ecospat_1.1(2015年3月6日)===========修复*修复了内核“ecospat.grid.clim.dyn()”中的错误。*修复了“ecospat.boyce()”返回boyce索引值中的错误:Spearman系数是正确的。*修复了“ecospat.cons_Cscore()”p值更正中的错误。*修复了参数定义不完整的函数“ecospat.calculate.pd()”的手册。*物种列表的固定数据集,现在与树数据集中的物种相匹配。*修复了“ecospat.plot.messs()”函数的输出,现在可以给出单个图形作为结果。变化*删除了整个包的一些依赖项,并指明了要导入的包中的各个函数。ecospat_2.0(2016年5月26日)===========新功能*在函数“ecospat.licke.similarity.test()”中添加了一个新参数,以指示生态位是否是随机的。*添加了函数“ecospat.shift.centroids()”,以替换“ecospac.fun.arrows()”以更精确地了解函数的实用性。*添加了两个新数据集“ecospat.testNiche.nat”和“ecospac.testNiache.nat”,以更好地例证生态位量化分析。*添加了新函数“ecospat.ESM.Modeling()”,用于校准简单的双变量模型。*添加了新函数“ecospat.ESM.Projection()”,用于在new.env上投影简单的双变量模型。*添加了新功能“ecospat.ESM.EnsembleModeling()”,用于对简单的二元模型进行预测和平均。*添加了新功能“ecospat.ESM.EnsembleProjection()”,用于将校准的ESM投影到新的空间或时间。*添加了新函数“ecospat.SESAM.prr()”,用于使用“概率排名”规则预测社区组成。*增加了新函数“ecospat.cohen.kappa()”,用于计算cohen的kappa和方差估计。*增加了新函数“ecospat.max.kappa()”,用于计算Cohen’s kappa沿不同阈值的值。*添加了新函数“ecospat.max.tss()”,用于计算不同阈值下的tss值。*添加了新函数“ecospat.meva.table()”,用于计算模型的一系列不同评估指标的值。*添加了新函数“ecospat.plot.kappa()”,用于绘制Cohen的kappa值。*添加了新函数“ecospat.plot.tss()”,用于绘制tss的值。*添加了新函数“ecospat.mpa()”,用于计算最小预测面积。*添加了新函数“ecospat.cor.plot()”,用于绘制变量的相关性。*添加了函数“ecospat.CommityEval()”,以替换“ecospac.SSDMeval()”以更精确地了解函数的实用性。*增加了新函数“ecospat.adj.D2.glm()”,用于计算调整后的D2。*添加了新函数“ecospat.exdet()”,以评估投影范围和参考范围之间的气候类比。变化*更新了NAMESPACE文件、导入(“biomod2”)和依赖项。*已更新包的依赖项。删除了对包“gam”的依赖。删除了函数kasc2spixdf(“adehabitatMA”)的依赖。添加了包“gtools”。*删除了函数“ecosput.enice.similability.test()”和“ecosput.enice.equivalency.test()”的窗口进度指示器,并在函数的命令行中添加了进度条。*删除了函数“ecospat.cv.gam()”和函数“ecospat.cv.example()”中运行cv的选项。修复*更正了函数“ecospat.liche.dyn.index()”,交集值=0.1。ecospat_2.0.1(2016年6月9日)=============修复*在函数“ecospat.licke.similarity.test()”的描述部分中添加了文档文件的详细信息。*修复了包描述(*集合)中的拼写错误。*修复了使用光栅文件作为输入时ESM函数“ecospat.ESM.Modeling()”、“ecospac.ESM.EnsembleModeling()”和“ecospa.ESM.EnsembleProjection()”中的错误。*更正了函数“ecospat.plot.liche.dyn()”的参数“quant”的定义。*更新了函数“ecospat.grid.clim.dyn()”及其参数“th.sp”和“th.env”的定义。还更新了其详细信息。ecospat_2.1.0(2016年9月23日)=============修复*修正了函数“ecosput.cv.rf()”、“ecosput.bbinary.model()”、“ecosput.boyce()”、“ecosput.caleval()”、“ecosput.CommunityEval()”、“ecosput.cons_Cscore()”、“ecosput.cooccurrences()”、“ecosput.cv.gbm()”、“ecosput.cv.glm()”、“ecosput.cv.me()”、“ecosput.ESM.EnsmbleModeling()”中TRUE/FALSE变量的定义,“ecospat.ESM.EnsembleProject()”、“ecospac.ESM.Modeling()”,“ecospan.ESM.Projection()”和“ecospa.exdet()”。