ECM底物的合成和表征。我们遵循了先前建立的制造规定硬度聚丙烯酰胺ECM的方法(15, 30)稍作修改(见补充材料和方法)。用人血浆纤维连接蛋白(Millipore Corp.)对所有底物进行功能化,以达到2.6μg/cm的标称表面密度2。使用Anton Paar Physica MCR 301流变仪和25 mm平行板几何形状,在37°C下测量每个凝胶配方的宏观弹性剪切模量。振幅扫描范围γ=0.1-10%用于确定线性状态;然后使用5%应变下超过0.1到10 Hz的频率扫描来提取每个样品的存储、损耗和复模量。对每个样品进行三次测量,每个条件下至少测量三个独立样品。含有最终丙烯酰胺的凝胶的弹性模量分别为0.08、0.25、0.8、19和119kPa/第二类-丙烯酰胺(A/B)百分比分别为3%A/0.05%B、4%A/0.075%B、5%A/0.1%B、8%A/0.6%B和15%A/1.2%B,如其他地方所述。三
三A.J.Keung、E.M.de Juan Pardo、D.V.Schaffer和S.Kumar。(2009). 基质硬度和Rho家族GTPase激活共同调节神经干细胞行为。手稿正在编写中。
细胞培养。U373-MG人脑胶质瘤细胞来自加州大学伯克利分校组织培养设施,U87-MG和U251-MG人胶质瘤细胞由C.David James博士(加州大学旧金山分校)提供,人SNB19和大鼠C6胶质瘤细胞则由。Andrew Wurmser(加州大学伯克利分校)。U373-MG和U87-MG细胞在补充了10%小牛血清优势(J.R.Scientific)和1%青霉素/链霉素、MEM非必需氨基酸和丙酮酸钠(Life Technologies)的DMEM(生命技术)中培养。在添加10%小牛血清和1%青霉素/链霉素的DMEM中培养SNB19、U251-MG和C6细胞。
显微镜、荧光染色和形态分析。使用倒置的尼康TE2000-E2显微镜进行全活细胞和荧光成像,该显微镜配备有一个电动可编程平台(Prior Scientific,Inc.),一个恒温箱,用于保持恒温、恒湿和一氧化碳2水平(体内Scientific)、数码相机(Photometrics Coolsnap HQ II、Roper Scientistic)和SimplePCI软件(滨松公司)。如补充材料和方法中所述,固定细胞并对其进行丝状肌动蛋白(F-actin)和管状蛋白染色。通过使用Image J软件(NIH)量化指骨样蛋白染色细胞的面积,获得细胞扩散测量值。通过聚丙烯酰胺凝胶获得的高放大外荧光图像图1和5通过对整个图像应用均匀的背景减法来增强;随后根据需要调整亮度和对比度。
细胞迁移的测量和分析。细胞以1000个细胞/cm的亚融合密度进行培养2至少在开始成像前10小时进行三次独立实验。在每个实验中,在12小时内每15分钟采集一次10×相位对比度时间差图像,每个衬底至少有10个代表性视野,每个条件至少有两个衬底。使用SimplePCI软件分析时间推移视频的代表子集,其中每个帧中每个单元的外围用于定义对象,SimplePC1的运动跟踪和分析模块用于跟踪整个时间序列中每个对象的质心。
细胞增殖的测量。如补充材料和方法中所述,使用溴脱氧尿苷(BrdUrd)测定法测量细胞增殖。
抑制细胞收缩。允许细胞粘附至少10小时后,在相关的时间间隔和免疫荧光实验中,将Rho-相关激酶(ROCK)抑制剂Y-27632(钙生物化学)、NMMII抑制剂blebbistatin(Sigma-Aldrich)和肌动蛋白聚合抑制剂细胞松弛素D(Sigma-Aldrich)添加到细胞培养基中。
统计分析。除非另有说明,否则数据报告为平均值±SE。三组或三组以上数据之间的统计比较采用单因素方差分析,然后采用Tukey-Kramer-HSD(诚实的显著差异)检验进行配对比较。一个学生的未婚t吨如果在两组数据之间进行统计比较,则进行测试。P(P)<0.01表示有统计学意义。