同义词突变和选择系数的估计基于核糖体间接成本(ROC)模型的密码子偏向用法。多项式logistic回归和马尔可夫链蒙特卡罗用于估计和预测有/无蛋白质产生率表达式和测量误差。工作流及其示例还提供了模拟、估计和预测过程并行化加速。整个框架用Yassour等人(2009)的酵母基因组和基因表达数据<doi:10.1073/pnas.0812841106>.
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