*删除了函数“ecospat.occ.desagregation()”和“ecospac.sample.envar()”的窗口进度指示器。新功能*添加了用于重新分类网格文件的新函数“ecospat.rcls.grd()”。*添加了新函数“ecospat.recstrat_regl()”,以随机抽取等量的常规数样本。*添加了新函数“ecospat.recstrat_prop()”,以随机抽取等量的比例数样本。*添加了新函数“ecospat.Cscore()”,以测试存在-缺失矩阵中物种共存的非随机模式。*在函数“ecospat.like.similarity.test()”中添加了一个新参数,以测试利基保守主义或分歧。*在函数“ecospat.liche.equivalency.test()”中添加了一个新参数,以测试利基保守性或差异性。ecospat_2.1.1(2016年11月2日)=============修复*修复了R/ecospat文件中TRUE/FALSE变量的定义。环境与社会管理。R、 R/ecospat取样。R和R/ecospat.occprep。R。ecospat_2.2.0(2017年11月8日)=============新功能*增加了新功能“ecospat.rangesize”,以使用IUCN标准估计物种的范围大小。*添加了新函数“ecospat.occupted.patch()”以确定物种的占用斑块。*添加了新函数“ecospat.mdr()”以实现最低成本的树木分析。*添加了新的数据集“ecospat.testMrd.nat”,以举例说明最低成本树形分析。变化*将函数“ecospat.exdet()”重命名为“ecospac.climan()”。修复*更新了函数“ecospat.occ.desaggregation()”、“ecospac.binary.model()”和“ecospan.boyce()”。*修复了“ecospat.grid.clim.dyn()”中的错误,该错误将网格分布从观察点偏移一个像素。ecospat_3.0(2018年6月19日)=============新功能*增加了新功能“ecospat.giche.zProjGeo”和“ecospac.giche.dynIndexProjGeo”,以将生态位量化(用ecospat.rigid.clim.dyn计算)投影到地理空间中*添加了一个新的数据集ecospat.testEnv,包括一个由5个地形气候光栅组成的tif堆栈,分辨率为250米,适用于瑞士阿尔卑斯山西部*添加了新功能“ecospat.CCV.modeling”、“ecospac.CCV.createDataSplitTable”、“ecospat.CDV.communityEvaluation.bin”和“ecospan.CCV.community Evaluation.prob”,以执行社区交叉验证(CCV),如Scherrer等人2018所示。#添加了一个新函数“ecospat.ESM.VarContrib”,以计算ESM模型中每个变量和方法的变量贡献变化*从转移的包裹的维护valeriadicola@gmail.comolivier.broennimann@unil.ch修复*修复了“ecospat.ESM.R”、“ecospac.ESM.Projection.Rd”、“ecospat.ESM.EnsembleModeling.Rd“和”ecospat.ESM.Ensemble Projection.Rd“中的几个错误*修复了“ecospat.mess”中包含x和y坐标作为环境因素的错误ecospat3.1(2020年3月3日)=============新功能*增加了新功能“ecospat.ESM.responsePlot”,为小型模型集成(ESM)创建响应图(评估条)。*添加了新功能“ecosput.ESM.threshold”来评估用于投影的完整模型,并提供生成二进制映射的阈值。变化*ecospat.migclim函数和对migclim包的依赖性已被删除修复*修复了“ecospat.CCV.communityEvaluation.prob”和“ecospac.ESM.Modeling()”中的几个错误ecospat3.2(2021年2月11日)=============修复*修复了“ecospat.mpa”中的错误*修复了“ecospat.cv.glm”和“ecospac.permut.glm”示例中的错误*修复了在1行数据帧上使用order()的实例*在“ecospat.grid.clim.dyn”中添加了新的参数“kernel.method”,允许从包ks中选择内核密度估计作为包adehabitat的替代方案*在“ecospat.grid.clim.dyn”中添加了新的参数“extend.expect”,允许修改环境空间的范围,使其超出研究区域中存在的最小和最大环境值*添加了一个内部函数“ecospat.kd”,以简化函数“ecospat.grid.clim.dyn”的编码*添加了新函数“ecospat.marigin”,以基于自举核密度估计估计二维环境空间中分布的边缘*通过将包spatstat中的nndist替换为包nabor中的knn,调整了函数“ecospat.makeDataFrame”和ecospat.occ.desagregation”。