smartsnp:大基因组数据的快速多元分析

快速计算小(10s到100s标记)到大(1000s到100000s)基因型数据的多元分析。运行主成分分析,允许对遗传漂变进行中心化、z评分标准化和缩放,将古代样本投影到现代遗传空间,并对群体位置差异进行多元测试(基于排列的多元方差分析)和离散度测试(基于排置的多元离散度分析)。

版本: 1.1.0
取决于: R(≥3.6.0)
进口: 引导SVD,数据表,foreach公司,快速,R光谱,素食主义者,虚拟房间,卢比
链接到: 卢比,RcppArmadillo公司
出版: 2021-03-04
内政部: 10.32614/CRAN.包装.smartsnp
作者: 萨尔瓦多·赫兰多·佩雷斯ORCID标识[aut],雷·托布勒ORCID标识【ctb】,克里斯蒂安·胡贝尔ORCID标识【ctb、cre】
维护人员: 克里斯蒂安·胡贝尔(Christian Huber)<Christian.domitian.Huber at gmail.com>
许可证: 麻省理工学院+文件许可证
需要编译:
语言: en-GB公司
材料: 自述文件 新闻
CRAN检查: smartsnp结果

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