柠檬醛2:量化基因组中的节律和差异节律数据

基于周期样条拟合线性模型,中等模型系数使用多元自适应收缩,然后计算缓和曲线。

版本: 0.1.0
取决于: R(≥3.6)
进口: 阿比德(≥ 1.4-5),灰烬(≥ 2.2-54),将死(≥ 2.0.0),数据表(≥ 1.12.8),DESeq2公司(≥ 1.30.0),foreach公司(≥ 1.5.0),HD间隔(≥ 0.2.2),迭代器(≥ 1.0.12),利马(≥3.42.2),捣碎机(≥ 0.2.50),公共广播系统(≥ 1.1),狂热分子(≥ 0.1.0)
建议: 奶牛场(≥ 1.1.1),针织物,do并行(≥ 1.0.15),ggplot2(≥ 3.3.5),(≥ 1.6.1),qs(质量)(≥ 0.24.1),rmarkdown公司,测试那个(≥ 3.0.0)
出版: 2023-01-26
内政部: 10.32614/CRAN.包装.limorhyde2
作者: 杰克·休斯,多拉·奥波多[aut],埃利奥特·奥特兰
维护人员: 杰克·休斯(Jake Hughey)<jakejhughey at gmail.com>
许可证: GPL-2型
网址: https://limorhyde2.hugheylab.org,https://github.com/hugheylab/limorhyde2
需要编译:
材料: 新闻
CRAN检查: limrhyde2结果

文档:

参考手册: limorhyde2.pdf
渐晕图: 量化条件之间的差异节奏
量化一种情况下的节奏
分析RNA-seq数据
量化(微分)节律性的不确定性

下载内容:

包源: 豪华轿车2_0.1.0.tar.gz
Windows二进制文件: r-devel公司:豪华轿车2_0.1.0.zip,r版本:豪华轿车2_0.1.0.zip,r-oldrel:豪华轿车2_0.1.0.zip
macOS二进制文件: r释放(arm64):柠檬醛2_0.1.0.tgz,r-oldrel(arm64):柠檬醛2_0.1.0.tgz,r-版本(x86_64):柠檬醛2_0.1.0.tgz,r-oldrel(x86_64):柠檬醛2_0.1.0.tgz
旧来源: limrhyde2档案

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