圈中。
- Scheffer，M.&E.H.van Nes（2006），“自组织相似性，相似物种群体的进化涌现”，美国国家科学院院刊 103 (16): 6230-6235,内政部:10.1073/pnas.0508024103 [e（电子）]
- 摘要：生态学家长期以来一直对自然界中有如此多类似物种这一事实感到困惑。在这里，我们表明，自组织的类长相集群可能会从竞争对手的共同进化中自发出现。解释是，有两种不同的方式可以共存：完全不同或完全相似。使用基于经典竞争理论的模型，我们证明了沿着生态位轴有规则间隔的相似物种集群的进化出现趋势。事实上，从藻类、浮游动物、甲虫到鸟类和哺乳动物等生物的大小分布中都普遍观察到这种块状模式，早期的理论无法很好地解释。我们的结果表明，这些模式可能代表了竞争互动产生的自我构建的利基。我们发现的一个推论是，尽管在物种贫穷的群落中，同域物种形成和开放生态位的入侵是可能的，但物种饱和的群落可能以趋同进化和类长相入侵为特征。
- Walsh，D.（2006），“生物作为自然目的：当代进化的观点”，科学史与哲学研究第C部分：生物与生物医学科学史与哲学研究 37: 771-791,内政部:2016年10月10日/j.shpsc.2006.09.009 [e（电子）]
- 摘要：康德将有机体视为自然目的的概念对生物学中机械解释的充分性提出了挑战。单凭机械定律，生物体的某些特征似乎令人费解。一些生物现象似乎只能从目的论的角度来解释。当代进化生物学大体上忽视了这一挑战。人们普遍认为，达尔文的自然选择理论为我们提供了一个充分的、完全机械化的有机体本质解释。在当代生物学中，生物体的类别实际上没有起到解释作用。当代进化生物学是一门研究亚有机体复制子的科学。我认为发育生物学的最新进展证明了亚有机体机制的不足。被解释为“自然目的”的有机体类别在解释个体发育和适应性进化方面应发挥无可挑剔的作用。康德认为，生物体的自然目的性不能证明是自然界的客观原则，目的性也不能真正解释。我试图通过诉诸最近关于自组织的研究来论证，有机体的目的性是一种自然现象，并且通过诉诸不变性解释装置，生物的目的性提供了真正的、无可辩驳的生物学解释。
- Koshland DE，Jr.（2002）专题文章。生命的七根支柱。 科学类295:2215-2216PMID 11910092
- 七大支柱：程序（DNA）、即兴（进化）、隔离（与环境的边界）、能量（通过系统的能量流）、再生（部分的重新合成）、适应性（“行为”反应）、隔离性（代谢途径的隐私不受侵犯）。
访谈和评论
