tcpl v3.1.0版==============*tcplfit2配件的更新想定案例*默认情况下为双向拟合*这是用于创建invitrodbv4.1的版本tcpl第3.0.1版==============*修复ggplot2中的错误*小错误修复tcpl版本3.0.0==============*使用tcplfit2添加附加模型拟合功能*更新了新配件的渐晕图*创建更新的绘图功能tcpl第2.1.0版==============*更新以发布toxcast-invitrodb数据*添加了允许更改单个conc bmad计算的选项tcpl 2.0.3版==============*创建了一个通用绘图函数tcplPlot,调用类似于tcplLoadData*添加了浓度单位在绘图期间不同的选项。*修复了模式更改的tcpllite错误*从tcplCytopt过滤的gnls*更新为Rmariadb*各种错误修复tcpl 2.0.2版==============*更新tcplLoadChem以返回dsstox物质ID*已移动数据。表可以导入而不是依赖*增加了新的6级方法来标记生存gnls优胜者*增加了tcplSubsetHid的单一浓度选项*更新的tcplCytoPt方法*作为5级方法,增加了确定最低有效浓度(loec)的能力*添加了新的AEID绘图功能,通过tcplMakeAeidPlts将同一绘图上的2个AEID可视化tcpl 2.0.1版==============更新了vignette以使用tempdir,从而不写入安装文件夹。tcpl 2.0版==============tcpl v2.0的主要变化:*将tcplLite集成到包中,这一功能允许用户使用格式化为invitrodb表的本地文件,而不是MySQL数据库。*使用tcplLite非常适合处理较小的数据集。*SQLite驱动程序已从包中删除。*tcplConf()默认值现在用于tcplLite,它使用.csv文件而不是MySQL数据库中的表。*MySQL驱动程序可用,建议将其作为数据库与整个数据集进行交互。*包vignette使用tcplLite运行。tcpl v2.0的其他更新*tcplLvlCount:添加的函数用于计算每个aeid在每个处理级别的样本数。*添加mc4方法:现在可以根据最低的两个浓度或中性对照井计算基线中位数绝对偏差。现在必须指定mc4方法进行分析。*tcplGetAeid:添加的函数用于根据任何分析端点名称中的字符串匹配来查找分析。*tcplMakeAeidMultiPlts:PDF每页上3x2网格图,用于单个aeid。*tcplMakeChidMultiPlts:PDF每页上3x2网格图,用于单个化学标识(chid)。*Vignette现在以html格式从RMarkdown文件发布,用于简介和附录、数据检索和数据处理。*对方法表进行了各种错误修复和添加。tcpl第1.4.0版==============v1.2.2的更改*.plotFit(未导出)已更新为使用`nchar的新行为`R>3.3(PR#10/#26)*tcplPlotPlate现在可以处理单conc数据。以前它只适用于多conc数据。(公关#14)*删除了“nddr”6级方法。它们特定于一个数据集不再使用。(PR#16)*删除了data.table调用中“with=FALSE”的所有实例。(PR#25)*程序包不再写入安装目录。小插曲是现在内置在TMPDIR中,配置文件的位置必须是由用户指定。这是为了遵守CRAN政策。给用户带来的好处共享一个安装,就是他们现在可以各自拥有自己的配置文件。(第28页)*已删除RSQLite和RMySQL包的特定方法导入。此更改反映了RSQLite包的新行为。RMySQL删除了导入以简化程序包,因为它们被认为是不必要的。(PR#29)tcpl第1.2.3版==============v1.2.2的更改*.plotFit(未导出)已更新为使用`nchar的新行为`R>3.3(PR#10/#26)*tcplPlotPlate现在可以处理单conc数据。以前它只适用于多conc数据。(公关#14)*删除了“nddr”6级方法。它们特定于一个数据集不再使用。(PR#16)*删除了data.table调用中“with=FALSE”的所有实例。(PR#25)*程序包不再写入安装目录。小插曲是现在内置在TMPDIR中,配置文件的位置必须是由用户指定。这是为了遵守CRAN政策。给用户带来的好处共享一个安装,就是他们现在可以各自拥有自己的配置文件。(第28页)*已删除RSQLite和RMySQL包的特定方法导入。此更改反映了RSQLite包的新行为。RMySQL删除了导入以简化程序包,因为它们被认为是不必要的。(PR#29)tcpl第1.2.2版==============v1.2的更改*向绘制绘图的底层函数添加了try语句tcplPlotHeat,这样当运行包的检查。tcpl 1.2版==============beta版的更改:*tcpl4函数现在检查analysi_component_endpoint表,并在以下情况下尝试拟合每条曲线'fit_all'是1。*TCPL_CHEM和TCPL_INT设置已被弃用,不再使用需要。为了便于使用和理解,包括化学表在tcpl数据库中进行了重构。*TCPL_LOG设置已被弃用。*tcplUpdate重命名为tcplSendQuery。*现已实施单浓度筛选。*添加了tcplRegister和tcplUpdate,以便使用新的数据更容易。*更改了基础数据库结构。旧数据库无法工作包的beta版本。*tcplPlotL4ID现在是与新数据库结构匹配的tcplPletM4ID。*tcpl1、tcpl2等函数已重命名,不再已导出。所有处理都将通过tcplRun函数进行。*tcplRunPipe现在是tcplRun,不再默认为写入日志文件。如前所述,仍然可以使用“outfile”设置写入日志文件。*5级多重集中处理已更改--不再存在最小截止值。所有截止值必须指定为新的5级方法。*6级多重浓缩处理发生了变化——部分标志更新了方法。*tcplSetOpts重命名为tcplConf。*现在只能为tcplSetOpts(现在称为tcplConf)提供一个或一个子集要更改的设置。*tcplListOpts已重命名为tcplConfList。*添加了tcplConfLoad、tcplConf2Save、tcplConfDefault和tcplConf Reset以使用户更容易使用包设置。*由于“raply”的底层代码发生了更改,该包现在必须使用R版本3.2.0或更高版本。*增加了处理方法。*tcplWriteLvl0现在排除加载非已注册,但将加载未注册的acsn值的数据返回错误。*tcpl现在导入RMySQL。*tcplACVal和tcplACXX分别重命名为tcplHillConc和tcplHill ACXX。*tcplHillVal补充道。*tcplPlotPlate中的错误,在输入data.table时导致错误的着色包含多个分析是固定的。*“fname”参数添加到tcplMakeAeidPlts,默认文件名为改变。*“quant”参数已添加到tcplPlotPlate。*tcplLoadAsid已弃用,不再导出。*tcplLoadUnit已弃用,不再导出。*tcplPlotFits中对“浏览器”的调用被更改为跳过其他行在循环中使扫描图变得更容易。*对文档和小插曲(现在称为“tcpl_Overview。”*tcplAssignMthd、tcplLoadMthd,tcplListMthd和tcplClearMthd函数是重命名为tcplMthd-(例如,用tcplMtchdLoad代替tcplLoadMthd)。*tcplMthdClear不再返回TRUE,这与tcplMdhdAssign的行为相匹配。*添加tcplCytoPt函数以计算化学品的细胞毒性点(此功能过去由tcplVarMat提供,但现在是独立的)。*“argx”和“srgx”参数已从tcplPrepOtpt中删除。*“srgx”参数已从tcplMakeAeidPlts中删除。*tcplLoadAsidInfo和tcplLoadAeidInfo已弃用,不再导出。*tcplPrepOtpt更长时间包含“clib”参数。