普雷迪。GUI:使用图形用户对混合性能进行基因组预测接口

使用八种GS方法执行杂交性能的基因组预测,包括GBLUP、BayesB、RKHS、PLS、LASSO、Elastic net、XGBoost和LightGBM。GBLUP:基因组最佳线性无偏预测,RKHS:再生核Hilbert空间,PLS:偏最小二乘回归,LASSO:最小绝对收缩和选择算子,XGBoost:极限梯度增强,LightGBM:光梯度增强机。它还为训练人群提供了快速交叉验证和交配设计方案(Xu S等人(2016))<doi:10.1111/tpj.13242>; 徐S(2017)<doi:10.1534/g3.116.038059>).

版本: 2.0.1
取决于: R(≥4.1.0)
进口: 闪亮的,数据表,DT公司,普雷迪(≥ 2.1),BGLR公司,,格尔姆奈特,xgboost公司,光(gbm),foreach公司,do并行,平行,html工具
出版: 2024-06-17
内政部: 10.32614/CRAN.包装.红色。图形用户界面
作者: 杨旭[aut],余广宁[aut],张玉祥[aut,cre],崔燕茹[ctb],徐世忠[ctb],徐晨武[ctb]
维护人员: 张玉祥<foxmail.com>
许可证: GPL-3公司
需要编译:
CRAN检查: 普雷迪。GUI结果

文档:

参考手册: 普雷迪。GUI.pdf格式

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包源: 普雷迪。GUI_2.0.1.tar.gz
Windows二进制文件: r-devel公司:普雷迪。GUI_2.0.1.拉链,r版本:普雷迪。GUI_2.0.1.拉链,r-oldrel:普雷迪。GUI_2.0.1.拉链
macOS二进制文件: r释放(arm64):普雷迪。图形用户界面2.0.1.tgz,r-oldrel(arm64):普雷迪。桂_2.0.1.tgz,r-版本(x86_64):普雷迪。桂_2.0.1.tgz,r-oldrel(x86_64):普雷迪。桂_2.0.1.tgz
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