富迪

阿拉卡扎姆是Immcantation公司分析适应性免疫受体序列(AIRR-seq)框架并提供了一套工具来研究淋巴细胞受体克隆血统、多样性、基因使用和其他储备级属性,重点是高通量免疫球蛋白(Ig)测序。

阿拉卡扎姆有五个主要目的:

  1. 为中的其他R包提供核心功能这包括常见的任务,例如文件I/O,基本DNA序列操作,与V(D)J片段和基因注释。
  2. 提供一个R接口,用于与急板地变更-O工具套件。
  3. 对淋巴细胞进行克隆丰度和多样性分析剧目。
  4. 对Ig克隆种群进行谱系重建序列和分析结果谱系的拓扑树。
  5. 进行淋巴细胞受体的理化性质分析序列。

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