研究论文 在上共享 多元超几何相似性度量作者:香查拉 卡迪,R.米切尔 招架、和5月D日。 王作者信息和声明BCB'12:ACM生物信息学、计算生物学和生物医学会议记录2012年10月页234-241https://doi.org/10.1145/2382936.2382966出版:2012年10月7日 出版历史 获取引文提醒新增引文提醒!此警报已成功添加,将发送到:只要您选择的记录被引用,您就会收到通知。新引文提醒!拜托登录到您的帐户 获取访问权限目录BCB'12:ACM生物信息学、计算生物学和生物医学会议记录多元超几何相似性度量页234-241以前的文章利用基因表达和染色体定位的网络结构分析预测染色体结构域组织的表达相关特征上一个下一篇文章描述和比较分子结构中静电聚焦区域的体积法下一步摘要工具书类信息和贡献者文献计量学和引文获取访问权限工具书类媒体桌子分享摘要我们提出了一种基于多元超几何分布的相似性度量方法,用于图像和数据向量的成对比较。使用合成数据,将该度量与其他相似度量的公式和性能进行了比较。还实现了分段近似方法,以便于将所提出的度量应用于大样本。使用组织成像质谱(TIMS)数据介绍了所提出的相似性度量的示例应用。合成数据和TIMS数据的结果表明,所提出的度量能够在样本之间提供有意义的区分,并且它可以成为识别大规模生物数据集中潜在相关样本的有用工具。工具书类[1]Sadygov,R.G.和Yates,J.R.,2003年。使用串联质谱数据和蛋白质序列数据库进行蛋白质鉴定和验证的超几何概率模型。分析。化学。75, 15, 3792--3798.交叉引用谷歌学者[2]Shih,I.M.等人,2011年。卵巢高级别浆液性癌中ch19p13.2 NACC1基因座的扩增。现代病理学24, 5, 638--645.交叉引用谷歌学者[3]Boyack,K.W.等人,2011年。对200多万份生物医学出版物进行聚类:比较九种基于文本的相似性方法的准确性。公共科学图书馆ONE 6,3(3月)。交叉引用谷歌学者[4]Megalooikonomou,V.等人,2009年。医学图像中树状结构的表示和分类方案:分析X射线乳管造影中导管树的分支模式。IEEE T医学成像28, 4, 487--493.交叉引用谷歌学者[5]Mitchell,T.M.等人,2008年。预测与名词含义相关的人脑活动。科学320, 5880, 1191--1195.谷歌学者[6]Perlman,L.等人,2011年。结合药物和基因相似性度量来阐明药物靶点。计算机生物学杂志18, 2, 133--145.交叉引用谷歌学者[7]Yona,G.等人,2006年。表达式配置文件的有效相似性度量。生物信息学22, 13, 1616--1622.数字图书馆谷歌学者[8]Cha,S.-H.,2007年。概率密度函数之间距离/相似性度量的综合调查。国际应用科学数学模型与方法杂志1, 4, 300--307.谷歌学者[9]Li,X.B.和Dubes,R.C.,1989年。模式识别中二进制数据相似性的概率度量。图案识别22, 4, 397--409.数字图书馆谷歌学者[10]Kaddi,C.等人,2011年。组织成像质谱中用于空间分析的超几何相似性度量。IEEE BIBM 2011会议记录, 604--607数字图书馆谷歌学者[11]刘毅等,2010。卵巢癌中磺胺类药物的升高:一项综合转录组学和脂质分析,包括组织成像质谱。摩尔癌症9.谷歌学者[12]Mcdonnell,L.A.和Heeren,R.M.A.,2007年。成像质谱。质谱学第26版, 4, 606--643.交叉引用谷歌学者[13]Van De Plas,R.等人,2007年。成像质谱数据的空间查询:非负最小二乘法。计算生物学机器学习神经信息处理系统研讨会.谷歌学者[14]Freeman,G.H.和Halton,J.H.,1951年。注意对偶然性、拟合优度和其他重要问题的准确处理。生物特征38, 1-2, 141--149.交叉引用谷歌学者[15]Sprent,P.和Smeeton,北卡罗来纳州,2001年。应用的非参数统计方法查普曼和霍尔/CRC,佛罗里达州博卡拉顿。谷歌学者[16]Verbeek,A.和Kroonenberg,P.M.,1985年。具有固定边距的R X C列联表中测试统计量精确分布的算法综述。计算统计数据An 3, 3, 159--185.数字图书馆谷歌学者[17]格雷塞林,F.,2003年。计算和枚举具有给定边距的频率表。统计与应用1, 2, 87--104.谷歌学者[18]Gail,M.和Mantel,N.,1977年。计算具有固定边距的r x c列联表的数量。美国统计协会杂志72, 360, 859--862.谷歌学者[19]Nath,G.B.和Iyer,P.V.K.,1972年。