短分界线辅导的

米夏·博亚诺夫斯基

“Intergraph”是一个R包，带有网络数据强制例程物体。有关更多信息，请参阅

这是一个简短的教程，演示如何在包中使用函数使用包含在包裹。

1加载示例数据

要显示数据，请首先加载包。

图书馆（积分）
图书馆（网络）
## ##“网络”1.18.2（2023-12-04），Statnet项目的一部分##*'news（package=“network”）'（自上次版本以来的更改）##*“引文（“网络”）”用于引文信息##*’https://statnet.org'获取帮助、支持和其他信息
图书馆（摄氏度）
## ##附加包：“igraph”
##“package:network”中屏蔽了以下对象：## ##%c%、%s%、add.edges、add.vertices、delete.edges和delete.verticles，##get.edge.attribute、get.edges、get.vertex.attribute、is.bipartite、，##is.directed、list.edge.attributes、list.vertex.attributes、，##set.edge.attribute、set.vertex.attribute
##以下对象从“package:stats”中屏蔽：## ##分解，光谱
##以下对象已从“package:base”中屏蔽：####工会

下面是“igraph”对象的摘要：

总结（示例）
##IGRAPH 258c8b4 D--15 11-##+属性：标签（v/c），标签（e/c）
总结（不包括Igraph2）
##IGRAPH 66a1bae U——15 11——##+属性：标签（v/c），标签（e/c）

以下是“网络”对象的摘要：

ex网络
##网络属性：##顶点=15##定向=真##hyper=错误##循环=假##多个=假##bipedity=假##总边数=11##缺少边=0##非缺失边=11## ##顶点属性名称：##标签vertex.names## ##边缘属性名称：##标签
不含网络2
##网络属性：##顶点=15##directed=错误##hyper=错误##循环=假##多个=假##bipedity=假##总边数=11##缺少边=0##非缺失边=11####顶点属性名称：##标签vertex.names## ##边属性名称：##标签

更多信息见附录。

2功能as网络和asI图表

“网络”和“igraph”类之间的网络对象转换可以使用函数执行as网络和asI图表.

2.1网络=>记录仪

通过调用函数将“网络”对象转换为“igraph”asI图表在“网络”对象上：

#检查“exNetwork”的类
班（不包括网络）
##[1]“网络”
#转换为“igraph”
克<- asI图表（不包括网络）
#检查结果的类别
班（g）
##[1]“图表”

检查对象的边缘列表是否相同

厄尔尼诺（el.g）<- 获取编辑列表（g）
##警告：igraph 2.0.0中不推荐使用“get.edgelist（）”。## ℹ 请改用“as_edgelist（）”。##此警告每8小时显示一次。##调用“lifecycle：：last_lifecycle_warnings（）”查看此警告的位置##生成。
el.n公司<- 作为矩阵（不包括网络，“边缘列表”)
完全相同的(as.数字（el.g），as.数字（el.n））
##[1]正确

2.2igraph=>网络

通过调用函数将“igraph”对象转换为“network”as网络在“igraph”对象上：

网<- as网络（示例）

注意由于“非标准”网络属性导致的警告布局，这是一个函数。打印“网络”对象无法很好地处理非标准属性。然而，所有数据和属性被正确复制。

检查对象的边缘线是否相同

标高g2<- 获取编辑列表（不包括图表）
标高2<- 作为矩阵（净，“先锋派”)
完全相同的(as.数字（标高g2），as.数字（标高n2）
##[1]正确

2.3搬运属性

“igraph”和“network”类的对象，除了存储实际的网络数据（顶点和边），允许添加属性整个网络的顶点、边和属性（称为术语中的“网络属性”或“图形属性”包“network”和“igraph”）。

顶点和边属性由大体上类似的时尚。但是，使用了网络级属性不同。“网络”类对象使用网络级属性存储各种元数据，例如网络大小，网络是否定向、二分等。在“igraph”中存储此信息分别进行。

当我们将“网络”和“igraph”对象相互转换。

两种功能as网络和asI图表有另一个论点attrmap（属性映射）用于指定如何复制顶点、边和网络属性。这个attrmap（属性映射）参数需要数据帧。数据行数框架指定复制/重命名不同属性的规则。数据框架应具有以下列（全部为“字符”类）：

