vglmer公司:变分广义线性混合效应回归

CRAN状态 R-CMD检查 编解码器

使用中描述的变分算法戈普勒鲁(2022a)和中戈普勒鲁(2022b)。它还提供了改进初始使用边际增广变分贝叶斯(MAVB)的近似如Goplerud(2022a)所述。它可以从CRAN或可以使用安装most-to-update版本开发工具.

#CRAN(起重机)install.packages(“vglmer”)#最新GitHub版本库(devtools)devtools::install_github(“mgoplerud/vglmer”,依赖项=TRUE)

目前,它可以拟合logistic、线性和负二项式具有任意数量随机效应的结果。有关负片的详细信息可以找到二项式推理在这里目前更具实验性。

此软件包接受以下格式的“标准”glmer语法:

vglmer(公式=y~x+(x|g),数据=数据,族=‘二项式’)

样条曲线可以使用vs(x),类似于中的功能mgcv公司,尽管数量更少选项。

vglmer(公式=y~vs(x)+(x|g),数据=数据,族=‘二项式’)

许多标准方法来自lme4公司工作,例如固定(fixef),系数,真空断路器,拉涅夫,预测.使用format_vglmer格式将所有参数解析为单个data.frame。估计可以是通过众多参数控制控制使用vglmer_control(vglmer_控制)。目前,方案I、II和IIIGoplerud(2022a)对应坚强的,部分、和虚弱的。默认值为坚强的对应最强(最差)近似值。如果参数的方差是感兴趣的,那么虚弱的将返回更好的结果。

请在GitHub上提出您有任何顾虑的问题。