cbioportalR：从cBioPortal浏览和查询临床和基因组数据

通过用户友好的方式，为R用户提供从“cBioPortal”网络资源直接访问基因组和临床数据的权限包装“cBioPortal”现有API端点的函数<https://www.cbioportal.org/api/swagger-ui/index.html>. 用户可以浏览和查询基因突变数据，拷贝数改变和融合，以及肿瘤突变负荷（'TMB'）数据，微卫星不稳定状态（“MSI”）、“FACETS”和选择临床数据点（取决于研究）。请参见<https://www.cbioportal.org/>和Gao等人（2013）<doi:10.1212/顺信号2004088>有关cBioPortal web资源的更多信息。

版本：	1.1.0
取决于：	R（≥2.10）
进口：	高温气冷堆(≥ 1.4.3),易怒的(≥ 3.1.7),呜呜声(≥ 0.3.4),马格里特(≥ 2.0.3),拉朗(≥ 1.0.3),胶(≥ 1.6.2),jsonlite公司(≥1.8.0),第三年(≥ 1.2.0),数字播放器(≥ 1.0.9),字符串(≥ 1.4.0),气候变化指数(≥ 3.3.0)
建议：	测试那个(≥ 3.1.4),针织物(≥ 1.39),rmarkdown公司(≥ 2.14),覆盖（covr）(≥ 3.5.1),拼写(≥ 2.2)
出版：	2023-10-05
内政部：	10.32614/CRAN.包装.生物门户R
作者：	卡莉莎·怀廷[aut，cre]
维护人员：	卡莉莎·怀廷（Karissa Whiting）
错误报告：	https://github.com/karissawhiting/cbioportalR/issues
许可证：	麻省理工学院+文件许可证
网址：	https://github.com/karissawiting/cbioportalR,https://www.karissawhiting.com/cbioportalR/
需要编译：	不
语言：	英语-美国
材料：	自述 新闻
在视图中：	组学
CRAN检查：	cbioportalR结果 [问题需要在2024-10-04年之前解决]

文档：

参考手册：	cbioportalR.pdf格式
渐晕图：	内部结构和指导原则 数据检索工作流概述

下载内容：

包源：	cbioportalR_1.1.0.tar.gz公司
Windows二进制文件：	r-devel公司：cbioportalR_1.1.0.zip文件，r版本：cbioportalR_1.1.0.zip文件，r-oldrel：cbioportalR_1.1.0.zip文件
macOS二进制文件：	r释放（arm64）：cbioportalR_1.1.0.tgz，r-oldrel（arm64）：cbioportalR_1.1.0.tgz，r-release（x86_64）：cbioportalR_1.1.0.tgz，r-oldrel（x86_64）：cbioportalR_1.1.0.tgz
旧来源：	cbioportalR存档

链接：

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