生物计算

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从字面上看,生物计算指通过生物系统进行计算,特别是嵌入数学/计算操作的生物系统/过程,因此,它应用于新兴的生物学分支学科,探索和利用生物系统的使用来执行数学/计算操作,并实现数学/计算问题的解决方案,例如使用DNA分子进行计算[1]-研究生物和生命系统中的计算过程。[2][3][4]

并行计算

提出了利用分子和化学进行大规模并行计算的前景。[5]这一概念是基于对DNA等分子集合的同时分析,这些分子是“试验”溶液,并使用各种化学技巧来并行决定哪些符合问题标准。Maley提供了一种这种方法的描述。[6]事实证明,一个实际问题是错误率很高,需要仔细研究。

嵌入式控制器

生物计算的一种不同应用是管理化学疗法其基本思想是细菌被安排侵入肿瘤,选择性地产生杀死肿瘤的药物。在注入的细菌中有一个嵌入式控制器,它执行逻辑计算“如果X(X)在场,生产Y(Y)“或者可能,”如果X(X)在一定范围内,产生Y(Y)”,因此只有在存在肿瘤的地方才有条件地激活细菌。[7]

工具书类

  1. Kari L,兰德韦伯LF。(2000).“用DNA计算”.分子生物学方法:生物信息学方法和协议 132:第413-430页。
  2. Bray D.(2009)。Wetware:每个活细胞中的计算机耶鲁大学出版社。国际标准书号9780300141733. 谷歌图书预览。
  3. Landweber LF,Kari L.(1999)。“细胞计算的进化:计算问题的自然解决方案”.生物系统 52:第3-13页。
  4. Simeonov PL(2010)。“整体生物伦理学:生物理性的后牛顿观点”.生物物理和分子生物学进展:第85-121页。内政部:2016年10月10日/j.pbiomolbio.2010.01.005.研究博客.在线发布的文章证明。
  5. John H Reif(1999)。“并行生物分子计算:模型和模拟”.算法 25:第142-175页。内政部:2007年10月10日/PL00008272.研究博客.
  6. Carlo C.Maley(1998年)。“DNA计算:理论、实践与展望”.进化计算 6:第201-229页。
  7. JC Anderson,EJ Clarke,AP Arkin,CA Voigt(2005)。“工程菌对癌细胞的环境控制入侵”.分子生物学杂志,:第619页ff(关闭).内政部:2016年10月10日/j.jmb.2005.10.076.研究博客.