mrMLM:GWAS的多焦点随机SNP效应混合线性模型工具
在多基因座随机SNP效应混合线性模型(mrMLM)框架下进行多基因座全基因组关联研究。首先,扫描基因组上的每个标记。Bonferroni校正被一个不太严格的重要测试选择标准所取代。然后,将所有可能与该性状相关的标记纳入一个多位点遗传模型,利用经验贝叶斯估计其效应,并通过显著QTL的似然比检验进一步确定所有非零效应。该程序可以在台式机或笔记本电脑上运行。如果关联映射群体中的标记基因型几乎是纯合子,则此软件中的这些方法非常有效。如果有许多杂合标记基因型,建议使用IIIVmrMLM软件。文YJ、张浩、倪YL、黄B、张J、冯JY、王SB、邓维尔JM、张英明、吴锐(2018<doi:10.1093/bib/bbw145>),以及李明、张玉伟、张振聪、向毅、刘MH、周玉华、左JF、张总部、陈毅、张玉梅(2022<doi:10.1016/j.molp.2022.02.012>).
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