SparseMDC:SparseMDC算法的实现

实现中描述的算法Barron,M.和Li,J.(尚未出版)。此算法群集来自多个有序总体的样本,跨确定这些变化的标记基因。包裹是专为scRNA-Seq数据设计,但也适用于许多其他数据类型,只是用样本代替细胞,用变量代替基因。这个包还包含估计SparseMDC参数的函数如本文所述。我们建议用户进一步选择他们的利用聚类中心的大小标记基因。

版本: 0.99.5
取决于: R(≥3.1.0),doRNG公司
进口: 统计数据,foreach公司,平行,do并行
建议: 针织物,rmarkdown公司
出版: 2018-08-02
内政部: 10.32614/CRAN.包装。备用MDC
作者: 马丁·巴隆,李军[aut,cre]
维护人员: 李军<Jun.Li at nd.edu>
许可证: GPL-3公司
需要编译:
CRAN检查: SparseMDC结果

文档:

参考手册: 备用MDC.pdf
渐晕图: 稀疏MDC

下载内容:

包源: 备用MDC_0.99.5.tar.gz
Windows二进制文件: r-devel公司:备用MDC_0.99.5.zip,r版本:备用MDC_0.99.5.zip,r-oldrel:备用MDC_0.99.5.zip
macOS二进制文件: r释放(arm64):备用MDC_0.99.5.tgz,r-oldrel(arm64):备用MDC_0.99.5.tgz,r-版本(x86_64):备用MDC_0.99.5.tgz,r-oldrel(x86_64):备用MDC_0.99.5.tgz

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