scoper:基于光谱聚类的B细胞克隆鉴定方法
为鉴定B细胞克隆提供了一个计算框架适应性免疫受体序列(AIRR-Seq)数据。三个主要包括函数(identicalClone、hierarchicalClone和spectralClone)在BCR/IG(B细胞受体/免疫球蛋白)序列之间进行聚类它们共享相同的V基因、J基因和连接长度。Nouri N和Kleinstein SH(2018)<doi:10.1093/bioinformatics/bty235>.Nouri N和Kleinstein SH(2019年)<数字对象标识代码:10.1101/788620>.Gupta NT等人(2017年)<doi:10.4049/jimmunol.1601850>.
版本: |
1.3.0 |
取决于: |
R(≥4.0),ggplot2(≥ 3.4.0) |
进口: |
胡地(≥ 1.3.0),沙扎姆(≥ 1.2.0),数据表,do并行,数字播放器(≥ 1.0),foreach公司、方法、,卢比(≥0.12.12),拉朗,规模,统计,斯特林吉,第三年(≥ 1.0) |
链接到: |
卢比 |
建议: |
针织物,rmarkdown公司,测试那个 |
出版: |
2023-10-06 |
内政部: |
10.32614/CRAN.package.示波器 |
作者: |
尼马·努里[aut],埃德尔·阿隆,吉塞拉·加百纳,苏珊娜·马尔克斯,杰森·范德·海登,史蒂文·克莱恩斯坦 |
维护人员: |
苏珊娜·马尔克斯<yale.edu的苏珊娜·马尔克斯> |
错误报告: |
https://bitbucket.org/kleinstein/scoper/issues |
许可证: |
AGPL-3型 |
网址: |
https://scoper.readthedocs.io网站 |
需要编译: |
对 |
引用: |
范围引用信息 |
材料: |
自述文件 新闻 |
在视图中: |
组学 |
CRAN检查: |
范围界定结果 |
文档:
下载内容:
链接:
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