ipflasso:带有惩罚因素的综合套索
该包的核心是cvr2.ipflasso(),它是glmnet的一个扩展,用于将(大型)可用预测器集划分为几个模式,这些模式在预测方面的信息内容可能不同。例如,在生物医学应用中,可能必须根据例如mRNA数据、miRNA数据、甲基化数据、CNV数据、临床数据等来预测患者的预后,例如生存时间或治疗反应。临床预测因子通常比mRNA数据更重要。ipflasso方法通过对不同模式的预测值使用不同的惩罚参数来考虑这个问题。不同惩罚参数之间的比率可以通过交叉验证从一组可选候选参数中选择,也可以通过输入数据生成。
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