1887

摘要

簇状规则间隔短回文重复序列(CRISPR)及其相关的CRISPR-associated sequence(CAS)蛋白构成了广泛存在于原核生物中的新型抗病毒防御系统。重复序列被间隔物隔开,其中一些与活动遗传元件中的序列同源。虽然所涉及的整个过程仍然没有特征化,但已知在噬菌体攻击期间,新的间隔物被并入宿主的CRISPR位点,从而产生对病毒的特异性抗性。此外,已经证明这种干扰是基于携带间隔物的小RNA。这些RNA将引导防御装置识别携带与间隔物匹配序列的外来分子。尽管有这一重要作用,但间隔物吸收机制尚未得到解决。向前迈出的第一步是检测与间隔区前体(原间隔区)相关的基序揭示了该物种对供体序列的特殊识别。在这里,我们表明,对于大多数不同的CRISPR系统来说,保护原空间相邻基序(PAM)是一个共同的主题。PAM序列取决于CRISPR-CAS变体,这意味着存在一种CRISPR类型特定(基序定向)的间隔物选择,随后确定干扰目标。PAM还可以指导重复阵列中垫片的方向。值得注意的是,基于这种极性的观察结果反对将转录物RNA分子上的间隔区前体识别为一般规则。

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2009-03-01
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工具书类

