scAnnotate:一种用于单细胞的自动细胞类型注释工具RNA-序列数据

一种完全由数据驱动的细胞类型注释工具,它需要训练数据来学习分类器,但不需要生物知识来进行主观决策。它包括三个步骤:对训练和测试数据进行预处理、对训练数据进行模型拟合和对测试数据进行细胞分类。见Ji Xiangling、Danielle Tsao、Kailun Bai、Min Tsao,Li Xing、Xuekui Zhang。(2022)<数字对象标识代码:10.1101/2022.029.481159>了解更多详细信息。

版本: 0.3
取决于: R(≥4.0.0)
进口: 格尔姆奈特,统计,修拉(≥ 5.0.1),和谐,修饰符对象
建议: 针织物,测试那个(≥ 3.0.0),rmarkdown公司
出版: 2024-03-14
内政部: 10.32614/CRAN.package.sc注释
作者: Ji祥灵[aut],Danielle Tsao[aut],白开伦[ctb],Min Tsao[aut],李兴[aut],张学奎[aut,cre]
维护人员: 张学奎(Xuekui Zhang)
许可证: GPL-3公司
网址: https://doi.org/10.101/2022.02.19.481159
需要编译:
材料: 新闻
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