默认规则由函数返回属性映射（）,这些是：

attrmap（属性映射）()
##从cls到attr的类型##1网络定向迁移<NA>##2网络二部图<NA>##3网络回路图<NA>##4网络mnext图表<NA>##5网络多重图<NA>##6网络网络图<NA>##7网络超级图表<NA>##8顶点图表名称网络顶点名称

例如，最后一行指定一个规则，当类“igraph”被转换为类“network”，然后是顶点属性名称在“igraph”中，对象将被复制到顶点属性已调用vertex.names（顶点名称）在的结果对象中类”网络。

如果列托塔特包含一个不适用，那个表示未复制相应的属性。例如第一行指定一条规则，当“网络”类对象转换为类“igraph”，然后是网络属性定向的在“网络”对象中不复制到“igraph”类的结果对象。

用户可以通过构造相似的数据帧，并通过参数提供它们attrmap（属性映射）到函数asI图表和as网络.

作为示例，让我们将选项设置为始终删除纳顶点属性。首先，我们需要通过以下方式设置规则向返回的数据帧添加额外的行attrmap（属性映射）以下为：

新规则（_R）<- 数据帧(类型=“顶点”,来自cls=“网络”,来自attr=“不”,
                       tocls公司=“图表”,托塔特=不适用,
                       字符串作为因子=错误的)
#与默认规则结合
规则<- 旋转(attrmap（属性映射）（），新规则）
规则
##从cls到attr的类型##1网络定向图<NA>##2网络二部图<NA>##3网络回路图<NA>##4网络mnext图表<NA>##5网络多重图<NA>##6网络网络图<NA>##7网络超级图表<NA>##8顶点图名网络vertex.names##9顶点网络迁移<na>

现在我们可以使用它asI图表以下为：

（图1<- asI图表（不包括网络）
##IGRAPH 8fa0936 D--15 11-##+属性：标签（v/c）、na（v/l）、顶点名称（v/c）、标签（e/c）和na##|（e/l）##+8fa0936的边缘：##  [1]  2-> 1  3-> 1  4-> 1  5-> 1  6-> 7  8-> 9 10->11 11->12 14->12 12->13## [11] 13->14
（ig2<- asI图表（不包括网络，阿玛普=规则）
##IGRAPH d22eb45 D--15 11-##+属性：标签（v/c）、顶点名称（v/c）、标签（e/c）和na（e/l）##+d22eb45的边缘：##  [1]  2-> 1  3-> 1  4-> 1  5-> 1  6-> 7  8-> 9 10->11 11->12 14->12 12->13## [11] 13->14
#检查“na”是否被删除
“不” %单位：%记录仪::顶点属性名称（ig1）
##[1]正确
“不” %单位：%记录仪::顶点属性名称（ig2）
##[1]错误

三来往网络对象数据帧

功能asDF公司可用于转换网络对象（第个，共个类“igraph”或“network”）添加到两个数据帧的列表中：

我<- 美国国防部（示例）
字符串（l）
##列表（共2个）##$edges:“数据帧”：3个变量的11个obs.：##   ..$ V1:num[1:11]2 3 4 5 6 8 10 11 12 13。。。##   ..$ V2:num[1:11]1 1 1 1 7 9 11 12 13 14。。。##   ..$ 标签：chr[1:11]“ba”“ca”“da”“ea”。。。##$vertexes:'data.frame'：两个变量中的15个：##   ..$ integraph_id：整数[1:15]1 2 3 4 5 6 7 8 9 10。。。##   ..$ 标签：chr[1:15]“a”“b”“c”“d”。。。

结果列表包含两个组件边缘和顶点. The边缘组件本质上是在前两列中包含ego和alter id的边缘列表。这个其余列存储边缘属性（如果有）。对于我们的示例数据它是

我$边缘
##V1 V2标签##1 2 1巴##2 3 1卡##3 4 1天##4 5 1个##5 6 7前景##6 8 9高##7 10 11日圆##8 11 12公里##9 12 13勒姆##101314百万##11 14 12海里

