httk：高通量毒代动力学

可快速定制各种化学品的预制作模型利用体外化学特异性数据和生理学数据信息。这些工具允许加入化学物质毒代动力学（“TK”）和体外-体内外推法（“IVIVE”）Pearce等人（2017）所述的生物信息学(<doi:10.18637/jss.v079.i04>). 化学特性已获得表征毒代动力学的体外数据来自相对高吞吐量的实验。这个化学依赖性（“泛型”）生理学基础（“PBTK”）和经验性（例如，一个隔间）此处包含的“TK”模型可以是用体外数据或电子预测参数化提供数千种化学品，多种接触途径，以及各种各样的物种。高通量毒代动力学（“HTTK”）是指体外数据和通用模型的组合。我们建立了没有体内数据的化学品HTTK的预期准确性通过化学品HTTK预测的统计评估体内数据确实存在的地方。这些模型是普通的系统在MCSim中开发并求解的微分方程使用编译的（基于C的）代码提高速度。蒙特卡洛采样器是包括用于模拟人类生物变异性（Ring等人，2017年<doi:10.1016/j.envent.2017.06.004>)和传播参数不确定性（Wambaugh等人，2019年<doi:10.1093/toxsci/kfz205>). 包括用于预测的经验校准方法组织：血浆分配系数和分布体积（Pearce等人，2017年<doi:10.1007/s10928-017-9548-7>).这些功能和数据为使用IVIVE转换高通量筛选实验的浓度（例如，Tox21、ToxCast）通过反向对真实世界的曝光剂量测定（也称为“RTK”）（Wetmore等人，2015年<doi:10.1093/toxsci/kfv171>).

版本：	2.4.0
取决于：	R（≥2.10）
进口：	解算,毫秒,数据表,调查,mvtnorm公司,树干规范，统计数据，图形，实用程序，马格里特,呜呜声、方法、，Rdpack公司,ggplot2
建议：	针织物,rmarkdown公司,R.rsp公司,gplots（gplots）,规模,环境统计,MASS（质量）,R彩色啤酒,字符串,重塑,翡翠色,g模型,色彩空间,奶牛场,gg排斥,数字播放器,对于猫,小型飞机,额外网格,读xl,千平方公里
出版：	2024-09-05
内政部：	10.32614/CRAN.包装.httk
作者：	约翰·万博[aut，cre]，莎拉·戴维森·弗里茨[aut]，罗伯特·皮尔斯[aut]，卡罗琳戒指[aut]，格雷格·本田[aut]，Mark Sfeir〔aut〕，马特·利纳基斯[aut]，达斯汀·卡普兰[aut]，内森·波莱斯【ctb】，Miyuki Breen公司【ctb】，香农·贝尔【ctb】，张晓庆【ctb】，托多尔·安东尼耶维奇【ctb】，吉梅娜·戴维斯，伊莱娜·凯尼恩【ctb】，凯蒂·保罗·弗里德曼【ctb】，梅雷迪思·谢勒【ctb】，詹姆斯·斯卢卡【ctb】，诺埃尔·辛斯基[ctb]，尼沙·西佩斯【ctb】，芭芭拉·维特莫尔【ctb】，莉莉·惠普尔，伍德罗·塞泽尔【ctb】
维护人员：	约翰·万博（John Wambaugh）
错误报告：	https://github.com/USEPA/CompTox-ExpoCast-httpk/问题
许可证：	GPL-3公司
版权：	该软件包主要由美国员工开发。联邦政府作为其官方职责的一部分因此是公共领域。
网址：	https://www.epa.gov/chemical-research/rapid-chemical-exposure-and-dose-research
需要编译：	对
引用：	httk引文信息
材料：	自述文件 新闻
CRAN检查：	httk结果

文档：

参考手册：	httk.pdf格式
渐晕图：	1） HTTK简介(来源,R代码) 2） IVIVE简介(来源,R代码) a） 皮尔斯（2017）：HTTK基础(来源,R代码) b） Ring（2017）HTTK-Pop:生成子种群(来源,R代码) c） Pearce（2017）：组织分区评估(来源,R代码) c） Frank（2018）：神经元网络IVIVE(来源,R代码) d） Wambaugh（2018）：评估体内外推论(来源,R代码) e） 本田（2019）：更新的Armitage等人（2014）模型(来源,R代码) f） Wambaugh（2019）：不确定性蒙特卡洛(来源,R代码) g） Linakis（2020）：高通量吸入模型(来源,R代码) h） Kapraun（2022）：人类妊娠模型(来源,R代码)

下载内容：

包源：	httk_2.4.0.tar.gz
Windows二进制文件：	r-devel公司：httk_2.4.0.zip，r版本：httk_2.4.0.zip，r-oldrel：httk_2.4.0.zip
macOS二进制文件：	r释放（arm64）：httk_2.4.0.tgz，r-oldrel（arm64）：httk_2.4.0.tgz，r-release（x86_64）：httk_2.4.0.tgz，r-oldrel（x86_64）：httk_2.4.0.tgz
旧来源：	httk存档

反向依赖关系：

反向建议：

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链接：

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