关于nHr组合公式的注记。澳大利亚数学与社会杂志14, 3, 264--268.交叉引用谷歌学者[20]Anand,H.等人,1966年。一个组合分布问题。杜克数学J 33, 757--769.交叉引用谷歌学者[21]Chen,Y.F.等,2008年。使用振荡毛细管雾化器基质涂层系统的成像MALDI质谱法及其在分析Tay-Sachs/Sandhoff病小鼠模型大脑脂质中的应用。分析。化学。80, 8, 2780--2788.交叉引用谷歌学者[22]Irigoien,I.和Arenas,C.,2008年。INCA:用于估计集群数量和识别非典型单位的新统计数据。统计医学27, 15, 2948--2973.交叉引用谷歌学者 引用人查看全部卡迪C贝内特·R佩恩·M银行M韦伯A费尔南德斯F王M(2015)DetectTLC:利用定量质谱图像特征进行自动反应混合物筛选美国质谱学会杂志2007年10月10日/13361-015-1293-927:2(359-365)在线发布日期:2015年10月27日https://doi.org/10.1007/s13361-015-1293-9 索引术语 多元超几何相似性度量应用计算生命与医学计算生物学遗传学系统生物学 建议 组织成像质谱中用于空间分析的超几何相似性度量BIBM’11:2011年IEEE生物信息学和生物医学国际会议记录 组织成像质谱(TIMS)是一种用于空间生化分析的数据密集型技术。TIMS为组织分析提供分子和空间信息。我们提出并评估了一个基于超空间的相似性度量。。。阅读更多信息多元超几何相似性度量 我们提出了一种基于多元超几何分布的相似性度量方法,用于图像和数据向量的成对比较。并将该方法的公式和性能与其他相似性度量进行了比较。。。阅读更多信息用于高维文本文档聚类和分类的新型相似性度量的设计与分析CompSysTech’14:第15届计算机系统与技术国际会议记录 本研究的主要思想是首先设计相似性度量,该度量可用于查找任意两个文本文档之间的相似性,并使用相同的相似性进行聚类。。。阅读更多信息 评论 Please enable JavaScript to view thecomments powered by Disqus. 信息和贡献者问询处发布于 BCB'12:ACM生物信息学、计算生物学和生物医学会议记录2012年10月725页国际标准图书编号:9781450316705内政部:10.1145/2382936总主席:桑杰·兰卡佛罗里达大学,课程主席:塔梅尔·卡维奇佛罗里达大学,莫娜·辛格普林斯顿大学 版权所有©2012 ACM。如果复制品不是为了盈利或商业利益而制作或分发的,并且复制品的第一页载有本通知和完整引文,则允许免费制作本作品的全部或部分数字或硬拷贝以供个人或课堂使用。必须尊重ACM以外的其他人对本作品组成部分的版权。允许用信用证进行摘要。要以其他方式复制或重新发布,在服务器上发布或重新发布到列表,需要事先获得特定许可和/或付费。从请求权限[电子邮件保护]赞助商SIGBio:ACM生物信息学特别兴趣小组出版商计算机协会美国纽约州纽约市出版历史出版:2012年10月7日权限请求对此文章的权限。请求权限检查更新作者标记超几何的成像质谱法相似性限定符研究文章会议BCB’12号赞助商:SIGBio公司BCB’12:ACM生物信息学、计算生物学和生物医学国际会议2012年10月7日-10日佛罗里达州奥兰多市 接受率BCB’12论文接受率159份提交文件中的33份,21%;885份提交文件中的总体接受率254份,29%更多 贡献者 其他指标查看文章指标文献计量学和引文文献计量学 文章指标 1引文总数查看引文133总下载次数下载量(最近12个月)4下载次数(最近6周)2 其他指标查看作者指标引文 引用人查看全部卡迪C贝内特·R佩恩·M银行M韦伯A费尔南德斯F王M(2015)DetectTLC:利用定量质谱图像特征进行自动反应混合物筛选美国质谱学会杂志2007年10月10日/13361-015-1293-927:2(359-365)在线发布日期:2015年10月27日https://doi.org/10.1007/s13361-015-1293-9 视图选项获取访问权限 登录选项请检查您是否可以通过登录凭据或您的机构访问此文章以获得完全访问权限。登录完全访问权限获取此出版物 查看选项 PDF格式以PDF文件查看或下载。PDF格式 电子阅读器使用联机查看电子阅读器.电子阅读器媒体数字其他桌子分享分享共享此出版物链接复制链接已复制!复制失败。在社交媒体上分享Linkedin公司重新编辑电子邮件附属公司香查拉 卡迪佐治亚州亚特兰大乔治亚理工学院查看配置文件R.米切尔 招架佐治亚州亚特兰大乔治亚理工学院计算学院查看配置文件5月D日。 王佐治亚州亚特兰大乔治亚理工学院查看配置文件