工作流
工作从变量调用格式文件（VCF）开始。参考文件还建议使用（FASTA）和注释文件。后面的两个文件虽然没有必要，但我觉得他们做出了很大贡献。下面是流程图概述了使用vcfR的主要步骤。
流程图图像
绿色矩形包含用户想要的函数熟悉。在工作流：读取数据、处理内存中的对象和打印以图形方式显示数据。读取数据经常会显示瓶颈。不幸的是，这通常是由于需要花费时间从驱动器读取，因此可能不是我可以改进的任何东西。一旦数据在内存中，我们就可以对其进行操作。VcfR使用Rcpp实现用C++编写的函数以尝试提高这些功能。最后，我们将对象可视化。可视化依赖于在R的基本图形包上。我也不是这样如果它成为一个瓶颈，可能会有所改进。通过划分我将工作流程分为以下三个阶段我通过编写代码可以改进的方面，以及我几乎无法控制。