noisyr:高通量序列输出中的噪声量化

量化并消除高吞吐量带来的技术噪音测序数据。使用了两种方法,一种基于计数矩阵,一个直接使用对齐BAM文件。还包含流程中每个步骤的几个选项作为质量检查和评估输出稳定性的工具。

版本: 1.0.0
取决于: R(≥3.1.2)
进口: utils、grDevices、,易怒的,数字播放器,马格里特,ggplot2,预处理核心,I范围,基因组范围,Rsamtools软件,喜熵,do并行,foreach公司
建议: 测试那个,氧气2,针织物,rmarkdown公司
出版: 2021-04-16
内政部: 10.32614/CRAN.包装噪音
作者: 伊利亚斯·穆索普洛斯[aut,cre],Irina Mohorianu【aut,ctb】,哈伊克·乔治·德罗斯特[ctb],Elze Lauzikaite公司
维护人员: 伊利亚斯·穆索普洛斯(Ilias Moutsopoulos)<im383 at cam.ac.uk>
错误报告: https://github.com/Core-Bioinformatics/noisyR/issues
许可证: GPL-2型
网址: https://github.com/Core-Bioinformatics/noisyR
需要编译:
材料: 自述文件
CRAN检查: 黑色结果

文档:

参考手册: 噪音.pdf
守夜人: 噪声R计数矩阵方法工作流

下载内容:

包源: 噪音_1.0.0.tar.gz
Windows二进制文件: r-devel公司:噪音_1.0.0.zip,r版本:噪音_1.0.0.zip,r-oldrel:噪音_1.0.0.zip
macOS二进制文件: r释放(arm64):噪音_1.0.0.tgz,r-oldrel(arm64):噪音_1.0.0.tgz,r-release(x86_64):噪音_1.0.0.tgz,r-oldrel(x86_64):噪音_1.0.0.tgz
旧来源: 噪音档案

反向依赖关系:

反向进口: 散装分析仪

链接:

请使用规范形式https://CRAN.R-project.org/package=noisyr链接到此页面。