复制分隔符1.2.0
- sepassem现在可以处理工作中放置的多个输入文件一个接一个的文件夹。
- 为sep_assem添加了一个新参数“core_number”。现在可以运行了使用多个CPU内核,运行速度会更快。
复制分隔符1.1.0
- 为copy_separate添加了一个新参数“rare_read”。期间集群分析,读取次数小于此值的集群将被忽略。默认值10。
- 如果copy_separate发现的簇数超过copy_number,则此该版本将保留所有主要集群(具有reads>raverread的集群)。在上一个版本中,copy_separate选择最大值的copy_number集群。
- 有时,由于在区域。现在将跳过这些子集,并对子集进行编号不会受到影响。还对copy_assemble进行了更改适应这种变化。
- 当copy_number为2或3时,copy_assemble将标识2或3为那些copyseparate保留的子集创建的最不同的集群>集群的copy_number。当拷贝数>3时,copy_assemble将仍然选择最大集群的copynumber。
- 将重新排序copy_assemble的输入文件,以确保顺序是正确的(以防万一编辑它)。
- 如果序列包含太多歧义,则删除序列的末尾部分网站,否则会影响复制_程序集。
- 组装的最终基因拷贝序列中的共享缺口将是远离的。
- 添加了新的函数sep_assem,它是copy_seperate和copy_assemble。现在你可以拿到组装好的决赛了只需运行sepassem即可复制基因序列。只有当结果是不满意,您可以回来进行必要的更改并运行再次copy_assemble。
- 输入文件和所有生成的文件现在都将放在一个结果文件夹。当您在循环中一个接一个地运行多个文件时,结果不会一团糟。
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