光合作用：植物生态生理学和建模工具

包含植物生态生理学的建模和分析工具。建模：使用Farquhar，von Caemmerer，贝里（1980）<doi:10.1007/BF00386231>巴克利和Diaz-Espejo（2015）<doi:10.1111/pce.12459>. 它使用单位来确保参数在计算之前被正确地指定和转换。温度响应功能自动“烘焙”到所有根据Bernacchi等人（2002）基于叶温的参数<doi:10.1104/pp.008250>. 包装包括边界层、表皮、，气孔和叶肉对CO2的传导率各不相同叶子的上部和下部。使用简单的函数模拟环境梯度上的光合作用，如光合作用光通量密度（PPFD）和叶温，或超过性状梯度例如CO2电导或光化学。分析工具：Fit ACi（Farquhar等人（1980）<doi:10.1007/BF00386231>)和AQ曲线（Marshall&Biscoe（1980））<doi:10.1093/jxb/31.1.29>),温度响应（Heskel等人（2016）<doi:10.1073/pnas.1520282113>;Kruse等人（2008）<doi:10.1111/j.1365-3040.2008.01809.x>，Medlyn等人。(2002) <doi:10.1046/j.1365-3040.2002.00891.x>，Hobbs等人（2013）<doi:10.1021/cb4005029>)《光下的呼吸》（Kok（1956）<doi:10.1016/0006-3002（56）90003-8>，Walker&Ort（2015）<doi:10.1111/pce.12562>,Yin等人（2009）<doi:10.1111/j.1365-3040.2009.01934.x>，Yin等人（2011）<doi:10.1093/jxb/err038>)，叶肉电导率（Harley等人（1992年）<doi:10.1104/pp.98.4.1429>)，压力-体积曲线（Koide等人（2000））<doi:10.1007/978-94-009-2221-1_9>，Sack等人（2003年）<网址：10.1046/j.0016-8025.2003.01058.x>，Tyrie等人（1972年）<doi:10.1093/jxb/21.1.267>)，水力脆弱性曲线（Ogle等人（2009））<doi:10.1111/j.1469-8137.2008.02760.x>，Pammenter等人（1998年）<doi:10.1093/treephys/18.8-9.589>)和用于运行灵敏度的工具特别针对不确定性变量进行分析（例如g_mc（）、gamma_star（），R_d（））。

版本： 2.1.4
取决于： R（≥4.0.0），ggplot2(≥ 3.4.0),最小包装.lm(≥ 1.2-1),单位(≥ 0.6.6)
进口： 将死(≥ 2.0.0),蜡笔(≥ 1.3.4),数字播放器(≥ 0.8.5),毛皮商(≥ 0.1.0),胶（≥1.4.0）、图形（≥4.0.0）、grDevices（≥4.0.00）、，枪械(≥ 1.0.2),生命周期(≥ 1.0.0),马格里特（≥1.5.0），方法（≥3.5.0），国家实验室(≥ 3.1-147),进步(≥ 1.2.0),呜呜声(≥ 0.3.3),阅读器(≥ 2.0.0),爱尔兰航空公司（≥0.4.6），统计值（≥4.0.0），字符串(≥ 1.4.0),茶叶(≥1.0.5），utils（≥4.0.0）
建议： 业务风险管理系统,扫帚,未来,针织物,rmarkdown公司,测试那个,易怒的,第三年,潮汐选择
出版： 2023-08-15
内政部： 10.32614/CRAN.包装.光合成
作者： 约瑟夫·斯廷齐亚诺ORCID标识[aut]，卡桑德拉·罗巴克[aut]，黛米·萨金特[aut]，布里吉特·墨菲，帕特里克·哈德森[aut，dtc]，克里斯·缪尔ORCID标识[自动，创建]
维护人员： 克里斯·缪尔（Chris Muir）
错误报告： https://github.com/cdmuir/photosynthesis/issues
许可证： 麻省理工学院+文件许可证
网址： https://github.com/cdmuir/光合作用
需要编译： 不
引用： 光合作用引文信息
材料： 自述 新闻
在视图中： 农业
CRAN检查： 光合作用结果

文档：

参考手册： 光合作用.pdf
渐晕图： 二氧化碳响应
液压易损性
拟合模型以估计光呼吸
拟合光响应曲线
叶肉电导
C3光合作用建模：常见场景的建议
光合作用软件包简介
压力容积
灵敏度分析
气孔导度
温度响应

下载内容：

包源： 光合作用2.1.4.tar.gz
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旧来源： 光合作用档案

反向依赖关系：

反向建议： 气体分析仪

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