omicwas:散装Omics实验中的细胞类型特异性关联测试

在大量表观基因组/转录组实验中,分子表达是在组织中测量的,组织是多种类型细胞的混合物。此软件包测试疾病/表型与分子标记的关联对于每个单元格类型。需要输入每个样本中细胞类型的比例。该软件包适用于表观基因组全关联研究(EWAS)和差异基因表达分析。武内和加藤(已提交)“组学:细胞类型特异性全表观基因组和转录组关联研究”。

版本: 0.8.0
取决于: R(≥3.6.0)
进口: 扫帚,数据表,数字播放器,ff(关闭),格尔姆奈特,马格里特,MASS(质量),矩阵统计,平行,呜呜声,爱尔兰航空公司,第三年
建议: 测试那个,针织物,rmarkdown公司
出版: 2020-10-08
内政部: 10.32614/CRAN.包装.omicwas
作者: 武内富美彦ORCID标识[aut,cre]
维护人员: 竹内富美子
错误报告: https://github.com/fumi-github/omicwas/issues网站
许可证: GPL-3公司
网址: https://github.com/fumi-github/omicwas网址
需要编译:
材料: 自述
在视图中: 组学
CRAN检查: 奥密克戎结果

文档:

参考手册: omicwas.pdf公司
渐晕图: omicwas简介

下载内容:

包源: omicwas_0.8.0.tar.gz
Windows二进制文件: r-devel公司:omicwas_0.8.0.zip,r版本:omicwas_0.8.0.zip,r-oldrel:omicwas_0.8.0.zip
macOS二进制文件: r释放(arm64):omicwas_0.8.0.tgz公司,r-oldrel(arm64):omicwas_0.8.0.tgz公司,r-release(x86_64):omicwas_0.8.0.tgz公司,r-oldrel(x86_64):omicwas_0.8.0.tgz公司
旧来源: omicwas存档

链接:

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