科学家:最大似然完美系统发育推断

吴玉峰(2019)使用“ScisTree”算法从噪声单细胞数据中快速进行最大似然系统发育推断<doi:10.1093/bioinformatics/btz676>. 'scistreer提供了一个“R”接口,并通过“Rcpp”和“RcppParallel”提高了速度,使该方法适用于大规模单细胞数据集(>10000个细胞)。

版本: 1.2.0
取决于: R(≥4.1.0)
进口: ,数字播放器,ggplot2,ggtree(ggtree),记录仪,平行距离,拼凑,潘戈恩,卢比,重塑2,Rcpp并行,RhpcBLASctl公司,字符串,潮汐记录仪
链接到: 卢比,RcppArmadillo公司,Rcpp并行
建议: 测试那个(≥ 3.0.0)
出版: 2023-06-15
内政部: 10.32614/CRAN.包装.仓库
作者: 滕高[cre,aut],埃文·比德斯特特[aut],彼得·哈尔琴科[aut],吴玉凤[aut]
维护人员: 滕高(tgaoteng at gmail.com>)
许可证: GPL-3公司
网址: https://github.com/kharchenkolab/sistreer,https://kharchenkolab.github.io/sistreer(https://kharchenkola.github.io/stistreer)/
需要编译:
系统要求: GNU品牌
材料: 自述文件
CRAN检查: scistrer结果

文档:

参考手册: 科学工作者.pdf

下载内容:

程序包来源: 科学工作者_1.2.0.tar.gz
Windows二进制文件: r-devel公司:scisterer_1.2.0.zip,r版本:scisterer_1.2.0.zip,r-oldrel:scisterer_1.2.0.zip
macOS二进制文件: r释放(扶手64):剪贴画_1.2.0.tgz,r-oldrel(arm64):剪贴画_1.2.0.tgz,r-release(x86_64):剪贴画_1.2.0.tgz,r-oldrel(x86_64):科学工作者_1.2.0.tgz
旧来源: 科学工作者档案

反向依赖关系:

反向进口: 麻木

链接:

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