pmartR:泛经济市场-质量控制和统计分析Panomics数据

为质谱(MS)组学数据的质量控制处理和统计分析提供功能,特别是蛋白质组(在肽或蛋白质水平)、脂质组和代谢组学数据,以及基于RNA-seq的计数数据和核磁共振(NMR)数据。这包括数据转换、要相互比较的组的规范、特征和/或样本的过滤、数据规范化、数据汇总(相关性、PCA)以及定义组之间的统计比较。实施Webb-Robertson等人(2014)中描述的方法<doi:10.1074/mcp。M113.030932>. Webb-Robertson等人(2011年)<doi:10.1002/pmic.201100078>. Matzke等人(2011年)<doi:10.1093/bioinformatics/btr479>. Matzke等人(2013)<doi:10.1002/pmic.201200269>. Polpitya等人(2008)<doi:10.1093/bioinformatics/btn217>. Webb-Robertson等人(2010年)<doi:10.1021/pr1005247>.

版本: 2.4.5
取决于: R(≥3.5.0)
进口: 卢比(≥ 0.12.8),数据表,do并行,数字播放器,ggplot2,e1071号,foreach公司、方法、,mvtnorm公司,pca方法,呜呜声,rrcov公司,字符串,第三年(≥ 1.3.0),R彩色啤酒,马格里特,平行地,拼凑,glmpca公司
链接到: 卢比,RcppArmadillo公司,伯克希尔哈撒韦
建议: 针织物,利马,rmarkdown公司,边缘R,设计2,巧妙地,规模,S4载体,生存,测试那个,网格镜,pmartRdata,vdiffr公司
出版: 2024-05-21
内政部: 10.32614/CRAN.包装.pmartR
作者: 丽莎·布拉默[aut,cre],Kelly Stratton[aut],丹尼尔·克莱伯恩,埃文·格拉斯科克,雷切尔·理查森,David Degnan[ctb],埃文·马丁
维护人员: 丽莎·布拉默(Lisa Bramer)<Lisa.Bramer at pnnl.gov>
错误报告: https://github.com/pmartR/pmartR/issues
许可证: BSD_2_子句+文件许可证
网址: https://pmartr.github.io/pmartr/,https://github.com/pmartR/pmartR
需要编译:
其他存储(_R): https://pmartR.github.io/drat网站
引用: pmartR引文信息
材料: 自述
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