fabisearch:高维时间序列网络中的变化点检测

实现因子化二进制搜索(FaBiSearch)方法,用于估计多元高维时间序列网络(或聚类)结构中多个变化点的数量和位置。该方法的动机是检测功能磁共振成像(fMRI)数据的功能连接网络中的变化点。FaBiSearch使用非负矩阵分解(NMF)、无监督降维技术和新的二进制搜索算法来识别多个变化点。它需要最少的假设。最后,我们以灵活、独立的功能提供交互式、三维、特定于大脑的网络可视化功能。此功能可以方便地与任何节点坐标图谱一起使用,如果适用,可以根据社区成员身份对节点进行颜色编码。输出是一个优雅的显示网络,覆盖在皮层表面上,可以在三维空间中旋转。该包的主要例程是detect.cps(),用于多个变化点检测,est.net(),用来估计平稳多元时间序列之间的网络,net.3dplot(),用以绘制估计的函数连通性网络,opt.rank(),来查找给定数据集NMF中的最佳秩。这些函数已经在模拟的多元高维时间序列数据和fMRI数据上进行了广泛测试。有关FaBiSearch方法的详细信息,请参见Ondrus等人(2021)<doi:10.48550/arXiv.2103.06347>. 有关fabisearch包的更详细解释和应用示例,请参阅Ondrus和Cribben(2022)预印本。

版本: 0.0.4.5
取决于: R(≥3.10),国家气象局
进口: rgl公司,重塑2,foreach公司,do并行,doRNG公司,并行
建议: 测试那个(≥ 3.0.0)
出版: 2023-01-12
内政部: 10.32614/CRAN.包装.制作
作者: 马丁·昂德鲁斯,Ivor Cribben[奥特]
维护人员: 马丁·昂德鲁斯(Martin Ondrus)
许可证: 麻省理工学院+文件许可证
网址: https://github.com/mondrus96/FaBiSearch网站
需要编译:
材料: 新闻
CRAN检查: fabisearch结果

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参考手册: 法比萨.pdf

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Windows二进制文件: r-devel公司:fabisearch_0.0.4.5.zip文件,r版本:fabisearch_0.0.4.5.zip文件,r-oldrel:fabisearch_0.0.4.5邮编
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旧来源: fabisearch档案

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