crso:癌症规则集优化('crso')

识别癌症中候选驱动因素组合的算法。CRSO公司基于癌症的理论模型,其中癌症规则定义为最小的两个或多个事件(即变更)的集合足以导致癌症。癌症规则集是一组癌症规则的集合被认为是导致人群癌症的所有途径。在CRSO中,每事件明确指定为每个患者中的乘客或驾驶员。每个事件都与特定患者、特定事件的乘客处罚相关,反映事件发生的可能性有多大,例如作为乘客。CRSO通过将所有样本分配给规则集中的规则来评估每个规则集,或为null规则,然后从所有未分配事件。CRSO使用一个三阶段过程来查找K范围内的固定大小K。然后从中确定核心规则集大小为K的最佳规则集作为最佳平衡规则集大小和统计惩罚。用户应该查阅“crso”小插曲,以获取完整的crso运行的示例演练。CRSO算法的完整描述如下:Klein MI、Cannataro V、Townsend J、Stern DF和Zhao H。“识别单个患者的癌症驱动因素组合。”BioRxiv 674234[预印本]。2019年6月19日<数字对象标识代码:10.1101/674234>.如果你使用“crso”,请引用这篇文章。

版本: 0.1.1
取决于: R(≥3.5.0),foreach公司
进口: 统计,实用程序
建议: 针织物,rmarkdown公司
出版: 2019-07-07
内政部: 10.32614/CRAN.包装.crso
作者: 迈克尔·克莱因
维护人员: 迈克尔·克莱恩(Michael Klein)
许可证: GPL-2型
需要编译:
CRAN检查: crso结果

文档:

参考手册: crso.pdf公司
渐晕图: CRSO-点火器

下载内容:

包源: crso_0.1.1.tar.gz号
Windows二进制文件: r-devel公司:crso_0.1.1.zip码,r版本:硫酸根0.1.1.zip,r-oldrel:crso_0.1.1.zip码
macOS二进制文件: r释放(arm64):crso_0.1.1.tgz,r-oldrel(arm64):crso_0.1.1.tgz,r-版本(x86_64):crso_0.1.1.tgz,r-oldrel(x86_64):crso_0.1.1.tgz

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