miRetrieve:miRNA摘要中的文本挖掘

为microRNA(miRNA)文本挖掘提供工具。miRetrieve通过提取、计数和分析miRNA名称,从而旨在获得对短时间内的大量文本。为此,miRetrieve使用正则表达式提取miRNAs和标记化识别有意义的miRNA关联。此外,miRetrieve使用最新的miRTarBase版本8.0(Hsi-Yuan Huang等人(2020))“miRTarBase 2020:实验验证的microRNA目标更新交互数据库”<doi:10.1093/nar/gkz896>)显示特定于字段的miRNA-mRNA相互作用。最重要的功能可用作闪亮的web应用程序位于<https://miretrieve.shinyapps.io/mi检索/>.

版本: 1.3.4
取决于: R(≥3.1.0)
进口: 数字播放器(≥ 1.0.7),对于猫(≥ 0.5.1),ggplot2(≥ 3.3.5),马格里特(≥ 2.0.1),开放式xlsx(≥ 4.2.4),巧妙地(≥ 4.9.4.1),呜呜声(≥0.3.4),阅读器(≥ 2.0.1),读xl(≥ 1.3.1),爱尔兰航空公司(≥ 0.4.11),规模(≥ 1.1.1),字符串(≥ 1.4.0),文本清除(≥ 0.9.3),第三年(≥ 1.1.3),潮汐文字(≥ 0.3.1),主题模型(≥ 0.2.12),文字云(≥ 2.6),xml语言2(≥ 1.3.2),动物园(≥1.8-9)
建议: kableExtra(额外),针织者,重塑2,rmarkdown公司,测试那个
出版: 2021-09-18
DOI(操作界面): 10.32614/CRAN.package.mi检索
作者: 朱利安·弗里德里希,汉斯·佩特·哈姆斯[aut],吉多·克伦宁[aut]
维护人员: 朱利安·弗里德里希(Julian Friedrich)
许可证: GPL-3公司
需要编译:
材料: 自述文件 新闻
CRAN检查: mi检索结果

文档:

参考手册: mi检索.pdf

下载内容:

包源: mi检索_1.3.4.tar.gz
Windows二进制文件: r-devel公司:miRetrieve_1.3.4.zip,r版本:miRetrieve_1.3.4.zip,r-oldrel:miRetrieve_1.3.4.zip
macOS二进制文件: r释放(arm64):miRetrieve_1.3.4.tgz,r-oldrel(arm64):mi检索_1.3.4.tgz,r-release(x86_64):mi检索_1.3.4.tgz,r-oldrel(x86_64):mi检索_1.3.4.tgz
旧来源: miRetrieve档案

链接:

请使用规范形式https://CRAN.R-project.org/package=miRetrieve链接到此页面。