层次二部:基于二部图的层次聚类

基于二分图的层次聚类,用于药物基因组学数据集和共享相同数据结构的数据集。目标是基于两组变量之间的关联模式。在以下背景下药物基因组数据集,样本为细胞系变量通常是表达水平和药物敏感性值。对于这种方法,稀疏典型相关分析李·W、李·D、李·Y和帕维坦·Y(2011)<数字对象标识代码:10.2202/1544-6115.1638> 首先应用于提取每组样本的关联模式。然后,使用基于核规范的差异性度量来构建基于提取的关联的组间差异矩阵。最后,应用层次聚类。

版本: 0.0.2
进口: 平行,马格里特厄尔巴
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发布时间: 2021-02-16
内政部: 10.32614/CRAN.package.hier二部分
作者: Calvin Chi[aut、cre、cph],李宇珠[ctb],李东桓,李永雄[ctb],尤迪·帕维坦
维护人员: Calvin Chi<伯克利大学的Calvin.Chi>
许可证: 麻省理工学院+文件许可证
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材料: 自述文件
CRAN检查: 层次二分结果

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参考手册: hierBipartite.pdf
渐晕图: 层次二分渐晕

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