  1. 阿尔特舒尔 标准F。,马登 T.L.公司。,夏弗 答:A。, J。, Z.公司。,米勒 西。,利普曼 D.J.博士。 1997;缺口blast和psi-blast:新一代蛋白质数据库搜索程序。 核酸研究25:3389–3402
    [谷歌学者]
  2. 巴兰古 R。,弗雷莫 C、。,德沃 H。,理查兹 M。,波亚瓦尔 第页。,莫伊瑙 美国。,罗梅罗 D.A.博士。,霍瓦思 第页。 2007;CRISPR对原核生物中的病毒具有获得性抵抗力。 科学类315:1709–1712
    [谷歌学者]
  3. 贝洛格拉佐娃 N。,棕色 G.公司。,齐默尔曼 医学博士。,骄傲的人 M。,马卡洛瓦 英国标准。,库德里茨卡 M。,科钦扬 美国。, 美国。,赫鲁什奇 M。 其他作者 2008;与簇状规则间隔短回文重复序列相关的序列特异性内核糖核酸酶新家族。 生物化学杂志283:20361–20371
    [谷歌学者]
  4. 博洛京 答:。,昆奎斯 B。,索罗金 答:。,埃利希 S.D.公司。 2005;簇状规则间隔的短回文重复序列(CRISPRs)具有染色体外起源的间隔。 微生物学151:2551–2561
    [谷歌学者]
  5. 布伦内克 J。,阿拉文 答:A。,完全的 答:。,达斯 M。,喀里斯 M。,萨奇达南丹 R。,汉农 G·J。 2007;离散的小RNA生成位点作为转座子活性的主调节因子果蝇属. 单元格128:1089–1103
    [谷歌学者]
  6. 布龙 S.J.公司。,乔尔 M.M.先生。,伦德格伦 M。,韦斯特拉 埃及共和国。,斯利杰奎斯 R·J。,斯尼德斯 A.P.公司。,迪克曼 医学博士。,马卡洛瓦 英国标准。,计算物理学 电动汽车。,范德奥斯特 J。 2008;小CRISPR RNA指导原核生物抗病毒防御。 科学类321:960–964
    [谷歌学者]
  7. 克鲁克斯 通用电气公司。,荣誉 G.公司。,钱多尼亚 J.米。,布伦纳 瑞典。 2004;WebLogo:序列徽标生成器。 基因组研究14:1188–1190
    [谷歌学者]
  8. DeBoy公司 R.T.公司。,蒙戈丁 E.F.公司。,艾默生 J.B.公司。,纳尔逊 英国工程师。 2006;染色体进化Thermotogales公司:CRISPR序列的大规模反转和菌株多样性。 J细菌188:2364–2374
    [谷歌学者]
  9. 德沃 H。,巴兰古 R。,加尔诺 J·E。,拉邦特 J。,弗雷莫 C、。,博亚瓦尔 第页。,罗梅罗 D.A.博士。,Horvath公司 第页。,莫伊瑙 美国。 2008;噬菌体对CRISPR编码耐药性的反应嗜热链球菌. J细菌190:1390–1400
    [谷歌学者]
  10. 蛯原 答:。,姚明 M。,马苏 R。,田中 一、。,横山 美国。,仓光 美国。 2006;假设蛋白质TTHB192的晶体结构嗜热菌HB8揭示了一个具有RNA识别模体样结构域的新蛋白家族。 蛋白质科学15:1494–1499
    [谷歌学者]
  11. 哈夫特 D.小时。,塞隆古特 J。,蒙戈丁 E.F.公司。,纳尔逊 英国工程师。 2005;原核基因组中存在45个CRISPR相关蛋白家族和多种CRISPR/Cas亚型。 公共科学图书馆计算生物学1:e60(电子60)
    [谷歌学者]
  12. 霍瓦思 第页。,罗梅罗 D.A.博士。,库特蒙伏辛 交流。,理查兹 M。,德沃 H。,莫伊瑙 美国。,波亚瓦尔 第页。,弗雷莫 C、。,巴兰古 R。 2008;CRISPR基因座的多样性、活性和进化嗜热链球菌. J细菌190:1401–1412
    [谷歌学者]
  13. Ishino公司 年。,科川 H。,马基诺 英国。,饴村 M。,中田 答:。 1987;的核苷酸序列内部审计程序负责碱性磷酸酶同工酶转换的基因大肠杆菌,以及基因产物的鉴定。 J细菌169:5429–5433
    [谷歌学者]
  14. 詹森 R。,Embden公司 J·D·。,哈斯特拉 西。,学校 L.M.公司。 2002;原核生物中与DNA重复相关的基因的鉴定。 摩尔微生物43:1565–1575
    [谷歌学者]
  15. 川崎 H。,Hayashizaki公司 年。 2008;小RNA的探索。 公共科学图书馆-基因4:第22页
    [谷歌学者]
  16. 小岛 英国。,卡内希萨 M。 2008;基于基因邻域和蛋白质结构的新型原核逆转录因子的系统调查。 分子生物学进化25:1395–1404
    [谷歌学者]
  17. 库宁 五、。,索里克 R。,雨根霍尔茨 第页。 2007;CRISPR重复序列和二级结构的进化保守性。 基因组生物学8:61兰特
    [谷歌学者]
  18. 利列斯特 R.K.公司。,Redder(红色) 第页。,加勒特 注册会计师。,布鲁格 英国。 2006;一种推测的古细胞病毒防御机制。 古生菌2:59–72
    [谷歌学者]
  19. 马卡洛娃 英国标准。,阿拉文 L。,格里申 N.V.公司。,罗戈津 I.B.投资银行。,计算物理学 E.与。 2002;通过基因组上下文分析预测的嗜热古菌和细菌的特异性DNA修复系统。 核酸研究30:482–496
    [谷歌学者]
  20. 马卡洛瓦 英国标准。,格里申 N.V.公司。,沙巴利纳 美国。, Y.I.年。,计算物理学 电动汽车。 2006;原核生物中基于RNA干扰的假定免疫系统:预测酶机制的计算分析、与真核生物RNAi的功能类似物以及假设的作用机制。 Biol直接1:7
    [谷歌学者]
  21. 曼丁 第页。,Repoila公司 F、。,维尔加索拉 M。,盖斯曼 T。,科萨尔 第页。 2007;新非编码RNA的鉴定单核细胞增生李斯特菌mRNA靶点的预测。 核酸研究35:962–974
    [谷歌学者]
  22. 莫吉卡 F·J·M。,费雷尔 C、。,朱伊兹 G.公司。,罗德里·盖兹·瓦莱拉 F、。 1995;古生菌最大的复制子中存在长距离的短串联重复序列地中海卤虫盐生火山并且可以参与复制子划分。 摩尔微生物17:85–93
    [谷歌学者]
  23. 莫吉卡 F·J·M。,Diíez-Villaseñ或 C、。,索里亚 E.公司。,朱伊兹 G.公司。 2000;古菌、细菌和线粒体基因组中一个规则间隔重复序列家族的生物学意义。 摩尔微生物36:244–246
    [谷歌学者]
  24. 莫吉卡 F·J·M。,Diíez-Villaseñ或 C、。,加尔西∙a-Marti∙nez J。,索里亚 E.公司。 2005;有规则间隔的原核重复序列的插入序列源自外来遗传元素。 J摩尔进化60:174–182
    [谷歌学者]
  25. 奥克曼 H。,塞兰德 R.K.公司。 1984;标准参考应变大肠杆菌来自自然种群。 J细菌157:690–693
    [谷歌学者]
  26. 普塞尔 C、。,萨尔维尼诺 G.公司。,维尔诺 G.公司。 2005;Y中的CRISPR元素鼠疫杆菌通过优先摄取噬菌体DNA获得新的重复序列,并为进化研究提供额外的工具。 微生物学151:653–663
    [谷歌学者]
  27. 瑞尔 M.M.先生。,贝内特 A.F.公司。, 公元。 2001;热适应的遗传结构大肠杆菌. 美国国家科学院程序98:525–530
    [谷歌学者]
  28. 施耐德 T.D.公司。,斯蒂芬斯 风险管理。 1990;序列标识:一种显示一致序列的新方式。 核酸研究18:6097–6100
    [谷歌学者]
  29. 索里克 R。,库宁 五、。,雨根霍尔茨 第页。 2008;CRISPR–一种广泛的系统,对细菌和古菌中的噬菌体提供获得性抗性。 Nat Rev微生物6:181–186
    [谷歌学者]
  30. 总高度。,巴谢勒里 J.P.公司。,罗日德斯特文斯基 T。,博尔托兰 M.L.公司。,胡贝尔 H。,德隆戈夫斯基 M。,埃尔吉 T。,布罗修斯 J。,胡登霍夫 答:。 2002;从古细菌中鉴定86个小的非信使RNA候选基因富氏古球虫. 美国国家科学院程序99:7536–7541
    [谷歌学者]
  31. 总高度。,波拉切克 N。,Zywicki公司 M。,胡贝尔 H。,布鲁格 英国。,加勒特 R。,巴谢勒里 J.P.公司。,胡登霍夫 答:。 2005;新的非编码RNA作为古细菌潜在反义调节因子的鉴定硫矿硫化叶菌. 摩尔微生物55:469–481
    [谷歌学者]
  32. 维尔科姆 D.K.博士。,Minnerup公司 J。,胡登霍夫 答:。,哈特曼 R.K.公司。 2005;实验RNomics超嗜热菌:识别小的非编码RNA和假定的6S RNA同源物。 核酸研究33:1949–1960
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