MARVEL:揭示单细胞分辨率下的拼接动力学

选择性剪接代表了基因表达谱下额外的和未被认识到的复杂性层。然而,迄今为止,仍缺乏软件来研究单细胞分辨率下的剪接动力学。”MARVEL’能够对基于平板和滴管的文库制备方法生成的单细胞RNA测序数据进行剪接分析。

版本: 1.4.0
取决于: R(≥3.5.0)
进口: ggplot2(≥ 3.3.2),矩阵(≥1.3-3),方法,普利尔(≥1.8.4),规模(≥ 1.1.1)
建议: 注释Dbi(≥ 1.48.0),生物管柱(≥ 2.56.0),牛基因组(≥ 1.56.0),英国基因组。哈皮恩斯。NCBI。GRCh38型(≥ 1.3.1000),clusterProfiler(群集探查器)(≥ 3.16.0),事实附加(≥ 1.0.7),事实矿工(≥ 2.3),菲迪斯特普卢斯(≥ 1.1-1),基因组范围(≥ 1.42.0),gg新闻量表(≥ 0.4.5),GG排斥(≥ 0.9.1),额外网格(≥ 2.3),gtools(工具)(≥ 3.9.2),I范围(≥ 2.24.1),kableExtra(额外)(≥ 1.3.1),针织物(≥ 1.29),k样本(≥ 1.2-9),降价(≥ 1.1),桅杆(≥ 1.16.0),组织Hs.eg.db(≥ 3.10.0),组织管理例会.db(≥3.11.4),平行,情势图(≥ 1.0.12),重塑2(≥ 1.4.4),市场营销(≥ 2.3),S4载体(≥ 0.26.1),字符串(≥ 1.4.0),文本清除(≥ 0.9.3),两个样品(≥ 1.1.1),摇摆图(≥1.12.1)
出版: 2022-10-31
内政部: 10.32614/CRAN.包装。MARVEL公司
作者: 肖恩·文[aut,cre]
维护人员: 肖恩·温<Sean.wenwx在gmail.com>
许可证: GPL-3公司
需要编译:
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文档:

参考手册: 马维尔.pdf
渐晕图: MARVEL公司

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