这个顶点组件包含顶点上的数据顶点id（与边缘)存储在前两列中。剩下的列存储顶点属性（如果有）。对于我们的示例数据是：

我$顶点
##integraph_id标签##11个##22亿##33摄氏度##4 4天##5.5秒##6 6页##7 7克##8 8小时##9 9英寸##10 10焦耳##11 11千##12 12升##13 13米##14 14牛顿##15 15度

功能as网络和asI图表也可以用于从上述数据帧创建网络对象。第一个参数应该是边缘列表数据帧。可选参数顶点期望具有顶点数据的数据帧（就像l$顶点). 此外，我们需要指定边应被解释为有方向的或不通过参数的定向的.

例如，要从上面从对象创建的数据帧exIgraph公司我们可以：

z（z）<- as网络（l）$边缘，定向的=真的，我$顶点）
z（z）
##网络属性：##顶点=15##定向=真##hyper=错误##循环=假##多个=假##bipedity=假##总边数=11##缺少边=0##非缺失边=11####顶点属性名称：##标签vertex.names## ##边属性名称：##标签

这实际上是我们打电话时的基本情况asNetwork（示例）

4附录

4.1网络示例

包集成包含四个示例网络：

所有四个数据集都包含：

我们将在下面的示例中使用它们。

网络使用以下代码显示如下：

布局(矩阵(1以下为：4,2,2,旁观者=真的))
操作<- 标准(三月=c（c）(1,1,2,1))
#计算布局
坐标<- 布局.fruchterman.reigold（示例）
情节（示例，主要=“心电图”,布局=坐标）
情节（不包括Igrap2，主要=“不包括Igraph2”,布局=坐标）
情节（不包括网络，主要=“ex网络”,显示标签=真的,坐标=坐标）
情节（不包括网络2、，主要=“exNetwork2”,显示标签=真的,坐标=坐标）
标准（op）（操作）

4.2会话信息

sessionInfo（会话信息）()
##R版本4.3.2（2023-10-31）##平台：x86_64-pc-linux-gnu（64-bit）##运行于：Ubuntu 22.04.3 LTS## ##矩阵产品：默认##BLAS:/usr/lib/x86_64-linux-gnu/BLAS/libblas.so.3.10.0##LAPACK:/usr/lib/x86_64-linux-gnu/LAPACK/liblapack.so.3.10.0## ##区域设置：##[1]LC_CTYPE=en_US.UTF-8 LC_NUMERIC=C##[3]LC_TIME=pl_pl.UTF-8 LC_COLLATE=C##[5]LC_MONETARY=pl_pl.UTF-8 LC_MESSAGES=en_US.UTF-8##[7]LC_PAPER=pl_pl.UTF-8 LC_NAME=C##[9]LC_ADDRESS=C LC_TELEPHONE=C（电话）##[11]LC_MEASUREMENT=pl_pl.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C## ##时区：欧洲/华沙##tzcode源代码：系统（glibc）## ##附加的基本包：##[1]stats graphics grDevices utils datasets方法库## ##其他附加包：##[1]图_2.0.1.1网络_1.18.2 knitr_1.45图_2.0-4## ##通过命名空间加载（未附加）：##[1]蜡笔_1.5.2 vctrs_0.6.5 cli_3.6.2##[4]rlang_1.1.3 xfun_0.41高r_0.10##[7]jsonlite_1.8.8 glue_1.7.0 htmltools_0.5.7##[10]sass_0.4.8风扇_1.0.6 rmarkdown_2.25##[13]网格_4.3.2评估_0.23 jquerylib_0.1.4##[16]藏文3.2.1 fastmap_1.1.1 yaml_2.3.8##[19]生命周期_1.0.4编译器.4.3.2 coda_0.19-4##[22]pkgconfig_2.0.3 statnet.common_4.9.0 lattice_0.22-5##[25]摘要_0.6.34 R6_2.5.1 utf8_1.2.4##[28]柱_1.9.0磁柱_2.0.3 bslib_0.6.1##[31]工具_ 4.3.2缓存_ 1.0.8