ecospat_3.2.1(2022年1月1日)=============新功能*增加了新函数“ecospat.nichePOSNB”,以根据丰度数据计算分类群沿环境轴线的生态位宽度和生态位位置*增加了生态位动态指数测试(扩展、稳定性、未填充),参数更改为“ecospat.niche.dyn.index”、“ecospac.niche.equivalency.test”、“ecospat.tiche.similarity.test”和“ecostat.plot.overlapps.test”变化*更改了“ecospat.boyce”,以允许选择相关方法(最初仅为“spearman”),并允许包含或排除连续重复的市盈率(包括在Hirzel等人2006中)。*将“ecospat.ESM.VarContrib”更改为重新缩放贡献率,使中性贡献等于1。修复*修复了“ecospat.caleval”中的“as.vector”错误*修复“ecospat.grid.clim.dyn”和“ecospac.plot.liche.dyn”中颜色透明度的错误ecospat_3.2.2(2022年2月15日)=============新功能*增加了新功能“ecospat.ESM.EnsembleEvaluation”,用于根据池程序评估ESM,以减少评估数据集中的少量事件变化*从ecospat.nicePOSNB中删除了跨环境轴的加权平均生态位宽度(NB)的计算。创建了一个ecospat.nichNBmean函数来执行此计算,可以使用权重向量(例如,如果您希望NB按PCA轴的惯性加权,则该函数很有用)修复*修复ecospat.nichePOSNB帮助文件中的错误*修复从包映射导入的命名空间*修复仅使用一种建模技术时ESM函数的错误ecospat_3.3(02.06.2022)=============修复*为ecospat添加了缺失的导出。环境与社会管理。集成评估*重塑的导出和命名空间ecospat_3.3.1(2022年7月7日)=============新功能*添加了新的功能“ecosput.poolingEvaluation”,用于使用Collart等人2021中的池化程序评估物种分布模型修复*修复ecospat中的错误。集成评估ecospat_3.4(2022年11月4日)=============变化*为ecospat中的每种建模技术添加了颜色和图例。ESM.响应图*适应ESM和CCV功能,与biomod2>v4兼容ecospat_3.4.1(2022年12月5日)=============修复*校正ecospat.meva.table,使假阳性率和假阴性率不会与正预测力和负预测力反向*将ecospat.meva.table的输出更改为data.frame,而不是矩阵,以避免字符值*在ecospat.meva.table中添加了SEDI和ORSS指标ecospat_3.5(2023年1月30日)=============修复*rpatin提供的biomod2 v4.2-2的各种兼容性修复ecospat_3.5.1(2023年2月23日)=============修复*biomod2 v4.2-2与ESM功能的进一步兼容性修复ecospat_4.0.0(2023年10月16日)=============变化*已删除对包maptools、rgdal和rgeos的所有依赖项*光栅包的所有依赖项都已替换为terra修复*biomod2 v4.2-3与ESM功能的兼容性修复*修复ecospat中的错误。艾司美。建模和生态保护。艾司美。投影ecospat_4.1.0(2024年2月25日)=============新功能*ecospat.niche.dyn.index现在允许评估放弃和开拓生态位*ecospat.plot.niche.dyn现在允许绘制放弃和开拓生态位修复*矢量化的ecospat。SESAM.prr可减少使用大型数据集的计算时间*biomod2 v4.2-5与ESM和CCV功能的兼容性修复*修复ecospat中的错误。环境与社会管理。建模,ecospat。环境与社会管理。投影,ecosput。ESM.集成建模和生态计算。ESM.集成项目*修正了ecospat.cor.plot,它现在为每个预测值创建直方图,并提供真实的相关值而不是绝对值*更正了R参数硬编码的ecospat.kd*修正的ecospat.max.tss,当观测值(0/1)具有相同的概率时,现在返回0。ecospat_4.1.1(02.07.2024)=============修复*删除ESM、CCV和共现功能在磁盘上创建的文件