wrTopDownFrag:通过Top-Down质谱鉴定内部碎片

Top-Down质谱旨在鉴定整个蛋白质及其(翻译后)修饰或离子结合(例如Chen等人(2018))<doi:10.1021/acs.analchem.7b04747>). 内部碎片的模式(Haverland等人(2017))<数字对象标识码:10.1007/s13361-017-1635-x>)可能揭示有关所研究蛋白质原始结构的重要信息(斯金纳等人(2018)<doi:10.1038/nchembio.2515>和Li等人(2018年)<doi:10.1038/nchem.2908>). 然而,随着蛋白质长度的增加,可能的内部片段数量变得越来越多,随后对内部片段的识别仍然具有挑战性,特别是因为当前质谱仪的测量精度是一个限制因素。该软件包试图处理内部片段的复杂性,并允许从去卷积质谱数据中识别末端和内部片段。

版本: 1.0.2
取决于: R(≥3.1.0)
进口: 图形、grDevices、stats、utils、,wr其他,wrProteo公司
建议: 生物并行,靴子,数据树,氟多醇,针织物,利马,平行,预处理核心,R彩色啤酒,rmarkdown公司,wrGraph(曲线图)
出版: 2020-09-08
内政部: 10.32614/CRAN.包装.wrTopDownFrag
作者: 沃尔夫冈·拉斐尔斯伯格[aut,cre]
维护人员: 沃尔夫冈·拉斐尔斯伯格(Wolfgang Raffelsberger)
许可证: GPL-3型
需要编译:
CRAN检查: wrTopDownFrag结果

文档:

参考手册: wrTopDownFrag.pdf文件
渐晕图: wrProteoVignette1软件

下载内容:

包源: wrTopDown碎片_1.0.2.tar.gz
Windows二进制文件: r-devel公司:wrTopDownFrag_1.0.2.zip文件,r版本:wrTopDownFrag_1.0.2.zip文件,r-oldrel:wrTopDownFrag_1.0.2.zip文件
macOS二进制文件: r释放(arm64):wrTopDown碎片_1.0.2.tgz,r-oldrel(arm64):wrTopDown碎片_1.0.2.tgz,r-release(x86_64):wrTopDown碎片_1.0.2.tgz,r-oldrel(x86_64):wrTopDown碎片_1.0.2.tgz

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