scoper:基于光谱聚类的B细胞克隆鉴定方法

为鉴定B细胞克隆提供了一个计算框架适应性免疫受体序列(AIRR-Seq)数据。三个主要包括函数(identicalClone、hierarchicalClone和spectralClone)在BCR/IG(B细胞受体/免疫球蛋白)序列之间进行聚类它们共享相同的V基因、J基因和连接长度。Nouri N和Kleinstein SH(2018)<doi:10.1093/bioinformatics/bty235>.Nouri N和Kleinstein SH(2019年)<数字对象标识代码:10.1101/788620>.Gupta NT等人(2017年)<doi:10.4049/jimmunol.1601850>.

版本: 1.3.0
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出版: 2023-10-06
内政部: 10.32614/CRAN.package.示波器
作者: 尼马·努里[aut],埃德尔·阿隆,吉塞拉·加百纳,苏珊娜·马尔克斯,杰森·范德·海登,史蒂文·克莱恩斯坦
维护人员: 苏珊娜·马尔克斯<yale.edu的苏珊娜·马尔克斯>
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许可证: AGPL-3型
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材料: 自述文件 新闻
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守夜人: 推断B细胞克隆关系

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