chicane:Capture Hi-C分析引擎
用于处理和调用捕获Hi-C数据中的交互的工具包。将BAM文件转换为链接限制片段的读取数,并识别出交互次数超过预期的成对片段。通过比较观察到的读取计数与计数回归模型中的预期背景速率,可以确定显著的交互作用。
版本: |
0.1.8 |
取决于: |
R(≥3.5.0),gamlss.tr公司,形状的广义可加模型,数据表 |
进口: |
MASS(质量),统计,foreach公司,do并行,迭代器,床,针织物,市场营销 |
建议: |
测试那个,基因组相互作用,基因组范围,Gviz公司,国家 |
发布时间: |
2021-11-06 |
内政部: |
10.32614/CRAN.包装.智利 |
作者: |
埃尔·霍尔格森[aut],奥利维娅·莱维〔aut〕,奥利维娅·弗莱彻,弗兰克·杜德布里奇,赛义德·海德尔 |
维护人员: |
赛义德·海德尔。海德尔在icr.ac.uk> |
许可证: |
GPL-2型 |
需要编译: |
不 |
系统要求: |
床上工具 |
其他存储(_R): |
http://R-Forge.R-project.org/ |
材料: |
新闻 |
CRAN检查: |
芝加哥结果 |
文件:
下载内容:
链接:
请使用规范形式https://CRAN.R-project.org/package=芝加哥链接到此页面。