genieBPC：GENIE生物制药合作数据处理管道项目

美国协会研究（AACR）项目基因组证据肿瘤信息交换（GENIE）生物制药协作代表着多年的多机构努力以建立一个包含相关临床基因组数据的泛癌症存储库。基因组和临床数据以多个版本提供（单独每个癌症队列的发布以及数据修正后的更新），存储在数据共享平台上“Synapse”<https://www.synapse.org/>. “genieBPC”包提供了一种无缝的方式来获得“Synapse”中每个版本对应的数据，并准备用于分析的数据集。

版本：	2.0.1
取决于：	R（≥3.4）
进口：	克莱(≥ 2.5.0),数字播放器(≥ 1.0.6),dtplyr公司(≥ 1.1.0),高温气冷堆,jsonlite公司,呜呜声(≥ 0.3.4),爱尔兰航空公司(≥ 1.0.0),字符串(≥1.4.0),sunburstR太阳风暴,易怒的(≥ 3.1.2),第三年
建议：	冠状病毒(≥ 3.5.1),ggplot2(≥ 3.3.5),gt公司(≥ 0.3.0),全球技术法规摘要(≥ 1.5.2),针织物(≥ 1.33),马格里特(≥ 2.0.1),巧妙地(≥4.10.0),rmarkdown公司(≥ 2.8),测试那个(≥ 3.0.0),降价,拼写
出版：	2024-07-11
内政部：	10.32614/CRAN.包装.genieBPC
作者：	杰西卡·拉弗里[aut，cre]，迈克尔·A·库里[aut]，珊曼莎布朗[aut]，卡莉莎·怀廷[aut]，汉娜·福克斯[aut]，阿克塞尔·马丁，丹尼尔·斯霍贝格（Daniel D.Sjoberg）【ctb】
维护人员：	杰西卡·拉弗里（Jessica A.Lavery）<laveryj at mskcc.org>
错误报告：	https://github.com/GENIE-BPC/genieBPC/issues网站
许可证：	麻省理工学院+文件许可证
网址：	https://genieBPC.github.io/geneibPC/
需要编译：	不
语言：	英语-美国
材料：	自述 新闻
CRAN检查：	geniePC结果

文档：

参考手册：	genieBPC.pdf
渐晕图：	教程：GENIE BPC数据结构 教程：create_analytic_chort 教程：drug_regimen_sunburst 教程：pull_data_synapse 教程：select_unique_ngs

下载内容：

包源：	精灵BPC_2.0.1.tar.gz
Windows二进制文件：	r-devel公司：genieBPC_2.0.1.zip，r版本：genieBPC_2.0.1.zip，r-oldrel：genieBPC_2.0.1.zip
macOS二进制文件：	r释放（arm64）：genieBPC_2.0.1.tgz，r-oldrel（arm64）：天才PC_2.0.1.tgz，r-release（x86_64）：genieBPC_2.0.1.tgz，r-oldrel（x86_64）：genieBPC_2.0.1.tgz
旧来源：	genieBPC存档

链接：

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